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上海翻譯公司完成軟件“試驗(yàn)控制”英中翻譯

發(fā)布時(shí)間:2020-02-25 10:02  點(diǎn)擊:

上海翻譯公司完成軟件“試驗(yàn)控制”英中翻譯
第7章
 試驗(yàn)控制
 
7.1 “試驗(yàn)控制”介紹 158
“試驗(yàn)控制”和“試驗(yàn)控制”屏幕介紹。
7.2 “試驗(yàn)控制”屏幕 163
7.3 試驗(yàn)控制編程 171
使用條件和動(dòng)作的自動(dòng)試驗(yàn)控制編程基礎(chǔ)。
7.4 “開始-停止”試驗(yàn)規(guī)則 185
7.5 “試驗(yàn)控制”數(shù)據(jù)分析 193
為了執(zhí)行分析,例如:跟蹤開始時(shí)間至動(dòng)物進(jìn)入一個(gè)特定區(qū)域時(shí)的時(shí)間。
本節(jié)僅描述EthoVision XT Base版本的試驗(yàn)控制功能。如需了解條件、創(chuàng)建子規(guī)則和控制硬件設(shè)備的詳細(xì)概述,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)和硬件控制手冊(cè)(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
7.1 “試驗(yàn)控制”介紹
為什么使用試驗(yàn)控制?
 
 
試驗(yàn)控制允許您自動(dòng)化您的試驗(yàn)。例如:
您需要給試驗(yàn)設(shè)定一個(gè)最長(zhǎng)持續(xù)時(shí)間。
 
您需要自動(dòng)開始和/或停止數(shù)據(jù)采集。一些示例如下:
- 當(dāng)首次在開放場(chǎng)地內(nèi)檢測(cè)到老鼠時(shí),開始記錄。
 
 
→請(qǐng)參閱第182頁(yè)
 
- 當(dāng)老鼠到達(dá)Morris水迷宮中平臺(tái)時(shí),停止記錄。
- 在12:30:00準(zhǔn)點(diǎn)開始記錄。
- 在動(dòng)物已經(jīng)在十字迷宮的封閉臂中停留5分鐘之后,停止記錄。
 
為了使用試驗(yàn)控制:
1. 打開“試驗(yàn)控制”屏幕(請(qǐng)參閱第163頁(yè))。
 
→請(qǐng)參閱第185頁(yè)
 
2. 定義條件,當(dāng)試驗(yàn)期間滿足該條件時(shí)將觸發(fā)特定動(dòng)作。在一個(gè)序列中組織條件和動(dòng)作(請(qǐng)參閱171頁(yè))。
3. 在開始數(shù)據(jù)采集之前,請(qǐng)確保這些試驗(yàn)控制設(shè)置已激活。另請(qǐng)參閱第663頁(yè)上關(guān)于試驗(yàn)控制設(shè)置的管理指示。
 
您的EthoVision XT許可證和試驗(yàn)控制
您的EthoVision XT許可證決定您可以使用的試驗(yàn)控制類型。
EthoVision XT Base許可證 - 您可以定義一個(gè)規(guī)則以開始和停止數(shù)據(jù)記錄(開始-停止試驗(yàn)規(guī)則,請(qǐng)參閱第185頁(yè))。您無(wú)法控制硬件設(shè)備。
EthoVision XT Base+試驗(yàn)和硬件控制模塊 - 您可以定義一個(gè)開始/停止試驗(yàn)規(guī)則以及子規(guī)則。此外,您可以控制硬件設(shè)備。為了在使用試驗(yàn)和硬件控制模塊進(jìn)行的試驗(yàn)中采集數(shù)據(jù),您必須擁有一個(gè)硬件秘鑰,該秘鑰用于啟用插入電腦中的試驗(yàn)與硬件控制模塊。
 
EthoVision試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(位于您的安裝安裝上)包含試驗(yàn)與硬件控制模塊可用功能的廣泛信息。
 
條件和動(dòng)作
“Condition”(條件)即指EthoVision的判定表述。“Action”(動(dòng)作)即指一個(gè)命令,該命令在一變量或硬件設(shè)備上執(zhí)行。因此,您可以通過(guò)鏈接條件與動(dòng)作而控制您的試驗(yàn)。
例如:在Morris水迷宮試驗(yàn)中,當(dāng)在平臺(tái)上檢測(cè)到老鼠時(shí),停止跟蹤(但該平臺(tái)應(yīng)已定義為一個(gè)區(qū)域)。
該動(dòng)作為“Stop tracking”(停止跟蹤),而條件為“Rat detected on the platform”(在平臺(tái)上檢測(cè)到老鼠)。
您可以在圖表中定義條件以及鏈接條件與動(dòng)作。上面示例可以由下面內(nèi)容表示:
 
圖7.1 - 一個(gè)條件后緊跟一個(gè)動(dòng)作。該條件檢查該動(dòng)物是否處于稱為“平臺(tái)”的區(qū)域內(nèi)。當(dāng)滿足該條件時(shí),將執(zhí)行動(dòng)作“停止跟蹤”。
開始-停止試驗(yàn)規(guī)則
將按照一個(gè)邏輯順序(稱為“開始-停止試驗(yàn)規(guī)則”)組織條件和動(dòng)作。該規(guī)則可以看作用于開始和停止數(shù)據(jù)記錄的一組指令。
如需了解開始-停止試驗(yàn)規(guī)則相關(guān)詳細(xì)信息,請(qǐng)參閱第185頁(yè)。
“試驗(yàn)控制”功能還允許您分析試驗(yàn)期間發(fā)生的事件或兩個(gè)特殊事件之間的時(shí)間。例如:條件A激活開始時(shí)間至動(dòng)作X執(zhí)行之間的時(shí)間。如需了解詳細(xì)規(guī)程,請(qǐng)參閱第193頁(yè)。
 
 
通過(guò)使用試驗(yàn)與硬件控制添加功能,您還可以定義子程序(稱為“子規(guī)則”)。該子規(guī)則用于執(zhí)行特定動(dòng)作。它們可以在特定時(shí)間點(diǎn)開始,并根據(jù)用戶指定的條件重復(fù)進(jìn)行。如需了解更多信息,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(本手冊(cè)位于EthoVision XT安裝DVD上)。
 
如何執(zhí)行試驗(yàn)控制指令?
從您開始一次試驗(yàn)至試驗(yàn)停止期間,將執(zhí)行Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置)中所包含的指令。僅執(zhí)行Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置)中目前激活的指令(即Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中藍(lán)色突出顯示的指令)
該程序在每次采樣時(shí)間點(diǎn)設(shè)定試驗(yàn)控制序列。這種情形發(fā)生的速度取決于您所選擇的采樣頻率,而非視頻幀率。
該程序會(huì)記住先前采樣中已設(shè)定(激活)的試驗(yàn)控制對(duì)話框。根據(jù)該對(duì)話框類型:
對(duì)于一個(gè)“條件”對(duì)話框 - EthoVision XT檢查是否滿足條件。如果未滿足,條件為假值。該程序?qū)⒌却钡綕M足條件。當(dāng)條件滿足時(shí)(條件變成真值,參閱圖7.2中3)時(shí),該程序?qū)凑招蛄袀鬟f控制到下一個(gè)對(duì)話框。然后條件變?yōu)槭Щ睿ㄕ?qǐng)參閱圖7.2中4)。
對(duì)于一個(gè)“動(dòng)作”對(duì)話框 - EthoVision XT執(zhí)行該動(dòng)作(請(qǐng)參閱圖7.2中4),將控制傳遞給下一個(gè)對(duì)話框,使其變?yōu)榧せ�。然后�?ldquo;動(dòng)作”對(duì)話框變?yōu)槭Щ睿▍㈤唸D7.2中5)。
如需了解子規(guī)則及其參考,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)。
當(dāng)一個(gè)對(duì)話框激活時(shí),前一個(gè)對(duì)話框?qū)⑹Щ睢?/div>
在同一時(shí)間點(diǎn),按照未指定的順序評(píng)定使用運(yùn)算符并行組合的對(duì)話框(參閱第178頁(yè))。這意味著,無(wú)法確定首先評(píng)定哪個(gè)條件/采取哪個(gè)行動(dòng)。
立即執(zhí)行“試驗(yàn)控制”變量相關(guān)動(dòng)作。當(dāng)采樣時(shí)間點(diǎn)應(yīng)評(píng)定的所有對(duì)話框均已獲得評(píng)定時(shí),在硬件設(shè)備上執(zhí)行動(dòng)作。
如果正評(píng)定的對(duì)話框包含一個(gè)即將為“真值”的條件,該程序?qū)鬟f控制給下一個(gè)對(duì)話框。因此,在一個(gè)采樣時(shí)間內(nèi),該程序可以向右將控制傳遞給兩個(gè)或更多對(duì)話框。
當(dāng)您停止試驗(yàn)或達(dá)到最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間時(shí),所有試驗(yàn)控制對(duì)話框?qū)⑼S谩?/div>
當(dāng)開始/停止試驗(yàn)規(guī)則的“規(guī)則結(jié)束”對(duì)話框已獲得判定時(shí),停止數(shù)據(jù)記錄。從那一刻開始,“試驗(yàn)控制”將禁用,即使此期間子規(guī)則正運(yùn)行。
 
圖7.2 - 如何執(zhí)行試驗(yàn)控制指令的示意圖。該示意圖顯示一個(gè)開始-停止試驗(yàn)規(guī)則(參見(jiàn)第185頁(yè))的示例。
1- 跟蹤開始,手動(dòng)或者因?yàn)橐粋(gè)先前條件已獲得滿足。
2- 控制傳遞到一個(gè)已激活的“條件”對(duì)話框(例如:“老鼠是否在掩蔽物頂部上?”。評(píng)定條件。由于條件并未立即獲得滿足,因此變成“假值”。3 - 條件獲得滿足。
4- 控制傳遞到下一個(gè)對(duì)話框。在這種情形下,構(gòu)成一個(gè)“動(dòng)作”。立即執(zhí)行動(dòng)作。
5- “動(dòng)作”對(duì)話框變?yōu)槭Щ�,并且下一個(gè)對(duì)話框激活。
為清楚起見(jiàn),已獨(dú)到放置第3步和第4步。在現(xiàn)實(shí)中,當(dāng)滿足條件時(shí),同時(shí)變?yōu)槭Щ�,以及控制傳遞下一個(gè)對(duì)話框。
陰影輪廓 - 條件對(duì)話框激活。
深色輪廓 - 條件為真或采取動(dòng)作。灰白輪廓 - 對(duì)話框變?yōu)槭Щ?/div>
 
 
多個(gè)活動(dòng)場(chǎng)中試驗(yàn)控制
如果您的試驗(yàn)設(shè)置包含兩個(gè)或多個(gè)活動(dòng)場(chǎng),試驗(yàn)控制將分別應(yīng)用于每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)。這意味著,如果一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)一個(gè)條件獲得滿足,EthoVision XT將在該活動(dòng)場(chǎng)(非其他活動(dòng)場(chǎng))內(nèi)采取相應(yīng)動(dòng)作。
在下面示例中,設(shè)置包括四個(gè)籠子,每個(gè)籠子定義為一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)。區(qū)域條件內(nèi)的一次試驗(yàn)控制(參閱第173頁(yè))已定義,確保該活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)首次檢測(cè)到動(dòng)物時(shí)開始跟蹤。當(dāng)您第一次把一只動(dòng)物放到活動(dòng)場(chǎng)2時(shí),該活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)條件獲得滿足,并開始該活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)跟蹤。當(dāng)您放置第二只動(dòng)物到活動(dòng)場(chǎng)4內(nèi)時(shí),2秒后,該區(qū)域內(nèi)跟蹤開始(比活動(dòng)場(chǎng)2內(nèi)跟蹤開始晚2秒),請(qǐng)參閱圖7.3。
 
 
多活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)試驗(yàn)控制的優(yōu)勢(shì):您可以每次把一只動(dòng)物放入活動(dòng)場(chǎng)中,并且EthoVision XT將在適當(dāng)時(shí)候在各活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)開始跟蹤。
如果您的設(shè)置包括多個(gè)活動(dòng)場(chǎng),那么您不能針對(duì)某一活動(dòng)場(chǎng)定義一個(gè)條件/動(dòng)作。這意味著,一個(gè)條件所對(duì)應(yīng)的區(qū)域應(yīng)存在于所有活動(dòng)場(chǎng)中,并具有相同名稱。
如果一個(gè)區(qū)域未出現(xiàn)在一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)中,并且一個(gè)條件基于該區(qū)域,那么試驗(yàn)控制不能應(yīng)用到該活動(dòng)場(chǎng)。因此,除非您設(shè)置最大測(cè)試持續(xù)時(shí)間或跟蹤到達(dá)視頻結(jié)束,否則,跟蹤不會(huì)停止。
在任何采樣時(shí)間點(diǎn),試驗(yàn)控制對(duì)各個(gè)活動(dòng)場(chǎng)執(zhí)行指令。然而,在特定采樣時(shí)間點(diǎn),您不能按照活動(dòng)場(chǎng)用判定順序進(jìn)行判定。
圖7.3 - 多活動(dòng)場(chǎng)中試驗(yàn)控制。監(jiān)視器上所顯示的時(shí)間值為特定活動(dòng)場(chǎng)中從跟蹤開始已經(jīng)過(guò)去的時(shí)間�;顒�(dòng)場(chǎng)2中跟蹤開始早于活動(dòng)場(chǎng)4中跟蹤開始(參閱文本),因此,在任何時(shí)候,活動(dòng)場(chǎng)2中所用的時(shí)間(跟蹤持續(xù)時(shí)間)更長(zhǎng)(相對(duì)于活動(dòng)場(chǎng)4)。
 
7.2 “試驗(yàn)控制”屏幕
 
為了訪問(wèn)Trial Control(控制)屏幕,請(qǐng)點(diǎn)擊Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中的Trial Control(控制) Settings 1,或者從Setup菜單中選擇Trial Control(控制) Settings,然后點(diǎn)擊Open,并選擇Trial Control(控制) Settings 1,最后點(diǎn)擊OK。出現(xiàn)Trial Control(控制)屏幕,其中顯示默認(rèn)的試驗(yàn)控制設(shè)置。
為了訪問(wèn)試驗(yàn)控制屏幕,您還可以創(chuàng)建一個(gè)新的“試驗(yàn)控制設(shè)置”,或打開Trial Control(控制) Settings 1(試驗(yàn)控制設(shè)置1)之外的另一個(gè)控制設(shè)置(參閱第663頁(yè))。
Components窗口,其中列出動(dòng)作可依據(jù)的條件以及可用于組合條件的操作符。請(qǐng)參閱下頁(yè)。
Trial Control(控制) Settings窗口,顯示激活的試驗(yàn)控制設(shè)置。該窗口包括一系列由箭頭相連的對(duì)話框。參見(jiàn)第166頁(yè)。
最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間窗口允許您定義最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間。參見(jiàn)第171頁(yè)。
 
 
 
 
圖7.4 - Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置)屏幕。A – Components(組件)面板。B - Maximum Trial duration(最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間)窗口。
C - Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置)窗口。
 
您可以通過(guò)下面動(dòng)作顯示/隱藏Components(組件)面板和Maximum trial duration(最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間)窗口:點(diǎn)擊組件工具欄上的“Show/Hide(顯示/隱藏)”(顯示/隱藏)按鈕,并選擇/取消選擇該菜單中的相應(yīng)選項(xiàng)。
 
 
 
Components(組件)面板
 
如果您看不到Components(組件)面板,請(qǐng)點(diǎn)擊組件工具欄上的“Show/Hide(顯示/隱藏)”(顯示/隱藏)按鈕,并選擇Components(組件)。
 
 
 
 
圖7.5 - 試驗(yàn)控制用Components(組件)面板。
 
通過(guò)Components窗口(參閱圖7.5),您可以選擇建立您的試驗(yàn)控制規(guī)則的數(shù)據(jù)塊。并非下面列出的所有組件均可以在您的屏幕上得到,這取決于您的電腦上擁有哪類EthoVision XT許可證。
 
結(jié)構(gòu)
- Sub-rule – 為了定義一個(gè)子程序,可以從試驗(yàn)控制序列的特定點(diǎn)調(diào)用該子程序。
Reference – 為了在指令序列內(nèi)插入一個(gè)調(diào)用指令到子規(guī)則。
- Operator – 為了合并兩個(gè)或多個(gè)條件,以便在“所有”、“任何”或“全部無(wú)”條件獲得滿足時(shí)執(zhí)行一個(gè)動(dòng)作。參見(jiàn)第178頁(yè)。
Conditions(參閱第172頁(yè)):
- Time – 為了定義一個(gè)基于時(shí)間的條件。
- Time interval – 為了定義一個(gè)基于時(shí)間間隔的條件。
- Trial Control(控制) variable – 為了定義一個(gè)基于試驗(yàn)控制變量的條件。
- Dependent variables – 為了定義一個(gè)基于描述動(dòng)物行為的變量的條件,例如:速度、存在于一個(gè)區(qū)域中、運(yùn)動(dòng)等。
在因變量下,您可以查看可用變量列表。
- Hardware – 為了定義一個(gè)基于硬件設(shè)備(僅使用“試驗(yàn)與硬件控制”添加功能)狀態(tài)的條件。
動(dòng)作
- Trial Control(控制) variable – 為了定義一個(gè)動(dòng)作在一次試驗(yàn)控制變量上。參見(jiàn)第175頁(yè)。
- Hardware – 為了定義一個(gè)動(dòng)作在一個(gè)硬件設(shè)備上(僅使用“試驗(yàn)與硬件控制”添加功能)。
- External command – 為了控制外部應(yīng)用程序。通過(guò)外部命令動(dòng)作,您可以啟動(dòng)一個(gè)外部應(yīng)用程序或運(yùn)行一個(gè)批處理文件。
 
如需了解子規(guī)則、子規(guī)則參考和硬件設(shè)備相關(guān)細(xì)信息,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(位于您的安裝DVD中)。
 
 
如何使用Components(組件)面板
為了定義一個(gè)子規(guī)則、條件、動(dòng)作或操作符:
雙擊其名稱。
點(diǎn)擊旁邊按鈕。
將名字從Components(組件)面板中拖動(dòng)到試驗(yàn)控制窗口中。
一個(gè)新的試驗(yàn)控制對(duì)話框出現(xiàn)在“試驗(yàn)控制”窗口左上角內(nèi)。插入新對(duì)話框在對(duì)話框序列中(參閱第169頁(yè))。
如需了解試驗(yàn)控制編程用完整規(guī)程,請(qǐng)參閱第171頁(yè)。
 
“試驗(yàn)控制設(shè)置”窗口
 
 
 
圖7.6 – “試驗(yàn)控制”窗口(帶默認(rèn)的開始-停止試驗(yàn)規(guī)則)。
 
“試驗(yàn)控制設(shè)置”窗口包含目前存在于試驗(yàn)控制設(shè)置中的指令序列(規(guī)則)。當(dāng)您創(chuàng)建一個(gè)新的試驗(yàn)控制設(shè)置文件時(shí),“試驗(yàn)控制”窗口包含默認(rèn)開始-停止試驗(yàn)規(guī)則(參閱第185頁(yè))。
然后,您可以定義您自己的條件在開始-停止試驗(yàn)規(guī)則中,用于確定數(shù)據(jù)記錄開始和停止。
如需了解更多信息:
關(guān)于試驗(yàn)控制編程 – 參閱第171頁(yè)。
關(guān)于開始-停止試驗(yàn)規(guī)則 – 參閱第185頁(yè)。
 
 
Grid(網(wǎng)格)
試驗(yàn)控制對(duì)話框自動(dòng)對(duì)齊到網(wǎng)格。您可以通過(guò)下面動(dòng)作進(jìn)行切換:點(diǎn)擊組件工具欄上的“Show/Hide(顯示/隱藏)”(顯示/隱藏)按鈕,并選擇/取消選擇兩個(gè)“Grid”選項(xiàng)(Snap to Grid和Show Grid)。
 
 
Zoom(縮放)
Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置)中的組件工具欄顯示三個(gè)縮放圖標(biāo):
Zoom in(放大) – 您可以持續(xù)放大,直到試驗(yàn)控制對(duì)話框達(dá)到其原來(lái)尺寸。
Zoom out(縮小) – 您可以持續(xù)縮小,直到所有試驗(yàn)控制對(duì)話框適合該窗口。
 
Fit all (包含全部) - 點(diǎn)擊該按鈕,使所有試驗(yàn)控制對(duì)話框納入該窗口。
 
Trial Control(試驗(yàn)控制)窗口為“動(dòng)態(tài)”類型:這意味著,當(dāng)您向右移動(dòng)試驗(yàn)控制對(duì)話框時(shí),窗口將擴(kuò)展。在這種情形下,通過(guò)使用底部滾動(dòng)條,您可以在Trial Control(試驗(yàn)控制)窗口中“從左向右”進(jìn)行導(dǎo)航。通過(guò)利用組件工具欄中“Zoom to fit”按鈕,使所有Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框可見(jiàn)。
 
 
使用Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框
一個(gè)Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框具有下面信息:
 
 
  圖7.7 – 一個(gè)Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框示例。
A - 控制類型(規(guī)則開始/結(jié)束、行動(dòng)、條件、操作符和參考)。您不能改變?cè)撐谋尽?/div>
B - 名稱(控制描述文本)。為了修改該文本,請(qǐng)點(diǎn)擊Settings(設(shè)置)按鈕,然后輸入文本在Name(名稱)選項(xiàng)下,例如:下放一個(gè)食物項(xiàng)。您還可以添加一個(gè)較長(zhǎng)描述在Comment(注釋)選項(xiàng)下(該選項(xiàng)未顯示)。
 
 
 
“試驗(yàn)控制”對(duì)話框名稱必須具有獨(dú)特性,除非您使用一個(gè)現(xiàn)有對(duì)話框副本(請(qǐng)參閱第180頁(yè))。
C-屬性 – 取決于控制類型,其包含選定選項(xiàng)、公式或待給出命令或者參考引用的子規(guī)則。
 
顏色
試驗(yàn)控制對(duì)話框具有不同顏色:
藍(lán)色 - 用于開始-停止試驗(yàn)規(guī)則、子規(guī)則和子規(guī)則參考。
橄欖綠 – 用于條件。
淺綠色 – 用于動(dòng)作。
灰色 – 用于操作符。
 
 
移動(dòng)一個(gè)對(duì)話框
1. 將鼠標(biāo)懸停在對(duì)話框邊緣或顏色區(qū)域上。鼠標(biāo)光標(biāo)變?yōu)樗南蚣^。
 
2. 拖動(dòng)該對(duì)話框到您需要的位置。
 
移動(dòng)一組對(duì)話框
1. 圍繞您需要移動(dòng)的對(duì)話框畫一個(gè)框(參閱下圖),或者按住Ctrl鍵,同時(shí)點(diǎn)擊您需要選擇的對(duì)話框。
 
 
作為結(jié)果,選定對(duì)話框呈現(xiàn)一條暗灰色邊界。
2. 將鼠標(biāo)懸停在所選對(duì)話框之一的邊緣或顏色區(qū)。鼠標(biāo)光標(biāo)變?yōu)樗南蚣^。
 
3. 將該組對(duì)話框拖動(dòng)到您需要的位置。
 
 
插入一個(gè)對(duì)話框到序列中
1. 拖動(dòng)兩個(gè)對(duì)話框之間的Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框,直到連接箭頭變?yōu)榘咨?/div>
2. 釋放鼠標(biāo)按鍵。插入新對(duì)話框。
 
 
連接兩個(gè)對(duì)話框
1. 將鼠標(biāo)指向第一個(gè)對(duì)話框的中心,按住鼠標(biāo)左鍵并拖向另一個(gè)對(duì)話框的中心。
2. 當(dāng)指針到達(dá)其他對(duì)話框的中心時(shí),釋放鼠標(biāo)左鍵。兩個(gè)對(duì)話框獲得連接。
- 您不能創(chuàng)建從Rule End(規(guī)則結(jié)束)對(duì)話框至任何其他對(duì)話框的連接,或者從任何對(duì)話框至Rule Begin(規(guī)則開始)對(duì)話框的連接。
- Operator(操作符)對(duì)話框可以具有一個(gè)、兩個(gè)或更多輸入箭頭,所有其他對(duì)話框均具有一個(gè)上面輸入箭頭。
- 所有對(duì)話框可以具有1個(gè)或多個(gè)輸出箭頭,并指向不同對(duì)話框。
- 您不能為Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框創(chuàng)建一個(gè)循環(huán)序列。
 
 
修改一個(gè)對(duì)話框中設(shè)置
如果您已經(jīng)插入一個(gè)Trial Control(試驗(yàn)控制)對(duì)話框,并需要修改該對(duì)話框?qū)傩�,�?qǐng)按照下面指示動(dòng)作。
1. 找到指定待修改條件或操作符的Trial Control(試驗(yàn)控制)。您可以在該對(duì)話框頂部綠色/灰色區(qū)域內(nèi)找到該條件/操作符名稱。
2. 點(diǎn)擊該對(duì)話框底部?jī)?nèi)Settings(設(shè)置)按鈕。
3. 在出現(xiàn)窗口中進(jìn)行適當(dāng)設(shè)置(條件和操作符定義請(qǐng)參閱上面相應(yīng)章節(jié))。
 
刪除一個(gè)對(duì)話框
1. 點(diǎn)擊該對(duì)話框的標(biāo)題。該對(duì)話框邊緣高亮顯示。
2. 按下Delete(刪除)按鈕。
 
 
刪除一組對(duì)話框
1. 在您需要?jiǎng)h除的對(duì)話框周圍畫一個(gè)框,或者按住Ctrl鍵,同時(shí)點(diǎn)擊您需要選中的對(duì)話框。
2. 按下Delete(刪除)按鈕。
您無(wú)法刪除Rule Begin(規(guī)則開始)、Rule End(規(guī)則結(jié)束)、Start track(跟蹤開始)和Stop track(跟蹤停止)對(duì)話框。
 
 
刪除一個(gè)連接箭頭
1. 點(diǎn)擊需要?jiǎng)h除的箭頭。箭頭變成粗體,表明該箭頭已選中。
2. 按下Delete(刪除)按鈕。
您不能刪除連接Stop track(跟蹤停止)對(duì)話框和Rule End(規(guī)則結(jié)束)對(duì)話框的箭頭。
 
 
導(dǎo)出試驗(yàn)控制設(shè)置
您可以導(dǎo)出試驗(yàn)控制設(shè)置的圖像:
1. 點(diǎn)擊組件工具欄中的Export image(導(dǎo)出圖像)按鈕 。
2. 選擇用于保存圖像的位置,輸入文件名稱或接受默認(rèn)名,然后從Save as type(保存類型)列表中選擇一個(gè)圖像類型。
3. 點(diǎn)擊“保存”。
導(dǎo)出完整的Trial Control(試驗(yàn)控制)窗口,不考慮縮放因子。
 
最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間(Maximum Trial Duration)窗口
 
 
圖7.8 - 最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間(Maximum Trial Duration)窗口。
 
在Maximum Trial Duration(最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間)窗口中,您可以定義最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間。如需了解更多信息,請(qǐng)參閱第182頁(yè)。
如果您沒(méi)有看到該窗口,請(qǐng)點(diǎn)擊組件工具欄上的Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,然后選擇Maximum Trial Duration(最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間)。如果該窗口中文本顯示灰色,表明“試驗(yàn)控制設(shè)置”處于只讀狀態(tài)。
 
 
7.3 試驗(yàn)控制編程
 
如果您僅需要一個(gè)特定時(shí)間的記錄數(shù)據(jù),您可以通過(guò)設(shè)置最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間而實(shí)現(xiàn)該要求(請(qǐng)參閱第27頁(yè))。
 
 
程序
1. 在程序中定義“試驗(yàn)控制”之前,將試驗(yàn)規(guī)程繪制成一個(gè)流程圖非常有用,其中每個(gè)方塊代表一個(gè)動(dòng)作或條件,當(dāng)這些動(dòng)作或條件獲得滿足時(shí),觸發(fā)其他動(dòng)作或條件。
2. 在Setup(設(shè)置)菜單中,選擇Trial Control(控制) Settings(試驗(yàn)控制設(shè)置),然后選擇New,并輸入新的“試驗(yàn)控制設(shè)置”名稱或接受推薦名稱,然后點(diǎn)擊OK。默認(rèn)“開始/停止”試驗(yàn)規(guī)則出現(xiàn)在該屏幕上。
3. 利用可用組件,建立試驗(yàn)控制序列(如第1步中所述)。
- 為了定義一個(gè)“條件”,請(qǐng)點(diǎn)擊Conditions(條件)選項(xiàng)卡下方一個(gè)按鈕。
→請(qǐng)參閱第172頁(yè)
 
- 為了定義一個(gè)“動(dòng)作”,請(qǐng)點(diǎn)擊Actions(動(dòng)作)選項(xiàng)卡下方按鈕。
 
 
插入對(duì)話框在該序列中適當(dāng)位置內(nèi)。
4. 測(cè)試“試驗(yàn)控制”序列。
 
 
 
5. 應(yīng)用“試驗(yàn)控制”到您的試驗(yàn)。
 
 
當(dāng)您創(chuàng)建一個(gè)新動(dòng)作或條件時(shí),如果相同類型動(dòng)作或條件已定義在這個(gè)或其他“試驗(yàn)控制設(shè)置”中,將出現(xiàn)一條信息,該信息詢問(wèn)您是否需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)新元素或使用現(xiàn)有元素副本。詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第180頁(yè)。
您還可以組合多個(gè)條件。為了組合多個(gè)對(duì)話框,請(qǐng)參閱第178頁(yè)。
 
 
 
使用條件
一個(gè)“條件”即試驗(yàn)期間由EthoVision檢驗(yàn)的語(yǔ)句。當(dāng)條件獲得滿足(“真”)時(shí),該程序評(píng)定下一個(gè)“試驗(yàn)控制”元素(另一個(gè)條件、一個(gè)動(dòng)作或子規(guī)則引用)。
條件示例(斜體):
當(dāng)老鼠到達(dá)平臺(tái)時(shí),停止跟蹤。
當(dāng)在開放場(chǎng)內(nèi)檢測(cè)到老鼠時(shí),開始跟蹤。
當(dāng)動(dòng)物已訪問(wèn)A區(qū)10次時(shí),停止跟蹤。
 
 
如何定義一個(gè)條件
1. 在Conditions(條件)選項(xiàng)卡下,在Components(組件)面板中找到您需要定義的條件類型。
2. 雙擊條件名稱或點(diǎn)擊其旁邊的按鈕。
 
3. 如果Add a condition(添加一個(gè)條件)窗口出現(xiàn),這意味著您的試驗(yàn)中至少具有一個(gè)相同類型條件。詢問(wèn)您是否選擇創(chuàng)建一個(gè)新條件或者重新使用一個(gè)現(xiàn)有條件(請(qǐng)參閱第180頁(yè))。選擇您需要的選項(xiàng),然后點(diǎn)擊OK。如果該窗口沒(méi)有出現(xiàn),跳過(guò)此步驟。
 
4. 然后轉(zhuǎn)到Condition name(條件名稱),并輸入您需要分配給該條件的名稱,或者接受默認(rèn)名稱。
5. 指定條件屬性。
6. 輸入一個(gè)注釋(可選),然后點(diǎn)擊OK。
7. 插入該條件對(duì)話框在序列中。
如果條件比較復(fù)雜(例如:“如果老鼠已經(jīng)達(dá)到平臺(tái)或者已經(jīng)游泳達(dá)到60秒,則停止試驗(yàn)”),您必須定義單獨(dú)條件,并組合這些條件(請(qǐng)參閱第178頁(yè))。
另請(qǐng)參閱第189頁(yè)上的示例。
如需了解條件相關(guān)詳述,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
 
條件類型
Time(時(shí)間) - 幫助定義一個(gè)時(shí)間間隔,在采取一個(gè)動(dòng)作之前該時(shí)間間隔應(yīng)流逝。例如:2秒延遲后跟蹤開始或中午12點(diǎn)跟蹤開始。
時(shí)間間隔(Time interval) – 僅與另一個(gè)條件組合使用時(shí),該條件方有效。例如:當(dāng)發(fā)現(xiàn)動(dòng)物處于A區(qū)內(nèi)(“區(qū)內(nèi)”條件)5-10分鐘(“時(shí)間間隔”條件)之間時(shí),停止跟蹤。
Trial Control(控制) variable(試驗(yàn)控制變量) - 幫助您在條件激活時(shí)比較一個(gè)“試驗(yàn)控制變量”和一個(gè)值、另一個(gè)變量或一個(gè)公式(激活含義請(qǐng)參閱第160頁(yè))。
例如:當(dāng)變量Counter(計(jì)數(shù))達(dá)到10時(shí),停止跟蹤。
Dependent variables(因變量) - 定義基于受試者行為的條件。選擇一個(gè)因變量以創(chuàng)建條件。
示例1:當(dāng)受試者在目標(biāo)區(qū)域(“區(qū)內(nèi)”條件)內(nèi)出現(xiàn)10次時(shí),停止跟蹤。
示例2:當(dāng)受試者已行走超過(guò)5分鐘(“運(yùn)動(dòng)”條件)時(shí),停止跟蹤。
附注:您無(wú)法使用“自動(dòng)行為識(shí)別”功能基于已檢測(cè)到的行為之一創(chuàng)建一個(gè)“試驗(yàn)控制”條件。
硬件(Hardware) - 為了定義一個(gè)條件,該條件基于一臺(tái)硬件設(shè)備所給出的信號(hào)。為了與EthoVision一起使用硬件設(shè)備,您必須具有“試驗(yàn)與硬件控制”附加模塊。請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
 
如果您已經(jīng)插入一個(gè)基于活動(dòng)性持續(xù)的條件對(duì)話框在Trial Control(試驗(yàn)控制)規(guī)則中,然后取消選中Experiment settings中的Activity analysis(請(qǐng)參閱第100頁(yè)),那么您的規(guī)則將失效�;诨顒�(dòng)連續(xù)性的條件對(duì)話框?qū)哪男蛄兄袆h除,同時(shí)刪除連接箭頭。重新設(shè)計(jì)您的“試驗(yàn)控制”規(guī)則,并連接對(duì)話框之間的箭頭(請(qǐng)參閱第169頁(yè))。
如需了解“條件”相關(guān)詳述,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)中“條件概述”(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
 
 
使用動(dòng)作
一個(gè)動(dòng)作為一個(gè)命令,該命令由EthoVision在采集期間執(zhí)行,并影響該試驗(yàn)。
動(dòng)作示例(斜體):
當(dāng)在活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)檢測(cè)到動(dòng)物時(shí),開始跟蹤。
該示例為一個(gè)系統(tǒng)動(dòng)作示例(開始跟蹤和停止跟蹤)。
當(dāng)動(dòng)物進(jìn)入迷宮的左臂時(shí),執(zhí)行C = C +1。
該示例為根據(jù)“試驗(yàn)控制”變量采取一個(gè)動(dòng)作的示例。參見(jiàn)第175頁(yè)。
當(dāng)動(dòng)物從掩蔽物中出來(lái)時(shí),開始使用媒體記錄器錄像。
動(dòng)作“開始跟蹤”和“停止跟蹤”已定義在“開始-停止試驗(yàn)”規(guī)則中。除此之外,您可以定義基于試驗(yàn)控制變量的動(dòng)作。
您無(wú)法創(chuàng)建“開始跟蹤”和“停止跟蹤”類型的額外動(dòng)作,也無(wú)法刪除現(xiàn)有動(dòng)作。
如果您的EthoVision許可證包括試驗(yàn)與硬件控制擴(kuò)展模塊,您還可以定義動(dòng)作在硬件設(shè)備上。請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
 
如何定義一個(gè)“試驗(yàn)控制”變量
1. 在Components(組件)面板中,點(diǎn)擊Conditions(條件)或Actions(動(dòng)作)選項(xiàng)卡下方Trial Control(控制) variable(試驗(yàn)控制變量)旁邊的按鈕。接下來(lái),點(diǎn)擊Variables按鈕。
2. Trial Control(控制) Variables(試驗(yàn)控制變量)窗口列出該試驗(yàn)中目前變量(也包括定義在其他試驗(yàn)控制設(shè)置中的變量)。為了添加一個(gè)新變量,請(qǐng)點(diǎn)擊Add variable(添加變量)。
 
3. 一個(gè)新行添加到該表。在Name(名稱)選項(xiàng)卡下,輸入需要分配給該變量的名稱。在Initial Value(初始值)選項(xiàng)卡下,在試驗(yàn)開始時(shí)輸入該變量值(默認(rèn)值:0)。
4. 點(diǎn)擊“OK(確認(rèn))”。在TC-variable action/condition窗口中,定義需要的動(dòng)作和條件。如果您此時(shí)不希望創(chuàng)建基于該變量的條件或動(dòng)作,請(qǐng)點(diǎn)擊Cancel。
為了刪除一個(gè)變量,請(qǐng)點(diǎn)擊Trial Control(控制) Variables(試驗(yàn)控制變量)窗口中的變量名,然后點(diǎn)擊Delete variable(刪除變量)按鈕。
為了重命名一個(gè)變量,請(qǐng)點(diǎn)擊Trial Control(控制) Variables(試驗(yàn)控制變量)窗口中的變量名,并編輯該名稱。
一個(gè)新的試驗(yàn)控制變量默認(rèn)名稱為VarN,其中N為一個(gè)遞增數(shù)字。
變量名不能包含空格。
 
 
如何定義一個(gè)基于試驗(yàn)控制變量的動(dòng)作。
1. 在Components(組件)面板中,在Actions(動(dòng)作)選項(xiàng)卡下方,點(diǎn)擊Trial Control(控制) variable(試驗(yàn)控制變量)旁邊的按鈕。
 
2. 如果出現(xiàn)Add an action(添加一個(gè)動(dòng)作)窗口,這意味著您的試驗(yàn)中至少具有一個(gè)相同類型的動(dòng)作。詢問(wèn)您是否選擇創(chuàng)建一個(gè)新條件或者重新使用一個(gè)現(xiàn)有條件(請(qǐng)參閱第180頁(yè))。
3. 轉(zhuǎn)到Action Name選項(xiàng),并輸入動(dòng)作名稱(例如:增量計(jì)數(shù)器)或接受默認(rèn)名稱。
4. 在Action to perform(需要執(zhí)行的動(dòng)作)選項(xiàng)卡下,從列表中選擇該變量。如果您尚未創(chuàng)建變量,您可以通過(guò)點(diǎn)擊Variables(變量)選項(xiàng)創(chuàng)建該變量。
5. 轉(zhuǎn)到“=”符號(hào),并執(zhí)行下面操作之一:
- 為了分配另一個(gè)變量的相同值(例如:A = B),從第二個(gè)列表中選擇其他變量(B)。
- 為了輸入一個(gè)公式,請(qǐng)點(diǎn)擊雙箭頭按鈕。
 
從該列表中選擇操作符,并在第二和第三個(gè)列表中指定公式。例如:A = A + 1。
 
- 為了分配一個(gè)隨機(jī)值,請(qǐng)從第二個(gè)列表中選擇Random(隨機(jī)),并選擇Minimum(最�。┖蚆aximum(最大)限值(僅限整數(shù)值,0 - 999),該隨機(jī)值應(yīng)處于該區(qū)間內(nèi)。
 
 
6. 輸入一個(gè)注釋(可選),然后點(diǎn)擊OK。
7. 插入產(chǎn)生的“動(dòng)作”對(duì)話框在“試驗(yàn)控制”規(guī)則中。
 
注釋
如果您的設(shè)置包括多個(gè)活動(dòng)場(chǎng),每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)接收一個(gè)變量示例。因此,在不同活動(dòng)場(chǎng)內(nèi),一個(gè)變量可能具有不同值。
您不能利用一個(gè)公式組合Random(例如:為了計(jì)算A = Random + 1)。等效解決方案如下:首先定義一個(gè)動(dòng)作B = Random(隨機(jī)),然后另一個(gè)動(dòng)作A = B +1,并放入產(chǎn)生的兩個(gè)“動(dòng)作”對(duì)話框在序列中。
為了生成一個(gè)隨機(jī)值,最大限值必須大于最小限值。
如何定義一個(gè)外部命令
1. 在Components(組件)面板中,在Actions(動(dòng)作)選項(xiàng)卡下,點(diǎn)擊External command(外部命令)旁邊的按鈕。
 
2. 轉(zhuǎn)到Action Name選項(xiàng),并輸入動(dòng)作名稱(例如:增量計(jì)數(shù)器)或接受默認(rèn)名稱。
   點(diǎn)擊“信息”按鈕,以獲取外部命令定義相關(guān)詳細(xì)信息。
 
3. 在Actions to perform(待執(zhí)行動(dòng)作)選項(xiàng)卡下,通過(guò)點(diǎn)擊“省略號(hào)”按鈕,選擇您需要運(yùn)行的文件。
4. 然后,從列表中選擇一種文件類型:
- 可執(zhí)行文件(*.exe)。
- 批處理文件(*.bat)。
- 所有文件(*.*)。
5. 找到文件,然后點(diǎn)擊Open。
6. 輸入一個(gè)命令行選項(xiàng)(可選)。
示例 - 您在24小時(shí)期限內(nèi)進(jìn)行實(shí)況跟蹤,并且您希望利用媒體記錄器進(jìn)行記錄,但僅當(dāng)動(dòng)物離開掩蔽物(定義為一個(gè)“隱藏區(qū)”,動(dòng)物在該區(qū)域內(nèi)花費(fèi)大部分時(shí)間)時(shí)進(jìn)行記錄。首先,使用一個(gè)外部命令對(duì)話框啟動(dòng)媒體記錄器:選擇MRCmd.exe(作為可執(zhí)行文件)運(yùn)行,然后輸入/E(作為命令行選項(xiàng))以啟動(dòng)媒體記錄器。接著,插入一個(gè)條件“離開掩蔽物”,并將其與“時(shí)間”條件組合,以確保在開始記錄前啟動(dòng)媒體記錄器(示例請(qǐng)參閱圖7.9)。然后,插入一個(gè)外部命令對(duì)話框:選擇MRCmd.exe(作為可執(zhí)行文件)運(yùn)行,然后輸入/R(作為命令行選項(xiàng))以啟動(dòng)媒體記錄器。同樣,當(dāng)動(dòng)物再次進(jìn)入掩蔽物時(shí),您可以停止記錄(命令行選項(xiàng):/S)。
 
在命令開始記錄和媒體記錄器實(shí)際開始記錄之間可能會(huì)有延遲。執(zhí)行一次測(cè)試記錄,以測(cè)試該延遲時(shí)間長(zhǎng)度。
 
 
 
圖7.9 - 外部命令操作示例(當(dāng)動(dòng)物離開掩蔽物時(shí),使用啟動(dòng)媒體記錄器開始記錄)。左邊Start MR操作對(duì)話框用于啟動(dòng)媒體記錄器。當(dāng)“離開掩蔽物”和“時(shí)間”(1)條件同時(shí)為“真”時(shí),右側(cè)上Start recording MR操作對(duì)話框啟動(dòng)記錄,也就是說(shuō),在媒體記錄器啟動(dòng)之后,動(dòng)物中心點(diǎn)已經(jīng)離開掩蔽物至少5秒。
 
使用操作符
操作符用于按照各種方式組合行動(dòng)、條件和子規(guī)則。例如:
當(dāng)至少滿足兩個(gè)條件A和B之一時(shí),然后執(zhí)行…
該示例中通過(guò)一個(gè)“Any”(任意)類型操作符(OR邏輯)組合條件。
當(dāng)兩個(gè)條件同時(shí)滿足時(shí),那么執(zhí)行...
該示例中通過(guò)一個(gè)“All”(全部)類型操作符(AND邏輯)組合條件。
當(dāng)至少/至多/正好8個(gè)條件中的4個(gè)條件時(shí),那么執(zhí)行...
該示例中通過(guò)“N of All”類型操作符組合條件。
 
為了組合條件/行動(dòng)/規(guī)則:
1. 定義您需要組合的條件/動(dòng)作/規(guī)則。將這些項(xiàng)目作為并行分支放入您的“試驗(yàn)控制”序列中。連接箭頭必須源自您需要定義的元素組合之前的條件/操作。
2. 在Structures(結(jié)構(gòu))選項(xiàng)卡下,在Components(組件)面板中雙擊Operator(操作符)或點(diǎn)擊其旁邊的
3. 如果出現(xiàn)Add an operator(添加一個(gè)操作符)窗口,這意味著您的試驗(yàn)中至少具有一個(gè)相同類型的操作符。詢問(wèn)您是否需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)新操作符或者重新使用一個(gè)現(xiàn)有操作符。如果該窗口沒(méi)有出現(xiàn),跳過(guò)此步驟。
- Create a new operator(創(chuàng)建新操作符) - 創(chuàng)建一個(gè)新操作符。
- Reuse an existing operator(重新使用現(xiàn)有操作符) - 選擇試驗(yàn)中已經(jīng)存在的操作符名稱。詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第180頁(yè)。
點(diǎn)擊“OK(確認(rèn))”。出現(xiàn)Operator(操作符)窗口。
4. 在Name(名稱)選項(xiàng)卡下,輸入操作符名稱或接受默認(rèn)操作符名稱(n),其中n為一個(gè)遞增數(shù)字。
5. 在Operator triggers when選項(xiàng)卡下,選擇適用選項(xiàng):
- 輸入元素中任意元素(至少一個(gè))為“真”。
- 所有輸入元素同時(shí)為“真”。
- 所有輸入元素中n個(gè)元素同時(shí)為“真”。
其中,“真”即指滿足一個(gè)條件、執(zhí)行一個(gè)行動(dòng)或完成子規(guī)則(取決于您需要組合的元素)。
- 如果您選擇第三個(gè)選項(xiàng),指定應(yīng)達(dá)到“真”狀態(tài)的輸入元素?cái)?shù)量:=(正好等于)、not=(不等于),>=(至少)和<=(最高)等。指定數(shù)量在該話框中。
 
6. 輸入一個(gè)注釋(可選)以描述該操作符,然后點(diǎn)擊OK。
7. 一個(gè)新Operator(操作符)對(duì)話框出現(xiàn)在“試驗(yàn)控制”中。將對(duì)話框放置在第1步中所定義的元素右側(cè),并連接每個(gè)元素(或在一個(gè)序列的情形下,結(jié)束元素)到該操作符。
 
8. 將該操作符連接到需要激活的下一個(gè)元素。
在您的試驗(yàn)中,操作符名稱必須具有唯一性。您不能使用相同操作符名稱定義兩個(gè)操作符,即使在兩個(gè)不同“試驗(yàn)控制設(shè)置”中定義這些操作符。
一個(gè)操作符也可以僅具有一個(gè)輸入對(duì)話框。在這種情形下,操作符無(wú)用,因?yàn)橹灰斎霔l件變成真或執(zhí)行輸入動(dòng)作,控制將立即傳遞到下一個(gè)對(duì)話框。EthoVision告知您該信息。
 
重新使用試驗(yàn)控制元素
如果您已經(jīng)在其他“試驗(yàn)控制設(shè)置”中定義元素(條件、動(dòng)作、操作符、子規(guī)則和子規(guī)則參考),可以復(fù)制所有這類元素,并用于目前“試驗(yàn)控制設(shè)置”中以減少編輯時(shí)間。
為了在目前“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件中重新使用已定義的元素,應(yīng)復(fù)制這類元素:右擊Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中的該配置文件,然后選擇Duplicate(復(fù)制)。
 
如何重新使用一個(gè)“試驗(yàn)控制”元素
1. 點(diǎn)擊需要重新使用的元素類別旁邊的按鈕
2. 出現(xiàn)Add(添加)窗口。選擇Reuse an existing condition/action(重新使用現(xiàn)有條件/動(dòng)作)。
如果該試驗(yàn)僅包含一個(gè)“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件,或者該試驗(yàn)包含多個(gè)“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件,但沒(méi)有一個(gè)配置文件包含您選擇的相同類型元素,在這些情形下,將不會(huì)出現(xiàn)該窗口。
3. 在該選項(xiàng)旁邊的列表中,選擇現(xiàn)有元素名稱。
第二個(gè)列表顯示包含該元素的“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件。如果該元素存在于多個(gè)“試驗(yàn)控制設(shè)置”中,那么從列表中選擇一個(gè)合適“試驗(yàn)控制設(shè)置”。
4. 點(diǎn)擊“OK(確認(rèn))”。
5. 選定元素類型用窗口出現(xiàn)。此處指定的名稱和設(shè)置如同第3步中選定的元素。
- 為了創(chuàng)建該元素的相同副本,請(qǐng)點(diǎn)擊OK,然后轉(zhuǎn)到第7步。
- 在所有其他情形下,編輯設(shè)置,并點(diǎn)擊OK,然后轉(zhuǎn)到第6步。
6. 如果您已更改新元素的任何屬性(包括名稱和注釋),將出現(xiàn)一個(gè)窗口,其中顯示兩個(gè)選項(xiàng):
- 僅應(yīng)用新設(shè)置在目前試驗(yàn)控制配置文件中。
- 應(yīng)用新設(shè)置在所有可寫入式試驗(yàn)控制配置文件中。
該程序?qū)⒃儐?wèn)您:是否需要將屬性僅應(yīng)用于新副本,或者將這些變化擴(kuò)展至所有可寫入式試驗(yàn)控制設(shè)置中的原始元素(這意味著,采集后未鎖定)。選擇您需要的選項(xiàng),然后點(diǎn)擊OK。
7. 插入所產(chǎn)生的對(duì)話框在“試驗(yàn)控制”序列中。
如果您選擇選項(xiàng)“將新設(shè)置應(yīng)用到所有可寫入式試驗(yàn)控制配置文件中”,那么在數(shù)據(jù)采集后,只讀配置文件不會(huì)發(fā)生變化。
您不能重新使用同一個(gè)試驗(yàn)控制設(shè)置中的試驗(yàn)控制元素。原因如下:“試驗(yàn)控制”元素必須具有唯一性,以便執(zhí)行正確分析。
 
定義一個(gè)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間
如果停止試驗(yàn)的條件(請(qǐng)參閱第185頁(yè))一直未滿足,EthoVision XT將會(huì)無(wú)限期地等待,并且試驗(yàn)永遠(yuǎn)不會(huì)結(jié)束。為了防止這種情形發(fā)生,您可以定義一個(gè)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間。例如,在一個(gè)新的受試者試驗(yàn)中,如果您定義一個(gè)條件“當(dāng)老鼠進(jìn)入帶有熟悉目標(biāo)的區(qū)域時(shí)停止跟蹤”,可能會(huì)出現(xiàn)下面情形:老鼠完全忽略熟悉目標(biāo),而只注重新目標(biāo)。
使用最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間 - 選中此復(fù)選框以定義一個(gè)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間,并輸入試驗(yàn)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間(以小時(shí)、分鐘或秒計(jì))。
 
當(dāng)您設(shè)置一個(gè)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間時(shí),當(dāng)達(dá)到該時(shí)間時(shí),試驗(yàn)將停止,無(wú)論是否正在評(píng)定一個(gè)或多個(gè)規(guī)則。
作為使用最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間的替代選項(xiàng),您也可以定義一個(gè)基于時(shí)間的條件,并正好放置該條件在“停止跟蹤”對(duì)話框前面(請(qǐng)參閱第185頁(yè))。然而,這兩者具有兩個(gè)重要區(qū)別:
如果您使用最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間,該程序?qū)脑囼?yàn)啟動(dòng)開始時(shí)計(jì)算時(shí)間(由“開始-停止試驗(yàn)”對(duì)話框指示)。相反,正好放置在“停止跟蹤“對(duì)話框前面的條件將從數(shù)據(jù)記錄開始時(shí)計(jì)算時(shí)間(由“開始跟蹤”對(duì)話框指示)。如果在“開始-停止”試驗(yàn)和“跟蹤開始”之間具有一個(gè)條件,并使數(shù)據(jù)記錄遲于試驗(yàn)一段時(shí)間開始,那么這兩個(gè)開始點(diǎn)可能并不一樣。
隨著使用多活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置,最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間可同時(shí)停止所有活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)的試驗(yàn)(以及數(shù)據(jù)記錄),即使已經(jīng)在不同時(shí)間點(diǎn)開始數(shù)據(jù)記錄。相反,放置在“開始跟蹤”和“停止跟蹤”對(duì)話框之間的一個(gè)“時(shí)間”條件可停止一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)的數(shù)據(jù)記錄(當(dāng)該活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)條件獲得滿足時(shí))。這意味著,您可以在不同時(shí)間點(diǎn)停止不同活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)數(shù)據(jù)記錄。
例如:您設(shè)定當(dāng)?shù)谝淮螜z測(cè)到動(dòng)物時(shí)(“區(qū)內(nèi)”條件)時(shí)開始數(shù)據(jù)記錄。接下來(lái),您定義一個(gè)5分鐘“延遲”條件在緊鄰“停止跟蹤”對(duì)話框的前面。如果不同時(shí)間點(diǎn)在不同活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)第一次檢測(cè)到動(dòng)物,數(shù)據(jù)記錄也將在不同時(shí)間點(diǎn)停止,因?yàn)樗谢顒?dòng)場(chǎng)使用相同延遲。當(dāng)最后一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)的記錄停止時(shí),試驗(yàn)結(jié)束。
 
測(cè)試試驗(yàn)控制序列
 
當(dāng)首次使用一個(gè)復(fù)雜試驗(yàn)控制序列時(shí),很難做到運(yùn)行完全正常。為了檢查“試驗(yàn)控制”是否按預(yù)期工作,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)中“測(cè)試試驗(yàn)控制序列”(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
應(yīng)用“試驗(yàn)控制”到您的試驗(yàn)中
為了應(yīng)用“試驗(yàn)控制”到您的試驗(yàn)中,確保Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中適當(dāng)“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件以藍(lán)色高亮突出顯示。
 
在執(zhí)行實(shí)際試驗(yàn)之前,充分測(cè)試您的設(shè)置(參閱上文)。
對(duì)于多活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置 – “試驗(yàn)控制”分別單獨(dú)應(yīng)用到每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)。
對(duì)于批量數(shù)據(jù)采集 - 在“試驗(yàn)列表”中,您可以指定需要用于一項(xiàng)特定試驗(yàn)的“試驗(yàn)控制設(shè)置”。詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第270頁(yè)。
鎖定的試驗(yàn)控制設(shè)置 - 當(dāng)一個(gè)“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件用于至少一項(xiàng)試驗(yàn)的采集時(shí),將被鎖定。鎖定的設(shè)置由Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中的一個(gè)鎖定符號(hào)表示,并且不能編輯。為了編輯一個(gè)鎖定的“試驗(yàn)控制設(shè)置”配置文件,應(yīng)創(chuàng)建一個(gè)文件副本,并編輯該副本。參見(jiàn)第663頁(yè)。
從視頻文件中進(jìn)行跟蹤 - 當(dāng)您從視頻文件中進(jìn)行跟蹤時(shí),“試驗(yàn)控制”使用視頻時(shí)間(而非實(shí)際時(shí)間)檢查條件。
- 基于延遲的條件 - 如果您選擇Detection Determines Speed(檢測(cè)確定速度)選項(xiàng),“試驗(yàn)控制”將以EthoVision所設(shè)置的速度執(zhí)行,以防止跳過(guò)視頻圖像(請(qǐng)參閱第280頁(yè))。這將導(dǎo)致視頻播放快或慢于正常情形(1倍),并取決于檢測(cè)受試者所需的處理器負(fù)荷。例如:如果檢測(cè)要求很少處理器工作,該程序?qū)⒁愿焖俣龋ㄏ鄬?duì)于正常情形)跟蹤受試者。因此,一個(gè)“延遲”條件(例如:延遲60 s)比實(shí)際時(shí)間更早獲得滿足。
- 使用時(shí)鐘時(shí)間 - 如果您定義一個(gè)基于時(shí)鐘時(shí)間的條件,或者安排一個(gè)具有時(shí)鐘時(shí)間的子規(guī)則,這將轉(zhuǎn)化成視頻開始時(shí)間,即用于跟蹤的視頻文件創(chuàng)建日期和時(shí)間。
示例1 - 您設(shè)置一個(gè)Time(時(shí)間)條件,在時(shí)鐘時(shí)間11:30后開始跟蹤,視頻文件創(chuàng)建于2008年3月6日11:00,一旦您開始試驗(yàn),將在視頻中半小時(shí)后該條件獲得滿足。
 
如果您已設(shè)置為在時(shí)鐘時(shí)間10:30后開始跟蹤,跟蹤將在試驗(yàn)開始后立即開始。
示例2 - 您設(shè)定一個(gè)子規(guī)則以在10:00(第一天)點(diǎn)開始。視頻文件創(chuàng)建于2008年3月6日11:00,一旦您開始試驗(yàn),子規(guī)則將永遠(yuǎn)不會(huì)開始,因?yàn)轭A(yù)定開始出現(xiàn)在視頻初始時(shí)間之前。為了創(chuàng)建一個(gè)子規(guī)則,并從視頻進(jìn)行跟蹤時(shí)該子規(guī)則開始,設(shè)定開始時(shí)間介于11:00和視頻結(jié)束時(shí)間之間。
記錄視頻,然后進(jìn)行跟蹤 - 如果您選擇首先記錄視頻,然后從生成的視頻文件中采集數(shù)據(jù)(參閱第297頁(yè)):
- 當(dāng)僅記錄視頻時(shí),試驗(yàn)控制關(guān)閉。當(dāng)在Acquisition(采集)窗口中選擇Save video file only選項(xiàng)時(shí),您會(huì)得到一個(gè)相應(yīng)信息。
- 當(dāng)您從視頻進(jìn)行跟蹤時(shí),“開始-停止”試驗(yàn)控制將激活,但您無(wú)法控制硬件設(shè)備。
重新執(zhí)行一次試驗(yàn) - 對(duì)于使用EthoVision記錄的視頻文件,您可以重新執(zhí)行相應(yīng)試驗(yàn)(請(qǐng)參閱第9章中“重新執(zhí)行試驗(yàn)”)。然而,如果您重新執(zhí)行一次試驗(yàn),利用先前試驗(yàn)所記錄的“試驗(yàn)控制”日志文件將刪除。
停止一次試驗(yàn) - 當(dāng)您停止試驗(yàn)時(shí),“試驗(yàn)控制”中所有激活的規(guī)則將立即終止,并且硬件設(shè)備將重置。
 
7.4 “開始-停止”試驗(yàn)規(guī)則
 
當(dāng)您創(chuàng)建或打開“試驗(yàn)控制設(shè)置”時(shí),屏幕上顯示“開始-停止”試驗(yàn)規(guī)則。通過(guò)使用該規(guī)則,您可以控制數(shù)據(jù)采集(跟蹤)開始和停止。您僅能修改初始“開始-停止”試驗(yàn)規(guī)則。
 
默認(rèn)開始-停止試驗(yàn)規(guī)則
 
圖7.10 - 默認(rèn)開始-停止試驗(yàn)規(guī)則。請(qǐng)參閱文本中闡釋。
 
默認(rèn)開始-停止試驗(yàn)規(guī)則為一個(gè)規(guī)則序列,包含6個(gè)對(duì)話框(請(qǐng)參閱第184頁(yè)上所述的例外情形):
Rule Begin-Start-Stop trial(規(guī)則開始 – 開始-停止試驗(yàn)) - 當(dāng)您開始試驗(yàn)時(shí)激活(在Acquisition菜單中,選擇Start Trial,或者點(diǎn)擊Start Trial按鈕,或者按下Ctrl+F5)。
 
一旦您開始試驗(yàn),控制將傳遞給下一個(gè)對(duì)話框。
Condition-In Zone-Cumulative duration >=1.00 s When Center-Point is in Arena - 這是默認(rèn)的“開始跟蹤”條件。在您開始試驗(yàn)后,當(dāng)已檢測(cè)到受試者(或者任何受試者,如果活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)具有多個(gè)受試者)中心點(diǎn)處于活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)達(dá)到1秒時(shí),該條件獲得滿足。
如果您開始試驗(yàn),并且未檢測(cè)到動(dòng)物,程序?qū)⒌却�,直到檢測(cè)到動(dòng)物1秒鐘,然后開始跟蹤。
該條件分別應(yīng)用于每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)中。這意味著,在同一試驗(yàn)中,跟蹤可以在不同時(shí)間點(diǎn)開始。
Action-Start track - 當(dāng)其左側(cè)上條件得到滿足時(shí)激活。一旦該對(duì)話框激活,開始數(shù)據(jù)記錄(跟蹤)。如果放置在開始-停止試驗(yàn)對(duì)話框和該對(duì)話框之間的條件不能立即滿足,那么跟蹤將晚于您開始試驗(yàn)的時(shí)間開始。
 
Condition-Time-Infinite delay(從未滿足條件) - 這是默認(rèn)的“停止跟蹤”條件。該條件從未滿足過(guò)。當(dāng)您采取停止命令或時(shí)間超過(guò)最長(zhǎng)試驗(yàn)時(shí)間(當(dāng)其已被設(shè)置)時(shí),該試驗(yàn)將停止。
Action-Stop track - 標(biāo)記所有跟蹤(和試驗(yàn))的結(jié)束。
Rule End-Start-Stop trial – 該對(duì)話框僅為規(guī)則的分隔符,無(wú)需采取任何操作。
 
帶活動(dòng)性分析的試驗(yàn)控制
如果您在“試驗(yàn)設(shè)置”中已選擇Activity analysis(活動(dòng)性分析),Condition-In zone(區(qū)內(nèi)條件)對(duì)話框?qū)哪J(rèn)開始-停止規(guī)則中移除。為了同時(shí)執(zhí)行跟蹤和活動(dòng)性分析,并當(dāng)在活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)檢測(cè)到受試者持續(xù)指定時(shí)間時(shí)開始跟蹤,請(qǐng)插入一個(gè)新的In Zone(區(qū)域內(nèi))條件在開始-停止規(guī)則中。如需了解活動(dòng)性分析相關(guān)更多信息,請(qǐng)參閱第100頁(yè)。
附注:如果您還在“試驗(yàn)設(shè)置“中選擇Behavior recognition(行為識(shí)別),開始-停止規(guī)則如下所述。
 
帶老鼠行為識(shí)別的試驗(yàn)控制
在“試驗(yàn)設(shè)置”中,當(dāng)選擇Analysis Options選項(xiàng)卡下Behavior recognition(行為識(shí)別)選項(xiàng)時(shí)(參閱第101頁(yè)),一個(gè)Time(時(shí)間)條件將添加在在Condition-In zone(區(qū)內(nèi)條件)對(duì)話框和Action Start Track(動(dòng)作開始跟蹤)對(duì)話框之間。這意味著,在首次檢測(cè)到動(dòng)物之后EthoVision XT等待20秒,然后開始實(shí)際跟蹤。其中原因:行為識(shí)別算法需要若干視頻幀數(shù)(相當(dāng)于目前幀之前約18秒)以識(shí)別行為。
 
 
圖7.11 – “試驗(yàn)設(shè)置”中開始-停止試驗(yàn)規(guī)則部分(當(dāng)選擇“試驗(yàn)設(shè)置”中Behavior recognition選項(xiàng)時(shí))
 
如果該附加條件缺失,開始18秒跟蹤將不包含任何行為數(shù)據(jù)(請(qǐng)參閱第104頁(yè)上圖5.3)。
 
如果您在“試驗(yàn)設(shè)置”中取消選擇選項(xiàng)Behavior recognition(行為識(shí)別),條件“20秒延遲之后”將自動(dòng)從試驗(yàn)控制規(guī)則中刪除。
 
一個(gè)重要區(qū)別:試驗(yàn)與跟蹤
試驗(yàn) – 一項(xiàng)試驗(yàn)可以視為一個(gè)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)器,用于在一個(gè)記錄進(jìn)程中收集數(shù)據(jù)。當(dāng)在采集中給出啟動(dòng)命令時(shí)開始,并當(dāng)所有活動(dòng)場(chǎng)和受試者的跟蹤停止時(shí)停止。
跟蹤 - 一次跟蹤對(duì)應(yīng)一個(gè)受試者位置和行為的實(shí)際記錄。跟蹤開始可能會(huì)或可能不會(huì)與試驗(yàn)開始重合。這取決于您的試驗(yàn)控制設(shè)置。如果您使用默認(rèn)“試驗(yàn)控制設(shè)置”,在活動(dòng)場(chǎng)中檢測(cè)到動(dòng)物1秒后開始跟蹤,并且在您停止試驗(yàn)時(shí)停止跟蹤。
一次試驗(yàn)可以包含一個(gè)或多個(gè)跟蹤。例如:如果您同時(shí)跟蹤兩個(gè)受試者,那么每次試驗(yàn)包含兩個(gè)跟蹤(1個(gè)跟蹤/受試者)。同樣,如果您的設(shè)置包含四個(gè)活動(dòng)場(chǎng),且每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)具有兩個(gè)受試者,那么每次試驗(yàn)將包括4個(gè)活動(dòng)場(chǎng)×2個(gè)受試者= 8個(gè)跟蹤。
在一次多活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置中,跟蹤結(jié)束并不意味著試驗(yàn)結(jié)束。在所有跟蹤結(jié)束時(shí),試驗(yàn)也將停止。
 
自定義開始-停止試驗(yàn)規(guī)則
注意:您不能刪除Rule Begin(規(guī)則開始)、Rule End(規(guī)則結(jié)束)、Start track(開始跟蹤)和Stop track(停止跟蹤)對(duì)話框。此外,您不能在相同試驗(yàn)控制設(shè)置中定義一個(gè)額外開始 - 停止試驗(yàn)規(guī)則。為了創(chuàng)建一個(gè)新規(guī)則,請(qǐng)創(chuàng)建一個(gè)新的“試驗(yàn)控制設(shè)置”(參閱第171頁(yè))。
 
修改“開始跟蹤”條件
默認(rèn)的Start track(開始跟蹤)條件為一個(gè)In zone(區(qū)域內(nèi))條件。
如果修改該條件,請(qǐng)點(diǎn)擊Settings(設(shè)置)按鈕。
 
 
在出現(xiàn)的窗口中:
- 點(diǎn)擊Settings(設(shè)置),并指定動(dòng)物應(yīng)該存在的區(qū)域。
 
- 從Statistic(統(tǒng)計(jì))列表中,指定動(dòng)物應(yīng)該在該區(qū)域內(nèi)的時(shí)間(累計(jì)持續(xù)時(shí)間),或者動(dòng)物應(yīng)該訪問(wèn)該區(qū)域的次數(shù)(頻率),以便EthoVision XT開始跟蹤。
 
 
為了使用其他條件(例如:在開始試驗(yàn)后正好1分鐘時(shí)開始記錄),請(qǐng)先刪除目前條件(點(diǎn)擊該對(duì)話框,按下Delete),然后插入一個(gè)新條件。
為了在您開始試驗(yàn)時(shí)就開始試錄,請(qǐng)刪除Start track(開始跟蹤)條件:點(diǎn)擊Start track(開始跟蹤)對(duì)話框前面的緊鄰對(duì)話框,然后按Delet。
條件概述請(qǐng)參閱第173頁(yè)。
 
修改“停止跟蹤”條件
默認(rèn)的Stop track(停止跟蹤)條件為一個(gè)Time時(shí)間)條件。
為了修改該條件,點(diǎn)擊Settings(設(shè)置)按鈕,然后選擇所需的選項(xiàng)
 
為了使用另一個(gè)條件,首先刪除目前條件(點(diǎn)擊該對(duì)話框,然后按Delete),然后插入新對(duì)話框(參閱第172頁(yè)),并重新連接所有對(duì)話框(參閱第169頁(yè))。
 
      如果您需要當(dāng)一個(gè)特定時(shí)間已過(guò)時(shí)停止跟蹤,請(qǐng)參閱第27頁(yè)。
在開始跟蹤和停止跟蹤之間至少保持一個(gè)條件。如果您不這樣做,跟蹤將在開始后立即停止,導(dǎo)致沒(méi)有數(shù)據(jù)。
如果您已經(jīng)插入一個(gè)基于活動(dòng)性持續(xù)的條件對(duì)話框在“試驗(yàn)控制”規(guī)則中,然后取消選中Experiment settings中的Activity analysis(請(qǐng)參閱第100頁(yè)),那么您的規(guī)則將失效�;诨顒�(dòng)連續(xù)性的條件對(duì)話框?qū)哪男蛄兄袆h除,同時(shí)刪除連接箭頭。重新設(shè)計(jì)您的“試驗(yàn)控制”規(guī)則,并連接對(duì)話框之間的箭頭(請(qǐng)參閱第169頁(yè))。
如需了解條件相關(guān)詳細(xì)信息,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)中“條件概述”。
 
7.5 開始-停止試驗(yàn)規(guī)則的示例
 
總則
 
在特定時(shí)間點(diǎn)開始數(shù)據(jù)記錄
您需要在本人不在試驗(yàn)室時(shí)開始記錄,例如:在23:00 h時(shí)。
刪除默認(rèn)的Start track(開始跟蹤)條件(參閱第187頁(yè))。定義一個(gè)Time(時(shí)間)條件(參閱第172頁(yè))。選擇After clock time(時(shí)鐘時(shí)間后)選項(xiàng),并輸入23:00:00,點(diǎn)擊OK,然后將生成的對(duì)話框放置在Start track(開始跟蹤)對(duì)話框前面。
 
在離開試驗(yàn)室之前,按下綠色按鈕以開始試驗(yàn)。該程序?qū)⒌却敝?3:00時(shí)開始數(shù)據(jù)記錄。
 
在最長(zhǎng)持續(xù)時(shí)間過(guò)去之后,停止數(shù)據(jù)記錄。
在緊鄰Stop track(停止跟蹤)對(duì)話框的前面一個(gè)Condition(條件)對(duì)話框中,點(diǎn)擊Settings(設(shè)置)。選擇選項(xiàng)After a delay of,并輸入最長(zhǎng)持續(xù)時(shí)間。
作為使用一個(gè)“時(shí)間”條件的替代選項(xiàng),您也可以使用Maximum trial duration(最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間)選項(xiàng)(參閱第182頁(yè))。
 
開放場(chǎng)地(多活動(dòng)場(chǎng))
 
當(dāng)在開放場(chǎng)地內(nèi)已檢測(cè)到動(dòng)物時(shí),開始數(shù)據(jù)記錄。啟動(dòng)命令分別賦予給每一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)。
在該設(shè)置中,將4個(gè)開放場(chǎng)地分別作為單獨(dú)活動(dòng)場(chǎng)。如果您需要在開放場(chǎng)地內(nèi)檢測(cè)到動(dòng)物時(shí)開始采集(無(wú)論其他活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)發(fā)生什么),該需求可以通過(guò)使用默認(rèn)的開始 - 停止試驗(yàn)規(guī)則而實(shí)現(xiàn)。一旦在一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)檢測(cè)到受試者,該活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)跟蹤開始(而不是其他活動(dòng)場(chǎng))。這樣,您就不必在同一時(shí)間釋放所有動(dòng)物。
Morris水迷宮
 
當(dāng)動(dòng)物已經(jīng)找到平臺(tái)時(shí),停止試驗(yàn)。
在“活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置”中,確保該平臺(tái)已定義為區(qū)域。在“試驗(yàn)控制設(shè)置”中,刪除默認(rèn)的Stop track(停止跟蹤)條件(請(qǐng)參閱第187頁(yè))。接下來(lái),定義一個(gè)In Zone(區(qū)域內(nèi))條件(參閱第172頁(yè))。
如果您需要程序在動(dòng)物一達(dá)到平臺(tái)上就停止記錄,請(qǐng)選擇Frequency(頻率)作為“統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)”,并選擇“>=1”。點(diǎn)擊Settings(設(shè)置),然后選擇該平臺(tái)區(qū)。
有時(shí),動(dòng)物游過(guò)平臺(tái),但并未停留在平臺(tái)上。在這種情形下,盡管動(dòng)物沒(méi)有“發(fā)現(xiàn)”平臺(tái),但程序?qū)⑼V褂涗�。作為選擇頻率的替代選項(xiàng),選擇Current duration(目前持續(xù)時(shí)間)和動(dòng)物必須留在平臺(tái)上的最短時(shí)間(例如:3 s)。點(diǎn)擊Settings(設(shè)置),然后選擇平臺(tái)區(qū)。
 
點(diǎn)擊OK,并放置生成的對(duì)話框在Stop track(停止跟蹤)對(duì)話框前面。
 
當(dāng)老鼠已經(jīng)找到平臺(tái)或者在水迷宮中游泳達(dá)到60秒時(shí),將停止試驗(yàn)。
活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置和條件“老鼠已發(fā)現(xiàn)平臺(tái)”類似上面示例中情形。條件“老鼠游泳60秒”可以理解為“從跟蹤開始延遲≥60秒”。
當(dāng)滿足任一條件時(shí),跟蹤停止。使用OR邏輯組合這兩個(gè)條件(參閱圖7.12)。
這種解決方案導(dǎo)致不同持續(xù)時(shí)間的跟蹤:小于60 s用于找到平臺(tái)的動(dòng)物,而60 s用于其他動(dòng)物。
作為上面示例中兩個(gè)“條件”對(duì)話框的替代選項(xiàng),您也可以定義“區(qū)內(nèi)”條件對(duì)話框,并設(shè)置一個(gè)最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間(參閱第182頁(yè))。
 
 
圖7.12:水迷宮用開始 - 停止試驗(yàn)規(guī)則示例。當(dāng)動(dòng)物已經(jīng)在平臺(tái)區(qū)上連續(xù)至少3秒或者從跟蹤開始已經(jīng)過(guò)去60秒時(shí),試驗(yàn)停止。
A – “區(qū)內(nèi)”條件,規(guī)定動(dòng)物應(yīng)在平臺(tái)區(qū)域上至少持續(xù)3 s。選擇Current duration >=3s(目前持續(xù)時(shí)間≥3 s)。B – “時(shí)間”條件,指定從跟蹤開始延遲60 s。
C - “任意”操作符對(duì)話框。
 
八臂放射狀迷宮
 
當(dāng)10分鐘內(nèi)動(dòng)物已出現(xiàn)在4個(gè)臂內(nèi)時(shí),停止試驗(yàn)。
這可以通過(guò)組合8個(gè)條件實(shí)現(xiàn),也就是說(shuō),該動(dòng)物必須至少達(dá)到4個(gè)臂內(nèi),無(wú)論訪問(wèn)哪個(gè)臂。
1. 建立一個(gè)“區(qū)內(nèi)”條件(參閱第173頁(yè)),指定臂1用頻率應(yīng)≥1,也就是說(shuō),該動(dòng)物必須訪問(wèn)臂1至少一次。為每個(gè)其他臂執(zhí)行相同操作。
 
2. 使用“N of All”操作符并行連接產(chǎn)生的8個(gè)條件對(duì)話框(請(qǐng)參閱圖7.13)。
3. 設(shè)置最長(zhǎng)試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間(參閱第182頁(yè))為10分鐘,當(dāng)動(dòng)物在此期間無(wú)法訪問(wèn)四個(gè)臂時(shí)停止跟蹤。
如需了解“N of All”相關(guān)更多信息,請(qǐng)參閱第178頁(yè)。
圖7.13 - 八臂放射狀迷宮用試驗(yàn)控制序列。當(dāng)動(dòng)物訪問(wèn)四個(gè)臂至少一次時(shí),試驗(yàn)將停止。
1, 2,... 1、2、...8 – “區(qū)內(nèi)”條件對(duì)話框(分別用于臂1、2、...8)8要求。當(dāng)該臂的區(qū)內(nèi)頻率大于或等于1時(shí),一個(gè)條件獲得滿足。A - 操作符,檢查8個(gè)條件中至少4個(gè)條件是否獲得滿足。B – “停止跟蹤”對(duì)話框。當(dāng)4個(gè)條件獲得滿足時(shí),試驗(yàn)將停止。
 
7.6 “試驗(yàn)控制”數(shù)據(jù)分析
 
通過(guò)使用EthoVision分析功能,您可以通過(guò)統(tǒng)計(jì)或時(shí)間繪圖分析一次試驗(yàn)中出現(xiàn)的事件。
試驗(yàn)控制事件 - 例如:何時(shí)條件恰好變?yōu)檎妫?/div>
試驗(yàn)控制狀態(tài) – 為了分析兩個(gè)試驗(yàn)控制事件之間的時(shí)間。例如:從條件激活時(shí)起至條件變?yōu)檎鏁r(shí),經(jīng)過(guò)多少時(shí)間?
通常情形下,執(zhí)行試驗(yàn)控制數(shù)據(jù)分析以為了測(cè)試目的,或者為了分析受試者對(duì)于刺激的反應(yīng)(例如:條件測(cè)試中)。
為了分析試驗(yàn)控制數(shù)據(jù),需要在分析配置文件中選擇Trial Control(控制) event(試驗(yàn)控制事件)以分析簡(jiǎn)單事件,或者選擇Trial Control(控制) state(試驗(yàn)控制狀態(tài))以分析特定事件之間的時(shí)間間隔。接下來(lái),計(jì)算統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(在Analyze菜單中,選擇Calculate Statistics選項(xiàng))或?qū)?shù)據(jù)可視化(在Visualize菜單中,選擇Plot Integrated Data選項(xiàng))。
 
如需了解試驗(yàn)控制數(shù)據(jù)分析相關(guān)詳細(xì)信息,請(qǐng)參閱EthoVision XT試驗(yàn)與硬件控制手冊(cè)中的“試驗(yàn)控制數(shù)據(jù)分析”(本手冊(cè)位于您的安裝DVD上)。
 
如果您需要分析受試者行為,請(qǐng)參閱第14章。
如果您需要計(jì)算試驗(yàn)控制事件所定義的一次跟蹤中部分因變量的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)/可視化數(shù)據(jù),那么您必須首先在Data Profiles(數(shù)據(jù)配置文件)中定義Nesting intervals(嵌套間隔)。參見(jiàn)第473頁(yè)。
 
導(dǎo)出試驗(yàn)控制數(shù)據(jù)
您可以導(dǎo)出試驗(yàn)控制事件(例如:動(dòng)作激活或條件變?yōu)檎妫┖驮囼?yàn)控制狀態(tài)(例如:從動(dòng)作激活至條件變?yōu)檎妫�。詳�?xì)信息請(qǐng)參閱第654頁(yè)。
 
第8章
 
配置檢測(cè)設(shè)置
 
8.1 為什么配置檢測(cè)設(shè)置 196
檢測(cè)設(shè)置簡(jiǎn)短介紹。
8.2 一般程序 198
8.3 方法設(shè)置 201
為了指定EthoVision XT如何檢測(cè)受試者和體位點(diǎn)。
8.4 受試者識(shí)別設(shè)置 203
為了指定EthoVision如何識(shí)別顏色標(biāo)記的單只動(dòng)物。
8.5 視頻設(shè)置 208
采樣率、圖像調(diào)整和活動(dòng)性分析設(shè)置。
8.6 檢測(cè)設(shè)置(檢測(cè)方法) 219
指定EthoVision如何從背景中分離受試者。
8.7 受試者輪廓設(shè)置 234
像素腐蝕和膨脹以光滑受試者的輪廓。
8.8 受試者尺寸設(shè)置 237
為了指定受試者外觀尺寸。包括老鼠行為識(shí)別設(shè)置。
8.9 使用鼻-尾基檢測(cè)開展工作 241
為了優(yōu)化老鼠的鼻尖點(diǎn)和尾基檢測(cè)。
8.10 老鼠行為識(shí)別用檢測(cè)設(shè)置 246
8.11 自定義“檢測(cè)設(shè)置”屏幕 249
另請(qǐng)參閱“管理設(shè)置”和“配置文件”(參閱第663頁(yè))。
 
8.1 為什么配置檢測(cè)設(shè)置
 
EthoVision XT需要一些標(biāo)準(zhǔn)以跟蹤正運(yùn)動(dòng)的受試者。
例如:您需要在灰度或顏色數(shù)值方面指明受試者與背景有什么不同,需要選擇一個(gè)方法從背景中區(qū)分出受試者,需要EthoVision XT以每秒多少幀的速度進(jìn)行分析和設(shè)置平均受試者尺寸。這些標(biāo)準(zhǔn)構(gòu)成您的檢測(cè)設(shè)置。
您可以在相同試驗(yàn)中定義不同檢測(cè)設(shè)置。例如:您可以具有兩組設(shè)置,一組設(shè)置用于檢測(cè)白色動(dòng)物,而另一組檢測(cè)深色動(dòng)物。詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第663頁(yè)。
Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中可用設(shè)置首先取決于EthoVision XT版本。
EthoVision XT Base版本 - 在該版本中,您可以跟蹤單只動(dòng)物身體的中心點(diǎn)。為了檢測(cè)動(dòng)物的身體,4種檢測(cè)方法可用�;A(chǔ)版本也允許跟蹤單只動(dòng)物上的顏色標(biāo)記,在這種情形下,顏色標(biāo)記視為動(dòng)物的中心點(diǎn)。
多體位點(diǎn)模塊 – 通過(guò)使用該附加模塊,您可以跟蹤單只動(dòng)物的中心點(diǎn)、鼻-點(diǎn)和尾-基。為了檢測(cè)多個(gè)體位點(diǎn),三種檢測(cè)方法可用。
社交互動(dòng)模塊 – 該附加模塊允許您在一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)跟蹤兩只或更多動(dòng)物。您可以使用顏色標(biāo)記跟蹤或標(biāo)記輔助跟蹤。您可以組合使用該附加模塊與多體位點(diǎn)模塊,以詳細(xì)研究社交互動(dòng)。
老鼠行為識(shí)別模塊 - 用于自動(dòng)檢測(cè)一些行為,包括站立、梳洗和嗅探。在“檢測(cè)設(shè)置”中,啟用Behavior Settings(行為設(shè)置)。
 
為了跟蹤多個(gè)受試者,您需要仔細(xì)調(diào)整檢測(cè)設(shè)置。確保您按照下述順序遵循“配置檢測(cè)設(shè)置”通用程序(請(qǐng)參閱第4頁(yè)上“通用程序”)。
如果您組合使用多體位點(diǎn)模塊與社交互動(dòng)模塊,我們建議僅從視頻文件進(jìn)行跟蹤。
 
打開檢測(cè)設(shè)置
在打開檢測(cè)設(shè)置之前,確保您擁有有效的活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置。為了打開檢測(cè)設(shè)置,請(qǐng)執(zhí)行下面操作之一:
在Experiment Explorer(實(shí)驗(yàn)瀏覽器)中,點(diǎn)擊文件夾Detection Settings,將其展開,然后點(diǎn)擊一個(gè)“檢測(cè)設(shè)置”打開Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)屏幕。
在Setup(設(shè)置)菜單中,選擇Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)。選擇Open(打開),從列表中選擇一個(gè)“檢測(cè)設(shè)置”,然后點(diǎn)擊OK。
結(jié)果 – Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)屏幕打開。在默認(rèn)情形下,顯示Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口、Video Source(視頻源)和Playback Control(重播控制)窗口。您可以使用組件工具欄上的Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,以更改視圖設(shè)置。
檢測(cè)設(shè)置窗口
根據(jù)每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)的受試者數(shù)量和試驗(yàn)設(shè)置中所選的跟蹤特征(請(qǐng)參閱第91頁(yè)),Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置窗口)布局有所不同。
 
圖8.1 - Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口。字母闡釋請(qǐng)參閱文本。
 
Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口包含下面部分(另請(qǐng)參閱圖8.1):
方法(A) - 該部分包含受試者檢測(cè)方法、鼻-尾基檢測(cè)(如適用)以及使用一個(gè)掃描窗口和應(yīng)用標(biāo)記輔助跟蹤的選項(xiàng)。
檢測(cè)(B) - 在該部分中,您將配置受試者檢測(cè)設(shè)置。
受試者識(shí)別(C) - 僅具有多只動(dòng)物時(shí)該部分可用。
視頻(D) - 在該選項(xiàng)中,如果您從視頻進(jìn)行跟蹤,可以選擇您的視頻;如果執(zhí)行實(shí)時(shí)跟蹤,可以調(diào)整視頻設(shè)置,設(shè)置采樣率和Smoothing(平滑)設(shè)置,并為活動(dòng)性分析選擇設(shè)置。
受試者尺寸(E) - 在該部分中,您可以為一只或多只動(dòng)物設(shè)置受試者尺寸。您還可以為老鼠行為識(shí)別(啟用時(shí))設(shè)置重要參數(shù)。
受試者輪廓(F) - 在該選項(xiàng)中,您可以腐蝕和膨脹已檢測(cè)到的身體,以優(yōu)化檢測(cè)。
 
8.2 一般程序
 
您可以使用預(yù)定義的模板,用于對(duì)常用試驗(yàn)配置自動(dòng)配置檢測(cè)設(shè)置(請(qǐng)參閱第90頁(yè)上“依據(jù)預(yù)定義的模板創(chuàng)建一個(gè)新試驗(yàn)”)。在執(zhí)行該操作之后,在您能夠正確跟蹤任何動(dòng)物之前,仍然必須調(diào)整檢測(cè)設(shè)置(如本章中所述)。
 
在整個(gè)試驗(yàn)時(shí)間內(nèi),如果視頻圖像中的受試者和背景之間具有良好反差,表明受試者檢測(cè)進(jìn)行良好。增加對(duì)比度(例如:通過(guò)改變背景,盡可能促使背景顏色與受試者顏色存在最大偏差)遠(yuǎn)比任何檢測(cè)設(shè)置更為有效。
 
務(wù)必確保遵循下述步驟順序。如果一個(gè)特定步驟并不適用于您的設(shè)置,請(qǐng)繼續(xù)下一個(gè)步驟。
 
試驗(yàn)設(shè)置
在Experiment Settings(試驗(yàn)設(shè)置)窗口中(另請(qǐng)參閱第91頁(yè)):
1. 選擇受試者數(shù)量/活動(dòng)場(chǎng)。
 
2. 從“檢測(cè)功能”選項(xiàng)卡中選擇一個(gè)選項(xiàng)。
 
方法部分 - 1
Method(方法)部分中可用方法和選項(xiàng)取決于試驗(yàn)設(shè)置。
3. 執(zhí)行下面選擇:
- 使用掃描窗口 – 當(dāng)您正配置檢測(cè)設(shè)置時(shí),請(qǐng)確保該選項(xiàng)未選中。
- 標(biāo)記輔助跟蹤 - 當(dāng)您想在同一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)跟蹤多只動(dòng)物時(shí),選擇該選項(xiàng)。在所有其他情形下,請(qǐng)轉(zhuǎn)至第5步。
→ 請(qǐng)參閱第202頁(yè)
 
受試者識(shí)別部分
4. 如果每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)具有多個(gè)受試者,您可以使用受試者識(shí)別,您可以在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇顏色標(biāo)記跟蹤(將標(biāo)記作為中心點(diǎn))或者在“檢測(cè)設(shè)置”中選擇標(biāo)記輔助跟蹤。
→ 請(qǐng)參閱第203頁(yè)
 
視頻部分
5. 在Video(視頻)部分中,您可以具有下面選項(xiàng):
- 選擇視頻(僅當(dāng)您從視頻進(jìn)行跟蹤時(shí)) - 如果未自動(dòng)選擇,請(qǐng)點(diǎn)擊該按鈕,然后瀏覽您的視頻。
- 圖像(僅當(dāng)您執(zhí)行實(shí)時(shí)跟蹤時(shí))。點(diǎn)擊該按鈕,以調(diào)整攝像機(jī)設(shè)置。根據(jù)您的攝像機(jī)或抓幀器板,某些選項(xiàng)可能呈現(xiàn)灰色。
- 采樣率 - 采樣率即您希望EthoVision XT有效分析的視頻圖像數(shù)量/秒。
- (Smoothing)平滑 - 選擇您需要的選項(xiàng)。
- 活動(dòng)性(僅當(dāng)您在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇Activity analysis選項(xiàng)時(shí)可用) - 點(diǎn)擊該按鈕,以創(chuàng)建和預(yù)覽活動(dòng)性分析設(shè)置。
→ 請(qǐng)參閱第208頁(yè)
 
方法部分 - 2
Method(方法)部分中可用方法和選項(xiàng)取決于試驗(yàn)設(shè)置。
6. 選擇下面選項(xiàng)之一:
- 方法 - 必須始終選擇這些受試者檢測(cè)方法(灰度標(biāo),參閱第220頁(yè);靜態(tài)減法,參閱第221頁(yè);動(dòng)態(tài)減法,第226頁(yè);差分,參閱第230頁(yè))。
 
-鼻-尾檢測(cè) - 這些鼻-尾檢測(cè)方法[基于形狀(XT4)、基于模型(XT5)和基于高級(jí)模型(XT6)]僅下面情形下可用:在“試驗(yàn)設(shè)置”中,為單只動(dòng)物選擇中心點(diǎn)、鼻-點(diǎn)和尾-基檢測(cè)。
 
如果您在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇中心點(diǎn)、鼻-點(diǎn)和尾-基檢測(cè),并且每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)具有2個(gè)或更多受試者,鼻-尾檢測(cè)將自動(dòng)設(shè)置為基于高級(jí)模型(XT6),因此不顯示鼻-尾檢測(cè)方法。
 
→ 檢測(cè)方法請(qǐng)參閱第219頁(yè)和鼻-尾檢測(cè)方法請(qǐng)參閱第241頁(yè)
 
 
檢測(cè)部分
7. 在Detection(檢測(cè))部分中,您可以配置在上一步中選擇的受試者檢測(cè)方法(灰度標(biāo),參閱第220頁(yè);靜態(tài)減法,參閱第221頁(yè);動(dòng)態(tài)減法,參閱第226頁(yè);差分,參閱第230頁(yè))。
→ 請(qǐng)參閱第220頁(yè)
 
 
受試者輪廓
8. 在Subject Contour(受試者輪廓)部分中,設(shè)置“腐蝕”和“膨脹”水平。
 
→ 請(qǐng)參閱第234頁(yè)
 
受試者尺寸
9. 在Subject Size(受試者尺寸)部分中,點(diǎn)擊Edit(編輯)按鈕以設(shè)置:
- 檢測(cè)到的受試者尺寸 – 在此您可以設(shè)置最小和最大受試者尺寸。
- 建模的受試者尺寸 - 當(dāng)您具有多個(gè)受試者或者為一個(gè)或多個(gè)受試者使用基于高級(jí)模型的鼻-尾檢測(cè)方法(XT6)時(shí),在此您可以模擬受試者尺寸。
- 受試者尺寸高級(jí)設(shè)置 - 在該選項(xiàng)中,如果您具有多個(gè)受試者,或者為一個(gè)或多個(gè)受試者使用基于高級(jí)模型的鼻-尾檢測(cè)方法(XT6)時(shí),您可以設(shè)置最大干擾尺寸、形狀穩(wěn)定性和建模工作。
點(diǎn)擊Behavior按鈕(如果存在),以為老鼠行為識(shí)別獲取尺寸和形狀參數(shù)。
10. 一旦明確檢測(cè)到受試者,在Method(方法)部分中,選擇“使用掃描窗口”(請(qǐng)參閱第202頁(yè)),然后點(diǎn)擊OK。
→ 請(qǐng)參閱第237頁(yè)
 
現(xiàn)在,您可以準(zhǔn)備獲取數(shù)據(jù)(請(qǐng)參閱第9章)。
 
注釋
每當(dāng)在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中應(yīng)用改變時(shí),您可以在Video Source(視頻源)窗口中看到改變結(jié)果。
為了保存檢測(cè)設(shè)置,請(qǐng)點(diǎn)擊該窗口底部處Save Changes(保存更改)按鈕。如果您已作出多次更改,并且想返回到上次保存的設(shè)置,請(qǐng)點(diǎn)擊Undo Changes(撤消更改)按鈕。
EthoVision XT提供與檢測(cè)質(zhì)量有關(guān)的一些實(shí)時(shí)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),當(dāng)您調(diào)整檢測(cè)設(shè)置時(shí)可以檢查這些統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。
請(qǐng)記�。涸�“檢測(cè)設(shè)置”中的檢測(cè)為實(shí)時(shí)檢測(cè),然而,當(dāng)在采集期間使用檢測(cè)確定速度(參閱第280頁(yè))時(shí),檢測(cè)質(zhì)量可能更好!
 
8.3 方法設(shè)置
 
檢測(cè)方法請(qǐng)參閱第219頁(yè)。
 
標(biāo)記輔助跟蹤
 
什么時(shí)候使用標(biāo)記輔助跟蹤?
如果您具有多個(gè)受試者,并且沒(méi)有選擇顏色標(biāo)記跟蹤,那么可以在“試驗(yàn)設(shè)置”中使用標(biāo)記輔助跟蹤(參閱第91頁(yè))。
“標(biāo)記輔助跟蹤”為用于老鼠的優(yōu)化選項(xiàng)。
 
如何使用標(biāo)記輔助跟蹤?
在“檢測(cè)設(shè)置”窗口的Method(方法)部分中,選擇Marker assisted tracking(標(biāo)記輔助跟蹤)復(fù)選框�,F(xiàn)在,Subject Identification(受試者標(biāo)識(shí))部分中的Identification(識(shí)別)按鈕變?yōu)閱⒂谩?/div>
請(qǐng)遵照下面Subject Identification(受試者標(biāo)識(shí))部分中的步驟,以設(shè)置標(biāo)記輔助跟蹤。
另請(qǐng)參閱第207頁(yè)上的標(biāo)記跟蹤提示。
 
當(dāng)您沒(méi)有選擇Marker assisted tracking(標(biāo)記輔助跟蹤)復(fù)選框時(shí),您將進(jìn)行無(wú)標(biāo)記跟蹤。當(dāng)您按照組級(jí)別分析變量(因此動(dòng)物識(shí)別并不重要),或者當(dāng)動(dòng)物無(wú)法觸及時(shí),您可以執(zhí)行無(wú)標(biāo)記跟蹤。
 
 
標(biāo)記輔助跟蹤和顏色標(biāo)記跟蹤之間的區(qū)別是什么?
通過(guò)使用“標(biāo)記輔助跟蹤”,EthoVision可以跟蹤動(dòng)物身體,并使用該標(biāo)記確定動(dòng)物的身份。當(dāng)您使用顏色標(biāo)記跟蹤時(shí),EthoVision僅跟蹤該標(biāo)記。
通過(guò)使用顏色標(biāo)記跟蹤,您可以跟蹤任何物種(可標(biāo)記),而“標(biāo)記輔助跟蹤”為僅用于老鼠的優(yōu)化選項(xiàng)。通過(guò)使用顏色標(biāo)記跟蹤,僅記錄標(biāo)記位置。動(dòng)物實(shí)際形狀和尺寸將忽略。
為了使用顏色標(biāo)記跟蹤,在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇“顏色標(biāo)記跟蹤”(標(biāo)記視為中心點(diǎn)),請(qǐng)參閱第100頁(yè)。接下來(lái),在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,調(diào)整Subject Identification(受試者識(shí)別)和Video(視頻)設(shè)置(參閱第203頁(yè)和第208頁(yè))。
另請(qǐng)參閱第207頁(yè)上的標(biāo)記跟蹤提示。
 
 
 
使用掃描窗口
當(dāng)選擇Use scan window(使用掃描窗口)時(shí),Ethovision XT發(fā)現(xiàn)受試者,“跟隨”受試者,并在下一個(gè)視頻圖像中僅立即搜索該受試者的周圍區(qū)域。因此,掃描窗口隨著受試者移動(dòng)。
 
僅已完成檢測(cè)設(shè)置配置之后,方可選擇Scan window(掃描窗口)。當(dāng)您正在配置檢測(cè)設(shè)置時(shí),不得選擇Scan window(掃描窗口)。
 
 
為什么要使用掃描窗口?
掃描窗口用于兩個(gè)目的:
 
為了降低反射問(wèn)題 - 如果在掃描窗口之外出現(xiàn)一個(gè)反射(例如:水迷宮中的波浪),將忽略該反射,從而減少檢測(cè)誤差。然而,將努力改善照明以消除反射(請(qǐng)參閱第58頁(yè))。
為了提高采樣率且無(wú)遺漏樣本 – 通過(guò)使用掃描窗口,電腦可以利用視頻圖像中小部分處理數(shù)據(jù)。這降低處理器平均負(fù)荷,因此可以提高采樣率,如必要,同時(shí)不遺漏樣本(記�。禾幚砥髫�(fù)荷越高,更可能跳過(guò)樣本)。
受試者丟失 - 當(dāng)受試者從掃描窗口內(nèi)消失時(shí),EthoVision XT掃描整個(gè)活動(dòng)場(chǎng),以再次找到受試者,然后重新定位掃描窗口在新位置上方。
對(duì)于EthoVision先前版本的用戶 - 掃描窗口尺寸由程序自動(dòng)確定,并在采集期間根據(jù)受試者尺寸而修改。因此,您無(wú)需指定掃描窗口尺寸。
 
 
 
 
8.4 受試者識(shí)別設(shè)置
 
 
受試者識(shí)別
您可以為標(biāo)記輔助跟蹤或顏色標(biāo)記跟蹤執(zhí)行下述規(guī)程。
1. 將標(biāo)記的動(dòng)物放在活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)或播放視頻。優(yōu)化攝像機(jī)設(shè)置(參閱第55頁(yè))、照明條件(參閱第58頁(yè))和標(biāo)記特性(參閱第207頁(yè))。
 
 
確保在視頻中選擇一個(gè)適當(dāng)點(diǎn),在該點(diǎn)處動(dòng)物不會(huì)彼此接觸!
如果您使用多體位點(diǎn)檢測(cè),該點(diǎn)處無(wú)法正確識(shí)別鼻尖很正常。
 
2. 在Subject Identification(受試者識(shí)別)部分中,點(diǎn)擊一個(gè)受試者的名稱,然后點(diǎn)擊Identification(識(shí)別)按鈕。
結(jié)果 – Identification of Subject #(受試者識(shí)別編號(hào))窗口和Marker detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口打開。
您應(yīng)通過(guò)拖動(dòng)Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口右下角放大該窗口。
3. 將鼠標(biāo)指針移動(dòng)到Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口,至指針變成滴管狀。
4. 將該滴管移動(dòng)到待識(shí)別受試者的顏色標(biāo)記上方(參閱下圖),然后點(diǎn)擊鼠標(biāo)左鍵。
 
Identification(識(shí)別)窗口現(xiàn)在顯示您剛選擇的顏色,并且具有初始顏色的像素突出顯示在Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口中。在Identification(識(shí)別)窗口中,您可以更改下面參數(shù)(另請(qǐng)參閱圖8.2):
- Hue(色調(diào)) - 色調(diào)為標(biāo)記顏色的主波長(zhǎng),并代表日常生活中常見(jiàn)顏色(紅、綠和藍(lán)等)。顯示已拾取顏色的色調(diào)值范圍,并且該范圍由右側(cè)垂直顏色條上的框塊表示。
- Saturation(飽和度) - 飽和度表示一種顏色純度。當(dāng)一種純色與白色混合時(shí),飽和度將降低,“紅”具有高飽和度,“粉紅色”具有較低飽和度。顯示飽和度值范圍,并且該范圍由顏色圖上的框塊寬度表示。
- Brightness(亮度) - 亮度(或強(qiáng)度)表示由帶色表面所反射的光量。顯示飽和度值范圍,并且該范圍由顏色圖上的框塊寬度表示。如果您設(shè)定該范圍太寬,將無(wú)法很好地區(qū)分顏色。
如果根本未檢測(cè)到標(biāo)記,或者沒(méi)有在活動(dòng)場(chǎng)的所有區(qū)域內(nèi)檢測(cè)到標(biāo)記,可以稍微擴(kuò)大色調(diào)、飽和度和亮度范圍。
可以侵蝕或膨脹已檢測(cè)到的標(biāo)記,以補(bǔ)償特定場(chǎng)景。例如:如果標(biāo)記遭受籠架部分遮擋,您可以膨脹該標(biāo)記,或者可以使用侵蝕將標(biāo)記變圓,這將防止中心點(diǎn)抖動(dòng)。
 
 
請(qǐng)參閱“顏色微調(diào)設(shè)置”(第205頁(yè))。
 
 
圖8.2 – Identification(識(shí)別)窗口及其與HSI顏色模型的關(guān)系。A = 顏色條:該框代表色調(diào),該色調(diào)對(duì)應(yīng)HIS顏色模型中的圓環(huán)上一個(gè)角度(例如:0度表示紅色,240度表示藍(lán)色)。B = 顏色圖:該框高度代表亮度(或強(qiáng)度)范圍,該范圍對(duì)應(yīng)顏色圓環(huán)垂直位置。該框?qū)挾却盹柡投确秶�,該范圍�?duì)應(yīng)中心與邊緣之間的圓環(huán)上水平位置。
 
 
顏色微調(diào)設(shè)置
當(dāng)您第一次在Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口拾取標(biāo)記顏色時(shí),EthoVision選擇視頻圖像中的所有像素,并具有相同初始顏色。具有該初始顏色的像素組通過(guò)一根輪廓線(具有對(duì)比顏色)突出顯示。由于視頻圖像中一個(gè)標(biāo)記可能包含相同顏色的不同色度,因此,最初選擇的標(biāo)記很可能并非最終標(biāo)記(請(qǐng)參閱圖8.3)。
 
圖8.3顯示部分Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口和部分Identification(識(shí)別)窗口。
 
 
圖8.3 - Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口中拾取的初始顏色(左圖)和Identification(識(shí)別)窗口中相應(yīng)顏色設(shè)置色調(diào)、飽和度和亮度的范圍。箭頭指示框塊變化如何改變相應(yīng)的顏色設(shè)置。
 
通過(guò)在Identification(識(shí)別)窗口中調(diào)整Hue(色調(diào))、Saturation(飽和度)和Brightness(亮度),您可以微調(diào)顏色設(shè)置。
5. 通過(guò)改變數(shù)值或調(diào)整垂直顏色條上的色調(diào)框,或者調(diào)整/移動(dòng)顏色圖中的框塊(水平方向用于調(diào)整飽和度,垂直方向用于調(diào)節(jié)亮度),可以更改顏色設(shè)置范圍。作為結(jié)果,輪廓線覆蓋(幾乎)整個(gè)標(biāo)記(請(qǐng)參閱圖8.4)。
 
 
 
圖8.4 - 顏色設(shè)置微調(diào)之后的標(biāo)記顏色。如白色輪廓線所示,標(biāo)記中大部分現(xiàn)在已獲得選擇(另請(qǐng)參閱圖8.3)
 
6. 接著,播放視頻,以在Marker Detection(標(biāo)記檢測(cè))窗口中查看是否在活動(dòng)場(chǎng)的不同部分內(nèi)已正確檢測(cè)到該標(biāo)記。
如果標(biāo)記“跳動(dòng)”,表明您的顏色設(shè)置過(guò)于敏感。返回到第5步,擴(kuò)大該框塊。
7. 繼續(xù)設(shè)置下面內(nèi)容:
- 標(biāo)記侵蝕 - 設(shè)置需要侵蝕的像素?cái)?shù)量。通過(guò)首先選擇Erode(侵蝕),然后選擇Dilate(膨脹),您可以使標(biāo)記更圓,以防止標(biāo)記中心點(diǎn)開始抖動(dòng)。
- 標(biāo)記膨脹 - 設(shè)置需要膨脹的像素?cái)?shù)。通過(guò)首先選擇Dilate(膨脹),然后選擇erode(侵蝕),您可以防止標(biāo)記遭受諸如活動(dòng)場(chǎng)頂部上方網(wǎng)格遮擋或者分成兩個(gè)單獨(dú)標(biāo)記。
- 最小標(biāo)記尺寸 - 設(shè)置最小標(biāo)記尺寸,防止將檢測(cè)到的干擾作為標(biāo)記。首先,增加最小標(biāo)記尺寸,直至不會(huì)再檢測(cè)不到干擾。接著,為最小標(biāo)記尺寸輸入一個(gè)數(shù)值,該數(shù)值介于閥值下限與目前標(biāo)記尺寸值之間。
- 標(biāo)記指針 - 從列表中選擇一個(gè)標(biāo)記指針。通過(guò)使用相對(duì)較小的標(biāo)記,可用于選擇十字線。
8. 當(dāng)您完成操作時(shí),點(diǎn)擊OK。
對(duì)于您需要識(shí)別的所有受試者,重復(fù)第2步 – 第8步。
 
 
 
標(biāo)記跟蹤提示
 
顏色特性
使用一個(gè)色標(biāo)(例如:由涂料公司提供),以找出在您的設(shè)置和照明條件下最易由EthoVision識(shí)別的顏色。在應(yīng)用顏色標(biāo)記到動(dòng)物之前執(zhí)行該操作。
使用具有不同色調(diào)值的顏色。例如:使用紅色和綠色,而非紅色和橙色。
避免使用紅色標(biāo)記可能可取,因?yàn)榧t色看起來(lái)似血。
注意:當(dāng)標(biāo)記動(dòng)物時(shí),可能會(huì)使動(dòng)物緊張,從而影響動(dòng)物行為。如有必要,確保選擇一個(gè)持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng)的標(biāo)記方法。
 
標(biāo)記特性
確保標(biāo)記盡可能成圓形,從而保證:當(dāng)標(biāo)記邊緣由于姿勢(shì)變化或其他原因而變化時(shí),該標(biāo)記的重心相對(duì)運(yùn)動(dòng)在所有方向上均相同。對(duì)于顏色標(biāo)記跟蹤,這將有助于防止標(biāo)記抖動(dòng)。
當(dāng)您使用標(biāo)記輔助跟蹤時(shí),確保標(biāo)記不要過(guò)大,否則,標(biāo)記可能會(huì)干擾身體輪廓的正常檢測(cè)。例如:確保一只白色動(dòng)物上的深色標(biāo)記不會(huì)覆蓋該動(dòng)物的整個(gè)寬度,否則,可能會(huì)導(dǎo)致身體分成二個(gè)部分。
 
照明條件
如果可能,應(yīng)使用一臺(tái)敏感型攝像機(jī)。如果光照強(qiáng)度低,將很難區(qū)分不同顏色。如果在您的設(shè)置中無(wú)法使用一臺(tái)敏感型攝像機(jī)或強(qiáng)光照度,請(qǐng)嘗試使用熒光標(biāo)記顏色以及紫外線照明。
為了獲得最佳的色彩分離,請(qǐng)使用色溫上接近日光的燈具(即具有廣泛光譜范圍)照亮您的設(shè)置。
 
受試者角色
Subject Identification(受試者標(biāo)識(shí))部分中的選項(xiàng)卡Subjects(受試者)下的名稱為輸入到“試驗(yàn)設(shè)置”中的受試者角色(請(qǐng)參閱第91頁(yè))。您可以使用受試者角色“對(duì)照”和“已治療”,例如:計(jì)劃在一些試驗(yàn)中給對(duì)照動(dòng)物賦上藍(lán)色標(biāo)記,并在其他試驗(yàn)中給已治療動(dòng)物賦上藍(lán)色標(biāo)記。為了做到這一點(diǎn),請(qǐng)定義多組“檢測(cè)設(shè)置”,其中一組設(shè)置用于各標(biāo)記顏色及治療水平的任意組合。在采集數(shù)據(jù)之前,請(qǐng)確保您使用對(duì)應(yīng)于目前動(dòng)物的“檢測(cè)設(shè)置”。
 
8.5 視頻設(shè)置
 
采樣率
采樣率即指EthoVision分析圖像以查找受試者的速率。采樣率以樣本/秒表示。
 
當(dāng)選擇某一特定采樣率時(shí),并不意味著程序可以始終按照該速率分析數(shù)據(jù)。如果電腦處理器負(fù)荷過(guò)高,EthoVision XT可能會(huì)跳過(guò)樣本而分析下一個(gè)樣本。跳過(guò)樣本會(huì)導(dǎo)致遺漏樣本(參閱下文)。
最大采樣率為根據(jù)您視頻的TV標(biāo)準(zhǔn)所設(shè)置的幀率。對(duì)于PAL視頻,幀率為25幀/秒,因此最大采樣率為25個(gè)樣本/秒。對(duì)于NTSC視頻,最大采樣率為29.97個(gè)樣本/秒。
EthoVision XT中所設(shè)置的采樣率僅可為幀率除以一個(gè)整數(shù)。例如:對(duì)于PAL視頻,采樣率應(yīng)為25、12.5、8.33等。
 
有些數(shù)碼攝像機(jī)支持非常高的幀率。然而,這需要大量的處理器容量。為了防止EthoVision XT在進(jìn)行實(shí)況跟蹤時(shí)遺漏樣本,不要將幀率和采樣率設(shè)置太高。在跟蹤之后,在“試驗(yàn)列表”中檢查遺漏樣本率(請(qǐng)參閱第263頁(yè)),以確保EthoVision XT可以處理選定的幀率。
 
 
最佳采樣率是什么?
設(shè)定正確的采樣率非常重要。如果采樣率過(guò)高,將拾取動(dòng)物細(xì)微運(yùn)動(dòng)所造成的干擾,從而過(guò)高估計(jì)因變量(例如:移動(dòng)距離)。如果采樣率太低,將丟失數(shù)據(jù),從而會(huì)低估移動(dòng)距離。
 
如果同時(shí)選擇鼻尾跟蹤和標(biāo)記輔助跟蹤,我們建議采用12.5個(gè)樣本/秒的采樣率。
對(duì)于老鼠行為識(shí)別,請(qǐng)選擇25 - 31幀/秒之間的采樣率。
 
下表給出一些通用推薦值(摘自于已發(fā)表的文獻(xiàn))。這些采樣率已成功用于使用先前EthoVision版本跟蹤動(dòng)物。然而,我們強(qiáng)烈建議:根據(jù)您的特定設(shè)置和動(dòng)物,確定最佳采樣率(參閱下文)。注意:例如,如果您的治療會(huì)導(dǎo)致極度活躍,則與嗜睡動(dòng)物相比,您將應(yīng)用更高采樣率到亢進(jìn)動(dòng)物。
 
動(dòng)物 采樣率(樣本/秒)
雀鯛 5
金魚
0.5
斑馬魚幼體(模擬攝像機(jī)) 25
斑馬魚幼體(FireWire攝像機(jī)) 30 or 60*
小虱 1
 
 
鼠標(biāo) 12
寄生蜂 2
5
嚙齒類動(dòng)物的鼻子 25(PAL)30(NTSC)
虱子 3
樹嗣(樹鼩) 6-12
* 對(duì)于快速移動(dòng),您可能希望使用更高采樣率進(jìn)行跟蹤。這取決于跟蹤的受試者數(shù)量、視頻分辨率、攝像機(jī)設(shè)置和電腦處理器速度是否可行。
 
最佳采樣率為滿足下面條件的最小采樣率:提供因變量(距離、速度等)準(zhǔn)確估算,同時(shí)不包括因“實(shí)際”運(yùn)動(dòng)之外的似動(dòng)現(xiàn)象引起的冗余信息。例如:當(dāng)一只動(dòng)物在一條直線上行走時(shí),由于受試者的中心點(diǎn)每一步均側(cè)向偏移,因此數(shù)據(jù)點(diǎn)始終不會(huì)處于一條直線內(nèi)。為了區(qū)分“實(shí)際”運(yùn)動(dòng)與上述似動(dòng)現(xiàn)象,您可以使用最大或較低采樣率計(jì)算因變量(如移動(dòng)距離)。
1. 創(chuàng)建新的“檢測(cè)設(shè)置”(請(qǐng)參閱第198頁(yè)),并規(guī)定最大采樣率(25或29.97,這取決于電視標(biāo)準(zhǔn))。當(dāng)使用FireWire攝像機(jī)時(shí),該采樣率可能會(huì)更高。然而,無(wú)論其是否取決于電腦性能、跟蹤的動(dòng)物數(shù)量和視頻分辨率。
2. 開始“采集”,并通過(guò)這些“檢測(cè)設(shè)置”采集數(shù)據(jù)(請(qǐng)參閱第10章)。
3. 計(jì)算您感興趣的因變量(請(qǐng)參閱第19章)。導(dǎo)出示例數(shù)據(jù)至Excel(參閱第653頁(yè)),并遵照采樣率繪制因變量值。在下面示例中,使用移動(dòng)距離。
4. 通過(guò)選擇較小采樣率,重復(fù)第1步至第3步。
一旦數(shù)據(jù)繪制完成(如圖8.5所示),應(yīng)具有一個(gè)采樣率范圍,在該范圍內(nèi)因變量不會(huì)太大改變(穩(wěn)定狀態(tài))。這意味著,采樣率微小變化不會(huì)導(dǎo)致信息丟失或增加冗余信息(干擾和諸如身體擺動(dòng)的活動(dòng))。
 
 
圖8.5 - 通過(guò)利用不同采樣率記錄的移動(dòng)距離收集檢測(cè)最佳采樣率。
 
由于原始路徑彎曲已消除,因此低采樣率會(huì)導(dǎo)致有用信息丟失。因此,總移動(dòng)距離通常會(huì)降低(參閱下圖)。
 
高采樣率導(dǎo)致冗余信息采集。在身體搖動(dòng)的情形下,假設(shè)動(dòng)物正沿著直線運(yùn)動(dòng),則身體中心的側(cè)身偏移會(huì)導(dǎo)致整個(gè)移動(dòng)距離長(zhǎng)于“實(shí)際”距離。
 
 
通過(guò)使用Track Smoothing(跟蹤平滑)(請(qǐng)參閱第401頁(yè)),您可以篩選掉身體擺動(dòng)所導(dǎo)致的“干擾”。
 
缺失樣本
實(shí)際采樣率可能會(huì)比設(shè)定的最大采樣率低,因?yàn)樵谇耙粓D像處理完之前,無(wú)法捕捉下一圖像。如果定義的采樣率過(guò)高,EthoVision將遺漏樣本(最高1%可接受),并且處理器負(fù)荷會(huì)很高。遺漏樣本率顯示在“分析結(jié)果與評(píng)分”面板(請(qǐng)參閱第251頁(yè))和“試驗(yàn)列表”中,作為一個(gè)“系統(tǒng)變量”(請(qǐng)參閱第262頁(yè))。通過(guò)使用連續(xù)變量(例如:速度)的數(shù)量統(tǒng)計(jì),您可以計(jì)算采集跟蹤中遺漏樣本的數(shù)量。如果處理器負(fù)荷大于100,并且存在大量遺漏值,應(yīng)降低采樣率。下面因素可以導(dǎo)致處理器負(fù)荷過(guò)高:
電腦內(nèi)存、處理器速度和視頻卡容量 - 請(qǐng)參閱第38頁(yè)上的系統(tǒng)要求。在一般情形下,使用具有雙核CPU的電腦有助于更高采樣率開展工作(相對(duì)于普通電腦)。
安裝的其他程序 – 不得安裝其他視頻軟件(例如:視頻編輯程序、DVD刻錄軟件),否則,會(huì)干擾EthoVision的視頻處理,并導(dǎo)致性能降低。
其他程序正在運(yùn)行 - 確保您關(guān)閉所有其他程序,包括后臺(tái)內(nèi)運(yùn)行的程序,例如:電子郵件程序和病毒掃描程序。這些程序通常顯示在您屏幕右下角的系統(tǒng)托盤中。
Windows經(jīng)典 – 當(dāng)使用Windows 7時(shí),如果設(shè)置Windows主題為Windows經(jīng)典,性能將大大提高。
圖像分辨率 - 對(duì)于現(xiàn)場(chǎng)視頻跟蹤,在“試驗(yàn)設(shè)置”中,您可以為您的視頻圖像選擇分辨率(請(qǐng)參閱第95頁(yè))。
活動(dòng)場(chǎng)尺寸 - 盡可能減小活動(dòng)場(chǎng)尺寸(但包括動(dòng)物可能處于其中的整個(gè)區(qū)域)。
活動(dòng)場(chǎng)數(shù)量 - 如果執(zhí)行實(shí)況跟蹤,并在一次試驗(yàn)中使用四個(gè)上面區(qū)域,請(qǐng)首先檢查無(wú)樣本遺漏。如果樣本遺漏數(shù)量過(guò)高,應(yīng)首先制作一份MPEG-4文件(但需要具有已安裝在電腦上的Picolo Diligent板卡),然后從該文件開始執(zhí)行跟蹤。更普遍的是,如果從視頻文件執(zhí)行跟蹤,只要您選擇Detection determines speed(檢測(cè)測(cè)定速度)選項(xiàng)(請(qǐng)參閱第280頁(yè)),活動(dòng)場(chǎng)數(shù)量絕對(duì)不會(huì)構(gòu)成問(wèn)題。
當(dāng)進(jìn)行檢測(cè)設(shè)置時(shí),您可以使用僅具有一個(gè)區(qū)域的活動(dòng)場(chǎng)定義開始,其速度隨著檢測(cè)流程上升。當(dāng)您為一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)完成檢測(cè)設(shè)置的配置時(shí),您可以添加其他設(shè)置到該活動(dòng)場(chǎng)定義。
顯示選項(xiàng) - 通過(guò)盡量減少待顯示的跟蹤特征數(shù)量(參閱第250頁(yè))和關(guān)閉“分析結(jié)果與評(píng)分”面板(參閱第285頁(yè)),您可以降低處理器負(fù)荷。
 
實(shí)時(shí)分析 - 隱藏“分析結(jié)果與評(píng)分”面板能夠節(jié)省處理器的功率。
檢測(cè)方法 - 如果可能,使用“灰度標(biāo)度”方法,該方法相對(duì)于靜態(tài)減除法處理器負(fù)荷需求更低。相當(dāng)于動(dòng)態(tài)減除法和差分法,靜態(tài)減除法在處理器負(fù)荷需求方面更低。
供受試者搜索的區(qū)域 - 如果您無(wú)法達(dá)到最佳采樣率,請(qǐng)確保選擇使用Use scan window(使用掃描窗口)選項(xiàng)(請(qǐng)參閱第202頁(yè)),但應(yīng)完成檢測(cè)設(shè)置的配置之后進(jìn)行。
 
在采集之后,作為一個(gè)“系統(tǒng)變量”,可以在“試驗(yàn)列表”中查看遺漏樣本比例(請(qǐng)參閱第9章)。
 
 
從視頻文件中執(zhí)行跟蹤
通過(guò)選擇Detection determines speed(檢測(cè)確定速度)選項(xiàng)(請(qǐng)參閱第280頁(yè)),您可以切換EthoVision實(shí)時(shí)(1x)采集數(shù)據(jù)的速度到電腦可達(dá)到的最高速度。該選項(xiàng)允許您:
確保當(dāng)視頻幀率比處理器能夠處理的幀率更快時(shí),不會(huì)丟失任何幀。按照比實(shí)時(shí)更慢的速度播放視頻,同時(shí)不會(huì)遺漏樣本。
當(dāng)視頻幀速率比處理器可以處理的速率更慢時(shí),采集數(shù)據(jù)比實(shí)時(shí)更快。
 
選擇視頻
如果從視頻中執(zhí)行跟蹤,您可能需要從創(chuàng)建“活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置”用視頻之外的一個(gè)視頻中采集數(shù)據(jù)。在默認(rèn)情形下,“檢測(cè)設(shè)置”使用從“活動(dòng)場(chǎng)設(shè)置”中捕捉到一個(gè)背景圖像的視頻。如果您需要從另一視頻文件執(zhí)行跟蹤,請(qǐng)點(diǎn)擊Video(視頻)選項(xiàng)卡下Select Video(選擇視頻)選項(xiàng)。瀏覽到您的視頻位置,然后點(diǎn)擊Open(打開)。僅您從“試驗(yàn)設(shè)置”內(nèi)的視頻文件選擇跟蹤時(shí)該選項(xiàng)可用。
 
圖像設(shè)置
如果進(jìn)行實(shí)況跟蹤,在EthoVision XT分析視頻以供檢測(cè)之前,您可以調(diào)整實(shí)況視頻。例如:您可以調(diào)整對(duì)比度和亮度。
點(diǎn)擊Video(視頻)選項(xiàng)卡下的Image(圖像)按鈕。在出現(xiàn)的窗口中,調(diào)整您需要的屬性。“對(duì)比度”可增強(qiáng)圖像亮區(qū)和暗區(qū),“亮度”使圖像更亮,“飽和度”增加顏色強(qiáng)度。“圖像”設(shè)置也會(huì)影響您可以保存到視頻文件的圖像(請(qǐng)參閱第213頁(yè))。如果您點(diǎn)擊Default(默認(rèn))按鈕,設(shè)置將重新設(shè)定為攝像機(jī)驅(qū)動(dòng)程序的默認(rèn)值。
 
 
僅您的試驗(yàn)設(shè)置為“實(shí)況跟蹤”時(shí),Image(圖像)按鈕才可用,。取決于攝像機(jī),一些設(shè)置可能會(huì)變灰。
 
在改變“視頻調(diào)節(jié)設(shè)置”之前,始終嘗試調(diào)節(jié)照明設(shè)備和攝像機(jī)光圈設(shè)置。
如果更改設(shè)置,您需要重新定義檢測(cè)閾值(參閱上文),并制作一個(gè)新的參考圖像。
 
 
平滑處理
在某些情形下,您可能需要在采集數(shù)據(jù)之前調(diào)整視頻圖像的質(zhì)量。如果視頻包含細(xì)粒度干擾,可以通過(guò)使用Video pixel smoothing(視頻像素平滑處理)獲得改善。如果檢測(cè)到的身體輪廓正在“閃爍”,通過(guò)使用Track noise reduction(跟蹤干擾降低功能)可以改善跟蹤質(zhì)量。點(diǎn)擊Smoothing(平滑)按鈕,并調(diào)整下面選項(xiàng)之一。
Video pixel smoothing(視頻像素平滑處理)
選擇一個(gè)Video pixel smoothing(視頻像素平滑處理)值,以減少細(xì)粒度干擾對(duì)檢測(cè)的影響。由于細(xì)粒度干擾,預(yù)計(jì)具有相同(或類似)灰度值的相鄰像素可能具有顯著不同的數(shù)值。在這種情形下,EthoVision XT可能會(huì)偶爾作為無(wú)關(guān)受試者檢測(cè)像素組。
 
Video pixel smoothing(視頻像素平滑處理)選項(xiàng)通過(guò)下面方式在檢測(cè)之前減少相鄰像素之間的差異:涂污圖像,即使用周邊像素的平均值替換每個(gè)像素的灰度值。
“像素平滑處理”不會(huì)影響“顏色標(biāo)記跟蹤”。但會(huì)影響“標(biāo)記輔助跟蹤”中身體輪廓檢測(cè)。
選擇其中一個(gè)值:
None(默認(rèn)) - 無(wú)像素平滑處理。如同原樣,為受試者檢測(cè)分析視頻圖像。
Low(低) - 每個(gè)像素與8個(gè)最近的像素混合(像素距離 = 1)。
Medium(中等) - 每個(gè)像素與24個(gè)最近的像素混合(像素距離為1或2)。
High(高) - 每個(gè)像素與48個(gè)最近的像素混合(像素距離為1、2或3)。例如:一個(gè)亮像素(灰度值 = 240)由暗像素包圍:
 
 
 
如果選擇選項(xiàng)Video pixel smoothing=Low(視頻像素平滑處理 = 低),該像素獲得一個(gè)平均值,該平均值利用該像素本身以及8個(gè)最近像素計(jì)算得出。在這種情形下,平均值為150,因而像素會(huì)顯得較暗。如果您指定Video pixel smoothing=Medium(視頻像素平滑處理 = 中等),將利用該像素本身以及24個(gè)最近的像素計(jì)算平均值。如果您指定Video pixel smoothing=High(視頻像素平滑處理 = 高),一個(gè)更大的周邊像素組將給予考慮。
高視頻像素平滑水平需要大量的處理器容量。
 
 
為什么要使用Video pixel smoothing(視頻像素平滑)選項(xiàng)?
如果背景中相鄰像素相對(duì)恒定,選擇一個(gè)適中“視頻像素平滑”值,或者選定選項(xiàng)None(無(wú))。為了平滑效果,使用更多周邊像素并不會(huì)帶來(lái)更好結(jié)果。
如果背景中相鄰像素通常差異很大,選擇一個(gè)較高的“視頻像素平滑”值。例如:當(dāng)籠子的墊料看上去具有紋理時(shí)。
 
在這種情形下,您需要使用更多周邊像素對(duì)每個(gè)像素進(jìn)行平滑處理,以補(bǔ)償該變化。
 
當(dāng)使用Video Pixel smoothing(視頻像素平滑處理)時(shí),可能會(huì)導(dǎo)致視頻圖像中的檢測(cè)用重要信息丟失。例如:受試者的尖銳邊緣等
 
 
Track noise reduction(跟蹤干擾降低)
如果檢測(cè)到的動(dòng)物中心點(diǎn)持續(xù)移動(dòng),而實(shí)際上該動(dòng)物靜坐不動(dòng),將會(huì)高估整個(gè)移動(dòng)距離。在采集數(shù)據(jù)之后,您可以使用“跟蹤平滑處理”修正該缺陷(詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第401頁(yè))。
在某些情形下,通過(guò)在采集期間降低干擾,可以獲得高質(zhì)量的跟蹤。如果您使用“試驗(yàn)與硬件控制”,這種情形可能尤為明顯。例如:如果在一個(gè)區(qū)域中檢測(cè)到動(dòng)物的中心點(diǎn),您希望料丸分配器下放一顆料丸。如果檢測(cè)到的中心點(diǎn)因干擾而正快速移動(dòng),每當(dāng)中心點(diǎn)跨越區(qū)域邊界時(shí),可能會(huì)導(dǎo)致下放大量連貫的料丸。“跟蹤干擾降低技術(shù)”可以解決該問(wèn)題。
通過(guò)使用“跟蹤干擾降低技術(shù)”,移動(dòng)距離的快速變化將得到補(bǔ)償,并且路徑將獲得平滑化。當(dāng)使用“檢測(cè)設(shè)置”中的“跟蹤干擾降低技術(shù)”選項(xiàng)時(shí),將會(huì)影響到采集的跟蹤,因此采集之后不可以重新改來(lái)。與采集后平滑處理(請(qǐng)參閱第401頁(yè))形成對(duì)比,在此,您可以使用配置文件計(jì)算分析結(jié)果,無(wú)論這些分析結(jié)果是否經(jīng)過(guò)篩選器處理。此外,如果您對(duì)動(dòng)物的快速移動(dòng)特別感興趣,請(qǐng)不要使用“跟蹤干擾降低技術(shù)”,例如:如果您研究斑馬魚幼體的驚嚇?lè)磻?yīng)。
圖8.6 - 顯示“跟蹤干擾降低技術(shù)”對(duì)受試者行走路徑的影響。在該示例中,顯示對(duì)動(dòng)物的X坐標(biāo)的影響。
 
 
 
圖8.6 - 顯示“跟蹤干擾降低技術(shù)”對(duì)受試者行走路徑的影響。
 
“跟蹤干擾降低技術(shù)”利用高斯過(guò)程回歸方法。在采集期間,應(yīng)用“跟蹤干擾降低技術(shù)”。因此,改變采集的跟蹤,其后無(wú)法取消。
當(dāng)使用“高斯過(guò)程回歸”方法時(shí),通過(guò)使用先前12個(gè)采樣點(diǎn)的x-y坐標(biāo)對(duì)采樣點(diǎn)進(jìn)行平滑處理。該方法不同于Lowess采集后平滑處理方法(請(qǐng)參閱第403頁(yè)),Lowess方法使用待平滑處理的樣本點(diǎn)之后和之后的樣本。在采集期間不可能采用這種方法,因?yàn)槲磥?lái)樣本的x-y坐標(biāo)尚不清楚。
如果您使用鼻尾跟蹤,鼻尖點(diǎn)和尾基路徑的平滑化處理不依賴中心點(diǎn)路徑。
 
 
 
活動(dòng)性設(shè)置
如果您在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇Activity analysis(活動(dòng)性分析),您必須為該分析創(chuàng)建設(shè)置。為了更容易判定設(shè)置是否正確,確保已檢測(cè)的受試者Body fill(身體填充)未顯示在視頻窗口內(nèi)。點(diǎn)擊窗口右上角內(nèi)Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,選擇選項(xiàng)Detection Features(檢測(cè)特征),并取消選擇Body fill和Noise選項(xiàng)。然后選擇Activity(活動(dòng)性)。關(guān)閉Detection Features(檢測(cè)特征)窗口,并播放視頻。樣本之間所檢測(cè)的像素變化顯示為紫色。
在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,點(diǎn)擊Activity(活動(dòng)性)按鈕。Activity Settings(活動(dòng)設(shè)置)窗口打開(請(qǐng)參閱圖8.7)。
 
 
 
圖8.7 - Activity Settings(活動(dòng)性設(shè)置)窗口。
 
Activity threshold(活動(dòng)性閾值) - 該值給出樣本與上一個(gè)樣本之間的灰度值偏差閾值。
背景干擾篩選器 - 使用該篩選器消除視頻中或攝像機(jī)圖像中的干擾。當(dāng)使用背景干擾篩選器時(shí),如果周圍像素也已發(fā)生改變,一個(gè)像素改變僅計(jì)為一次改變。排除未完全圍繞已改變像素的像素,并且在剩余像素周圍增加一層已改變的像素。
 
背景干擾篩選器設(shè)置越高,可以使用更多周圍像素。解釋請(qǐng)參閱圖8.8。
 
 
 
圖8.8 - 具有值1的背景干擾篩選器,黑色方塊表示兩個(gè)連續(xù)樣本之間已改變的像素。首先,排除未完全由一層已改變像素圍繞的所有像素(紅色方塊)。然后,添加一層已改變的像素在剩余像素周圍。紅色細(xì)線顯示原有改變的像素。
 
壓縮失真篩選器 - 使用壓縮失真篩選器,補(bǔ)償反復(fù)出現(xiàn)的視頻假象。當(dāng)使用壓縮失真篩選器時(shí),僅考慮出現(xiàn)在大量相鄰幀中的變化。如果進(jìn)行實(shí)況跟蹤,我們建議維持該設(shè)置默認(rèn)值“關(guān)閉”。如果從視頻中進(jìn)行跟蹤,或者選擇Redo tracking(循環(huán)跟蹤),應(yīng)維持默認(rèn)值設(shè)置“打開”。然而,如果您對(duì)短暫或快速發(fā)生的變化感興趣,則維持壓縮失真篩選器設(shè)置處于“關(guān)閉”。
按照一種適當(dāng)方式創(chuàng)建設(shè)置,確保可檢測(cè)到動(dòng)物的所有活動(dòng)和保留一定干擾。也可以嘗試是否降低采樣率(請(qǐng)參閱第208頁(yè)),并使用Video Pixel Smoothing(視頻像素平滑處理)(請(qǐng)參閱第214頁(yè))以改善“活動(dòng)性”檢測(cè)。然后,再次點(diǎn)擊Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,并選擇選項(xiàng)Detection Features(檢測(cè)特征)。取消選中Activity(活動(dòng)性),并選擇Body fill(身體填充)。然后,為受試者創(chuàng)建檢測(cè)設(shè)置�;蛘�,如果您需要使用不同采樣率執(zhí)行活動(dòng)性分析和跟蹤,應(yīng)創(chuàng)建單獨(dú)的跟蹤檢測(cè)設(shè)置。
此外,可以僅執(zhí)行活動(dòng)性分析,而不創(chuàng)建跟蹤檢測(cè)設(shè)置。然而,如果您這樣做,則可能發(fā)生EthoVision XT在檢測(cè)動(dòng)物時(shí)會(huì)遇到很多困難,并且會(huì)減少采集性能。這可能導(dǎo)致遺漏許多樣本。因此,當(dāng)創(chuàng)建活動(dòng)性設(shè)置時(shí),檢查樣本遺漏比例不會(huì)變得太高(另請(qǐng)參閱第212頁(yè)上的“遺漏樣本”)。
 
8.6 檢測(cè)設(shè)置(檢測(cè)方法)
 
 
 
應(yīng)該使用哪種檢測(cè)方法?
4種方法可用于將動(dòng)物從背景中區(qū)分出來(lái):下面情形下使用Gray scaling(灰度標(biāo)度):
動(dòng)物灰度不同于能夠訪問(wèn)的所有位置內(nèi)的背景。
在一次試驗(yàn)期間,背景無(wú)法改變。
在試驗(yàn)期間,照明度均勻(最低陰影和反射)。
示例 - 在均勻黑色且無(wú)明亮物體的開放場(chǎng)內(nèi)跟蹤一只白鼠。
下面情形下使用Static Subtraction(靜態(tài)減除法):
灰度標(biāo)度法不可用(因?yàn)榛顒?dòng)場(chǎng)中的其他物體顏色與動(dòng)物顏色類似)。
背景不隨時(shí)間發(fā)生變化。
在試驗(yàn)期間,光照度恒定不變。
例如 – 在具有難以避免的反射或明亮物體的情形下,在開放場(chǎng)內(nèi)跟蹤一只白鼠。
下面情形下使用Dynamic Subtraction(動(dòng)態(tài)減除法):
在試驗(yàn)期間,光照條件逐漸改變或背景改變(墊料遭受來(lái)回踢動(dòng)、下放食物粒丸、糞便出現(xiàn)等)。
示例 – 跟蹤家籠(配帶墊料)中的一只老鼠。老鼠活動(dòng)導(dǎo)致視頻圖像中墊料外觀出現(xiàn)變化。
下面情形下使用Differencing(差分法):
一個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)受試者與背景之間的對(duì)比度出現(xiàn)很大變化。例如,活動(dòng)場(chǎng)或動(dòng)物(如冠鼠)皮毛內(nèi)光照強(qiáng)度梯度可能導(dǎo)致對(duì)比度變化。
 
檢測(cè)方法:gray scaling(灰度標(biāo)度法)
 
如何操作Gray scaling(灰度標(biāo)度法)?
視頻圖像將轉(zhuǎn)換為單色。圖像中的每個(gè)像素均具有一個(gè)灰度值,范圍從0(黑色)至255(白色)。當(dāng)使用Gray scaling(灰度標(biāo)度法)時(shí),您應(yīng)定義視作受試者的灰度值范圍。剩余灰度值將視為背景。
 
 
程序
1. 在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,選擇Methods(方法)部分中的Gray scaling(灰度標(biāo)度法)選項(xiàng)。
2. 將受試者插入活動(dòng)場(chǎng)內(nèi),或者放置媒介文件在受試者正移動(dòng)的位置點(diǎn)處。
當(dāng)使用在Detection settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中選擇的Gray scaling(灰度標(biāo)度法)時(shí),由于Gray scaling(灰度標(biāo)度法)不使用一個(gè)參考圖像,因此該方法無(wú)法捕捉一個(gè)幀或選擇另一個(gè)視頻文件。
3. 在Detection(檢測(cè))部分中,移動(dòng)Select range(選擇范圍)旁邊的兩個(gè)滑動(dòng)條,或者輸入數(shù)值在相應(yīng)字段中,以定義該動(dòng)物的灰度值下限和上限(范圍介于0至255之間,0表示黑色,255表示白色)。背景不能包含超出這些限制范圍的灰度值。
4. 在Video(視頻)窗口上,檢查目前灰度范圍所導(dǎo)致的檢測(cè)質(zhì)量。檢測(cè)到的受試者顯示在Track Features(跟蹤特征)窗口中所選定的特征與顏色(請(qǐng)參閱第250頁(yè))。
- 如果已檢測(cè)到的區(qū)域相對(duì)實(shí)際受試者太小,您需要擴(kuò)大范圍(至少在一個(gè)方向上更亮或更暗)。
- 標(biāo)記為“干擾”的區(qū)域(在默認(rèn)情形下,顯示為橙色,請(qǐng)參閱第250頁(yè))表示該灰度范圍過(guò)寬 – 至少需要在一個(gè)方向上縮小該范圍。
 
 
5. 移動(dòng)滑動(dòng)條,直至完全檢測(cè)到受試者(或感興趣的部分),并且干擾減至最低程度。通過(guò)移動(dòng)視頻滑動(dòng)條或等待實(shí)況動(dòng)物移動(dòng),檢查是否在該活動(dòng)場(chǎng)的所有區(qū)域內(nèi)均正確檢測(cè)到該受試者。
 
為了達(dá)到最佳跟蹤效果,檢測(cè)到完整動(dòng)物身體非常重要。繼續(xù)進(jìn)行輪廓調(diào)整(請(qǐng)參閱第41頁(yè)),以優(yōu)化身體檢測(cè)。
 
檢測(cè)方法:static subtraction(靜態(tài)減除法)
 
如何操作(Static subtraction)靜態(tài)減除法?
視頻圖像將轉(zhuǎn)換為單色。圖像中的每個(gè)像素均具有一個(gè)灰度值,范圍從0(黑色)至255(白色)。當(dāng)使用Static subtraction(靜態(tài)減除法)時(shí),應(yīng)選擇未包含受試者的一張活動(dòng)場(chǎng)圖像,該圖像稱為“參考圖像”。當(dāng)分析圖像時(shí),EthoVision XT從目前圖像(實(shí)況或從視頻)內(nèi)的相應(yīng)像素灰度值中減去“參考圖像”中每個(gè)像素灰度值。具有非零差值的像素視作受試者。
通過(guò)定義目前圖像與必須視為受試者的背景之間的對(duì)比度,您可以移除較小非零差值。其余像素視為背景(請(qǐng)參閱圖8.9)。
 
圖8.9 - 靜態(tài)減除檢測(cè)法如何工作的一個(gè)示例。從實(shí)況圖像中每個(gè)像素灰度值中減去“參考圖像”中每個(gè)像素灰度值。對(duì)于結(jié)果為“0”的每個(gè)像素,如果差值 > “0”,并處于已設(shè)定的灰度范圍內(nèi),那么這些像素視為受試者。因此,當(dāng)使用這種方法時(shí),您的任務(wù)即指定優(yōu)化受試者檢測(cè)的對(duì)比度。
 
 
程序
1. 在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,選擇Method(方法)部分內(nèi)的Static subtraction(靜態(tài)減除法)選項(xiàng)。
 
2. 在Detection(檢測(cè))選項(xiàng)卡下,點(diǎn)擊“參考圖像”旁邊的Settings(設(shè)置)按鈕。左側(cè)圖像為跟蹤開始時(shí)使用的“參考圖像”。該窗口右側(cè)上選項(xiàng)呈現(xiàn)灰色。
 
 
圖8.10 - 靜態(tài)減除法和實(shí)況跟蹤的Reference Image(參考圖像)窗口。如果您從視頻文件中執(zhí)行跟蹤,該窗口中文本將略有不同,但選項(xiàng)相同。按照連貫順序執(zhí)行規(guī)程,直到左邊圖像中沒(méi)有動(dòng)物。
 
其目的:獲得一個(gè)參考圖像,其中未包含需要跟蹤的動(dòng)物。為了達(dá)到此目的,請(qǐng)按照連貫順序遵循下面指示。如果A失效,則移動(dòng)到B,如果B同樣失效,那么繼續(xù)移動(dòng)到C。
1. Grab Current(A) - 滾動(dòng)視頻,直到找到一張未包含動(dòng)物的圖像。如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,確保活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)無(wú)任何動(dòng)物。點(diǎn)擊Grab Current(A)。該圖片將作為初始參考圖像。跳過(guò)第2步和第3步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。
如果您的視頻未包含無(wú)動(dòng)物的圖像,則繼續(xù)選項(xiàng)2。此外,如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,并且無(wú)法使用一個(gè)空活動(dòng)場(chǎng)開始,則繼續(xù)選項(xiàng)2。
2. Grab from other(B) - 您可以擁有與跟蹤用視頻具有相同背景的一個(gè)視頻,但未包含動(dòng)物�;蛘吣梢該碛形窗瑒�(dòng)物的一張背景圖像。在這種情形下,請(qǐng)點(diǎn)擊Grab from Other,并選擇該視頻文件或圖像文件。如果您選擇一個(gè)視頻文件,該文件中第一幀將作為初始參考圖像。如果您選擇一個(gè)圖像文件,該文件應(yīng)具有與跟蹤用視頻文件相同的分辨率。瀏覽到該文件,然后點(diǎn)擊Open(打開)。跳過(guò)第3步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。如果您不擁有這類視頻或圖像,請(qǐng)繼續(xù)選項(xiàng)3。
 
在默認(rèn)情形下,“參考圖像”存儲(chǔ)在您的試驗(yàn)文件夾Bitmap Files中。如果背景沒(méi)有改變,您可以使用這些圖像作為其他試驗(yàn)中的參考圖像。
3. Start learning(C) - 當(dāng)使用該選項(xiàng)時(shí),將為整個(gè)視頻制作一張平均圖像。如果動(dòng)物正在移動(dòng),學(xué)習(xí)將會(huì)平均化動(dòng)物的像素,從而產(chǎn)生未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像。
如果進(jìn)行實(shí)況跟蹤,應(yīng)點(diǎn)擊Start Learning(開始學(xué)習(xí)),然后,一旦獲得未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像,點(diǎn)擊Stop Learning(停止學(xué)習(xí))。單擊“Close(關(guān)閉)”。I.
 
圖8.11 - Reference Image(參考圖像)窗口中的學(xué)習(xí)流程。A - 視頻圖像(動(dòng)物始終處于視野內(nèi)),B - 應(yīng)用學(xué)習(xí)的結(jié)果:正移動(dòng)的動(dòng)物從背景中移除。
 
4. 當(dāng)您完成捕捉一個(gè)“參考圖像”時(shí),請(qǐng)點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。
5. 在Subject is … than background列表中,選擇下面選項(xiàng)之一(取決于需要跟蹤的受試者顏色):
- 比背景更亮 - 例如,在黑色開放區(qū)域跟蹤威期塔鼠。
- Darker than background(比背景暗) - 例如:為了在具有白色墊料的開放場(chǎng)內(nèi)跟蹤一只C57BL6老鼠。
- Brighter and darker than background(比背景更亮和更暗) - 例如:在具有白色背景和黑色掩蔽物的家籠中跟蹤一只DBA2老鼠,或者在均勻灰色開放場(chǎng)內(nèi)跟蹤一只冠鼠(黑色和白色)。
結(jié)果 – 取決于上面選擇,不同對(duì)比度滑動(dòng)條變?yōu)榭捎茫?/div>
- 對(duì)于Brighter than background(比背景更亮) – 亮對(duì)比滑動(dòng)條。
- 對(duì)于Darker than background(比背景暗) - 暗對(duì)比滑動(dòng)條。
- 對(duì)于Brighter and darker than background(比背景更亮和更暗) - 兩個(gè)滑動(dòng)條。
對(duì)于各滑動(dòng)條,對(duì)比度變化范圍為0(無(wú)對(duì)比度)至255(滿對(duì)比度)。
不同于使用“灰度標(biāo)度”,使用滑動(dòng)條選擇的值代表目前圖像與參考圖像之間的差值,而不是絕對(duì)灰度值。
 
當(dāng)受試者比背景亮和暗時(shí),僅不同亮度區(qū)與背景之間具有足夠?qū)Ρ榷葧r(shí),檢測(cè)方可良好進(jìn)行。例如:當(dāng)背景介于黑色與白色之間時(shí),能夠有效地跟蹤一只冠鼠。
6. 將受試者插入活動(dòng)場(chǎng)內(nèi),或者放置媒介文件在受試者正移動(dòng)的位置點(diǎn)處。
7. 移動(dòng)適當(dāng)滑動(dòng)條或者輸入數(shù)值到相應(yīng)字段中,以定義與受試者對(duì)應(yīng)的對(duì)比度下限值和上限值。
在Video(視頻)窗口中,檢查檢測(cè)質(zhì)量。
示例1 – 受試者比背景更亮。僅檢測(cè)受試者的白色區(qū)域。
 
向左移動(dòng)“亮對(duì)比”滑動(dòng)條,以朝著受試者與背景之間較低對(duì)比度數(shù)值擴(kuò)大范圍。
示例2 – 受試者比背景暗。在較低對(duì)比度區(qū)域內(nèi),僅檢測(cè)身體中一部分。
 
向左移動(dòng)“暗對(duì)比”滑動(dòng)條,以朝著受試者與背景之間較低對(duì)比度數(shù)值擴(kuò)大范
示例3 – 受試者比背景亮和暗。僅檢測(cè)黑色毛皮中較暗區(qū)域
 向左移動(dòng)“亮對(duì)比”滑動(dòng)條,以朝著受試者白色區(qū)域與灰色背景之間較低對(duì)比度方向擴(kuò)大范圍。然后,向左移動(dòng)“暗對(duì)比”滑動(dòng)條,以朝著受試者黑色區(qū)域與背景之間較低對(duì)比度方向擴(kuò)大范圍。
 
 
8. 移動(dòng)滑動(dòng)條,直至完全檢測(cè)到受試者(或感興趣的部分),并且干擾減至最低程度。通過(guò)回播視頻文件中不同部分或等待現(xiàn)場(chǎng)動(dòng)物移動(dòng),檢查是否在活動(dòng)場(chǎng)的所有區(qū)域內(nèi)正常檢測(cè)到該受試者。
 
 為了達(dá)到最佳跟蹤效果,檢測(cè)到完整動(dòng)物身體非常重要。繼續(xù)進(jìn)行輪廓調(diào)整(請(qǐng)參閱第41頁(yè)),以優(yōu)化身體檢測(cè)。
 
檢測(cè)方法:dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)
 
Dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)如何工作?
如同“靜態(tài)減除法”(請(qǐng)參閱第221頁(yè)),該程序?qū)Ρ让繌埐蓸訄D像與一張參考圖像,重要區(qū)別在于定期更新該參考圖像。該方法用于補(bǔ)償背景中的時(shí)空變化。
當(dāng)使用Dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)時(shí),在每次采樣時(shí)更新“參考圖像”。您指定目前視頻圖像對(duì)“參考圖像”的貢獻(xiàn)百分比。
 
 
程序
1. 在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口的Method(方法)部分中,選擇Dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)。
2. 在Detection(檢測(cè))部分中,點(diǎn)擊Reference Image Settings(參考圖像設(shè)置)按鈕。遵循第228頁(yè)上“參考圖像”下的規(guī)程,創(chuàng)建未包含動(dòng)物的參考圖像。
3. 在Subject is … than background列表中,選擇下面選項(xiàng)之一,這取決于需要跟蹤的受試者顏色(詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第223頁(yè)中第6步)
圖8.12 - 在Dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除)檢測(cè)方法中,“參考圖像”將在每次采樣時(shí)予以更新。通過(guò)點(diǎn)擊Reference Image(參考圖像)窗口中的Grab from Video、Grab from Camera或Grab from Other按鈕(參閱第39頁(yè)),指定初始參考圖像,否則,將分析第一幀(未在圖中顯示)。對(duì)于普通樣本n,該“參考圖像”通過(guò)合并前一個(gè)樣本n-1的參考圖像和目前樣本n獲得,其中從前一個(gè)樣本中預(yù)算的受試者周圍區(qū)域已刪除。由您分配權(quán)重給帶已移除受試者的目前圖像(參閱規(guī)程),同時(shí)分配權(quán)重(1-)給先前參考圖像。由于按照該方式確定,各參考圖像均包含大量以前圖像的信息,這取決于值。詳細(xì)信息參見(jiàn)下文所述。
 
 
4. 移動(dòng)Current frame weight(目前幀權(quán)重)旁邊的滑動(dòng)條,或者輸入數(shù)值到合適字段中,以指定如何更新“參考圖像”(范圍0 - 100%):
- 在典型情形下,1 - 5之間的數(shù)值可給出良好結(jié)果。
- 如果您需要大量以前圖像以用于各參考圖像,請(qǐng)選擇一個(gè)較低值。作為結(jié)果,背景改變會(huì)在諸多圖像上予以減弱。當(dāng)背景緩慢變化時(shí),請(qǐng)選擇較低值。
- 如果您需要少量以前圖像以用于各參考圖像,請(qǐng)選擇一個(gè)較高值。作為結(jié)果,背景改變會(huì)在短時(shí)間內(nèi)捕獲。當(dāng)背景快速變化時(shí),請(qǐng)選擇較高值,例如:當(dāng)受試者非�;钴S,并且在墊料周圍活動(dòng)時(shí)。
- 如果您選擇0,“參考圖像”將不更新。這種情形如同使用Static Subtraction(靜態(tài)減除法)。
- 如果您選擇100,每個(gè)樣本得到其自己的參考圖像,同時(shí)并未由以前圖像作出貢獻(xiàn)。
- 目前幀權(quán)重的改變對(duì)處理器負(fù)荷的影響不會(huì)很大。
 
 
為了找到最佳的目前幀權(quán)重,設(shè)定一個(gè)值,并運(yùn)行一次或多次試驗(yàn)。如果跟蹤令人滿意,那么進(jìn)行評(píng)估。如果效果不令人滿意,則增加或減少設(shè)置20%,然后再次進(jìn)行試驗(yàn)。
 
為了獲得良好跟蹤,應(yīng)盡可能多的檢測(cè)動(dòng)物身體非常重要。繼續(xù)進(jìn)行輪廓調(diào)整(請(qǐng)參閱第234頁(yè)),以優(yōu)化身體檢測(cè)。
 
參考圖像
在Detection(檢測(cè))選項(xiàng)卡下,點(diǎn)擊“參考圖像”旁邊的Settings(設(shè)置)按鈕�,F(xiàn)在,您可以看到兩個(gè)視頻圖像。左側(cè)圖像為跟蹤開始時(shí)使用的“參考圖像”。右邊圖像即跟蹤期間連續(xù)更新的“參考圖像”。
 
 
圖8.13 – 使用“動(dòng)態(tài)減除法”以及從視頻文件中進(jìn)行跟蹤的情形下Reference Image(參考圖像)窗口。如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,該窗口中文本會(huì)稍微不同,但選項(xiàng)相同。按照連貫順序遵循操作規(guī)程,直到兩個(gè)圖像中沒(méi)有動(dòng)物。
 
其目的:獲得“參考圖像”,且其中未包含需要跟蹤的動(dòng)物圖像。為了達(dá)到此目的,請(qǐng)按照連貫順序遵循下面指示。如果A失效,則移動(dòng)到B,如果B同樣失效,那么繼續(xù)移動(dòng)到C。
1. Grab Current(A) - 滾動(dòng)視頻,直到找到一張未包含動(dòng)物的圖像。如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,確保活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)無(wú)任何動(dòng)物。點(diǎn)擊Grab Current(A)。該圖片將作為初始參考圖像。跳過(guò)第2步 – 第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。
如果您的視頻未包含無(wú)動(dòng)物的圖像,則繼續(xù)選項(xiàng)2。此外,如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,并且無(wú)法使用一個(gè)空活動(dòng)場(chǎng)開始,則繼續(xù)選項(xiàng)2。
2. Grab from other(B) - 您可以擁有與跟蹤用視頻中背景相同的一個(gè)視頻,但未包含動(dòng)物�;蛘吣梢該碛形窗瑒�(dòng)物的一張背景圖像。在這種情形下,請(qǐng)點(diǎn)擊Grab from Other,并選擇該視頻文件或圖像文件。如果您選擇一個(gè)視頻文件,該文件中第一幀將作為初始參考圖像。如果您選擇一個(gè)圖像文件,該文件應(yīng)具有與跟蹤用視頻文件相同的分辨率。瀏覽到該文件,然后點(diǎn)擊Open(打開)。跳過(guò)第3步和第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。如果您不擁有這類視頻或圖像,請(qǐng)繼續(xù)選項(xiàng)3。
 
在默認(rèn)情形下,“參考圖像”存儲(chǔ)在您的試驗(yàn)文件夾Bitmap Files中。如果背景沒(méi)有改變,您可以使用這些圖像作為其他試驗(yàn)中的參考圖像。
3. Start learning(C) - 當(dāng)使用該選項(xiàng)時(shí),將為整個(gè)視頻制作一張平均圖像。如果動(dòng)物正在移動(dòng),學(xué)習(xí)將會(huì)平均化動(dòng)物的像素,從而產(chǎn)生未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像。
如果進(jìn)行實(shí)況跟蹤,應(yīng)點(diǎn)擊Start Learning(開始學(xué)習(xí)),然后,一旦獲得未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像,點(diǎn)擊Stop Learning(停止學(xué)習(xí))。
如果該步驟導(dǎo)致出現(xiàn)令人滿意的初始參考圖像,則跳過(guò)第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。如果沒(méi)有,則繼續(xù)執(zhí)行第4步。
4. Grab Dynamic Image(D) - 如果選項(xiàng)1至3均沒(méi)有導(dǎo)致令人滿意的初始參考圖像,那么可以使用作為初始參考圖像的目前已更新的參考圖像以解決問(wèn)題。點(diǎn)擊“動(dòng)態(tài)參考圖像”下方的Grab Dynamic Image(D)。
Acquisition settings(采集設(shè)置) - 如果您執(zhí)行若干連續(xù)試驗(yàn),您可能需要選擇用作初始參考圖像的圖像。
Use saved reference image(使用已保存的參考圖像) - 如果不同試驗(yàn)間背景保持恒定,應(yīng)使用該選項(xiàng)。
Use dynamic reference image(使用動(dòng)態(tài)參考圖像) – 如果不同試驗(yàn)間背景發(fā)生變化,應(yīng)使用該選項(xiàng)。
當(dāng)使用Dynamic Subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)時(shí),“捕獲參考圖像”可選。如果您沒(méi)有這樣做,EthoVision XT將采用第一個(gè)樣本或可用視頻幀,并將其視為第一參考圖像。
如果正從視頻文件中跟蹤,您必須向前播放視頻,同時(shí)進(jìn)行動(dòng)態(tài)減除法設(shè)置。因?yàn)槌绦蛐枰略搮⒖紙D像。不得跳過(guò)該文件,否則,將會(huì)導(dǎo)致無(wú)法正確制作參考圖像。
 
 
“參考圖像”如何進(jìn)行更新?
一個(gè)視頻流由多個(gè)視頻圖像(幀)組成。在數(shù)據(jù)采集期間,EthoVision XT按照規(guī)定采樣率分析每一x圖像(參閱第208頁(yè))。當(dāng)分析樣本(圖像)n時(shí),“參考圖像”通過(guò)累加兩張圖像中的每個(gè)像素灰度值獲得:
“參考圖像”由像素制成,這些像素具有以前圖像的平均值。
目前圖像,其中以前樣本中檢測(cè)的受試者周圍正方形區(qū)域已刪除。這提供目前背景的一個(gè)粗略估算。
根據(jù)下面公式累加灰度值:
Referencei,n=(1-)* Referencei,n-1+* Currenti,n
對(duì)于各像素I,其中:
 
Referencei,n = 樣本n的參考圖像中像素I的灰度值。
Referencei,n-1 = 樣本n-1的參考圖像中像素I的灰度值。
Currenti,n = 以前檢測(cè)的受試者周圍正方形區(qū)域已刪除的樣本n中像素I的灰度值。
 = 目前幀權(quán)重。
目前幀權(quán)重決定新參考圖像中兩個(gè)組分的相對(duì)權(quán)重。
由于上面公式具有遞歸性,即Referencei,n的每個(gè)值也為以前樣本的一個(gè)函數(shù),值決定過(guò)去有助于樣本n的參考圖像的圖像數(shù)量。值越低,至少部分有助于目前參考圖像的過(guò)去圖像數(shù)量越多。
各過(guò)去圖像對(duì)目前參考圖像的貢獻(xiàn)程度為1-α的冪函數(shù)。相對(duì)于目前圖像,圖像越老,其對(duì)參考圖像的貢獻(xiàn)越小。
示例 - 若 = 20%,則1- = 80%。第一視頻圖像對(duì)第二個(gè)樣本貢獻(xiàn)80%,對(duì)第三個(gè)樣本貢獻(xiàn)80%2 = 64%,然后再對(duì)第四個(gè)樣本貢獻(xiàn)80%3 = 51%等。在第21個(gè)樣本時(shí),第1個(gè)圖像的貢獻(xiàn)率低于1%。
 
檢測(cè)方法:differencing(差分法)
 
Differencing(差分法)如何工作?
如同Dynamic subtraction(動(dòng)態(tài)減除法),Differencing(差分法)隨著時(shí)間更新參考圖像。Differencing(差分法)在“參考圖像”中每個(gè)像素與目前圖像的像素之間進(jìn)行一次統(tǒng)計(jì)(概率)比較。統(tǒng)計(jì)比較使用目前圖像與參考圖像之間的對(duì)比度方差計(jì)算各像素成為受試者的可能性。
在大多數(shù)情形下,相對(duì)于其他兩種減除法,“差分法”可更有效地檢測(cè)受試者。
相對(duì)于減除法,“差分法”需要更多處理器負(fù)荷。因此,當(dāng)使用“差分法”時(shí),確保電腦滿足為第38頁(yè)上規(guī)定的系統(tǒng)要求。
 
程序
1. 在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,選擇Method(方法)部分中的Differencing(差分法)。
2. 在Detection(檢測(cè))部分中,點(diǎn)擊Reference Image Settings(參考圖像設(shè)置)按鈕。遵循第231頁(yè)上“參考圖像”下的規(guī)程,創(chuàng)建未包含動(dòng)物的參考圖像。
 
3. 在Subject is … than background列表中,選擇下面選項(xiàng)之一,這取決于需要跟蹤的受試者顏色(詳細(xì)信息請(qǐng)參閱第223頁(yè)中第6步)。
4. 接下來(lái),如果必要,調(diào)整“靈敏度”滑動(dòng)條位置以及改變Background Changes(背景變化)列表中所選的選項(xiàng)。
 
“靈敏度”滑動(dòng)條決定與背景之間的對(duì)比度差異程度視為該動(dòng)物。對(duì)于具有良好對(duì)比度的圖像,無(wú)需改變滑動(dòng)條。對(duì)于具有低對(duì)比度的圖像,向左或向右調(diào)整滑動(dòng)條位置,直至正好檢測(cè)到受試者。
在Background Changes(背景變化)列表中,您可以選擇反映背景快速變化方式的選項(xiàng)。例如:由于動(dòng)物會(huì)將墊料踢來(lái)踢去,因此具有墊料的籠子可能會(huì)有很大變化。在這種情形下,為了防止背景出現(xiàn)變化而干擾檢測(cè),請(qǐng)選擇“中等快速”或“更快”。通常情形下,“中等慢速”運(yùn)行很好。
 
為了達(dá)到良好跟蹤效果,盡可能多的檢測(cè)到動(dòng)物身體非常重要。調(diào)整“受試者輪廓”設(shè)置(參閱第234頁(yè)),以優(yōu)化身體檢測(cè)。
 
 
參考圖像
在Detection(檢測(cè))選項(xiàng)卡下,點(diǎn)擊“參考圖像”旁邊的Settings(設(shè)置)按鈕。現(xiàn)在,您可以看到兩個(gè)視頻圖像。左側(cè)圖像為跟蹤開始時(shí)使用的“參考圖像”。右邊圖像即跟蹤期間連續(xù)更新的“參考圖像”。
其目的:獲得“參考圖像”,且其中未包含需要跟蹤的動(dòng)物圖像。為了達(dá)到此目的,請(qǐng)按照連貫順序遵循下面指示。如果A失效,則移動(dòng)到B,如果B同樣失效,那么繼續(xù)移動(dòng)到C,等等。
 
 
圖8.14 – 使用“差分法”和從視頻文件中進(jìn)行跟蹤的情形下Reference Image(參考圖像)窗口。如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,該窗口中文本會(huì)稍微不同,但選項(xiàng)相同。按照連貫順序遵循操作規(guī)程,直到兩個(gè)圖像中沒(méi)有動(dòng)物。
 
1. Grab Current(A) - 滾動(dòng)視頻,直到找到一張未包含動(dòng)物的圖像。如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,確�;顒�(dòng)場(chǎng)內(nèi)無(wú)任何動(dòng)物。點(diǎn)擊Grab Current(A)。該圖片將作為初始參考圖像。跳過(guò)第2步 – 第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。
如果您的視頻未包含無(wú)動(dòng)物的圖像,則繼續(xù)選項(xiàng)2。此外,如果您進(jìn)行實(shí)況跟蹤,并且無(wú)法使用一個(gè)空活動(dòng)場(chǎng)開始,則繼續(xù)選項(xiàng)2。
2. Grab from other(B) - 您可以擁有與跟蹤用視頻中背景相同的一個(gè)視頻,但未包含動(dòng)物。或者您可以擁有未包含動(dòng)物的一張背景圖像。在這種情形下,請(qǐng)點(diǎn)擊Grab from Other,并選擇該視頻文件或圖像文件。如果您選擇一個(gè)視頻文件,該文件中第一幀將作為初始參考圖像。如果您選擇一個(gè)圖像文件,該文件應(yīng)具有與跟蹤用視頻文件相同的分辨率。瀏覽到該文件,然后點(diǎn)擊Open(打開)。跳過(guò)第3步和第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。如果您不擁有這類視頻或圖像,請(qǐng)繼續(xù)選項(xiàng)3。
在默認(rèn)情形下,“參考圖像”存儲(chǔ)在您的試驗(yàn)文件夾Bitmap Files中。如果背景沒(méi)有改變,您可以使用這些圖像作為其他試驗(yàn)中的參考圖像。
 
3. Start learning(C) - 當(dāng)使用該選項(xiàng)時(shí),將為整個(gè)視頻制作一張平均圖像。如果動(dòng)物正在移動(dòng),學(xué)習(xí)將會(huì)平均化動(dòng)物的像素,從而產(chǎn)生未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像。
如果進(jìn)行實(shí)況跟蹤,應(yīng)點(diǎn)擊Start Learning(開始學(xué)習(xí)),然后,一旦獲得未包含動(dòng)物的一張初始參考圖像,點(diǎn)擊Stop Learning(停止學(xué)習(xí))。
如果該步驟導(dǎo)致出現(xiàn)令人滿意的初始參考圖像,則跳過(guò)第4步,然后點(diǎn)擊Close(關(guān)閉)。如果沒(méi)有,則繼續(xù)執(zhí)行第4步。
4. Grab Dynamic Image(D) - 如果選項(xiàng)1至3均沒(méi)有導(dǎo)致令人滿意的初始參考圖像,那么可以使用作為初始參考圖像的目前已更新的參考圖像以解決問(wèn)題。點(diǎn)擊“動(dòng)態(tài)參考圖像”下方的Grab Dynamic Image(D)。
 
 
采集設(shè)置
Acquisition settings(采集設(shè)置) - 如果您執(zhí)行若干連續(xù)試驗(yàn),您可能需要選擇用作初始參考圖像的圖像。
Use saved reference image(使用已保存的參考圖像) - 如果不同試驗(yàn)間背景保持恒定,應(yīng)使用該選項(xiàng)。
Use dynamic reference image(使用動(dòng)態(tài)參考圖像) – 如果不同試驗(yàn)間背景發(fā)生變化,應(yīng)使用該選項(xiàng)。
當(dāng)使用Dynamic Subtraction(動(dòng)態(tài)減除法)時(shí),“捕獲參考圖像”可選。如果您沒(méi)有這樣做,EthoVision XT將采用第一個(gè)樣本或可用視頻幀,并將其視為第一參考圖像。
如果正從視頻文件中跟蹤,您必須向前播放視頻,同時(shí)進(jìn)行動(dòng)態(tài)減除法設(shè)置。因?yàn)槌绦蛐枰略搮⒖紙D像。不得跳過(guò)該文件,否則,將會(huì)導(dǎo)致無(wú)法正確制作參考圖像。
 
 
“參考圖像”如何進(jìn)行更新?
“差分法”使用幀中所有像素的高斯分布。EthoVision XT保持均值ì的滑動(dòng)平均數(shù)和各像素灰度值的方差σ2以檢測(cè)不可能的像素。這些像素視為受試者。
根據(jù)“動(dòng)態(tài)減除法”用相同公式累加灰度值均值(請(qǐng)參閱第229頁(yè))。
根據(jù)下面公式計(jì)算灰度值方差:
Variancei,n=(1-)* Variancei,n-1+*(Currenti,n – eferencei,n)2
對(duì)于各像素I,其中:
Variancei,n = 樣本n的參考圖像中像素I的灰度值方差。
Currenti,n = 以前檢測(cè)的受試者周圍正方形區(qū)域已刪除的樣本n中像素I的灰度值。
 
Referencei,n-1 = 樣本n-1的參考圖像中像素I的平均灰度值。
 = 目前幀權(quán)重。
目前幀權(quán)重決定新參考圖像中兩個(gè)組分的相對(duì)權(quán)重(請(qǐng)參閱第230頁(yè)上的示例)。
 
8.7 受試者輪廓設(shè)置
 
輪廓侵蝕和膨脹
 
開始試驗(yàn)之前設(shè)置“輪廓”調(diào)整
檢測(cè)到完整動(dòng)物身體非常重要(通過(guò)視頻窗口中“干擾”顏色表示)。如果在設(shè)置“輪廓”調(diào)整之后,尚未達(dá)到此目的,那么返回到適當(dāng)檢測(cè)方法,并調(diào)整對(duì)比度以改善身體檢測(cè)。
 
 
圖8.15 - 左側(cè)圖為顯示身體檢測(cè)的次佳結(jié)果(未檢測(cè)到身體右側(cè)部分)。當(dāng)優(yōu)化對(duì)比度設(shè)置時(shí),右邊圖片顯示結(jié)果:現(xiàn)在檢測(cè)到整個(gè)身體。由于模型參數(shù)尚未配置,因此該階段身體輪廓的顏色為橙色(= 干擾顏色)。
 
為什么使用“輪廓”調(diào)整?
為了給出平滑輪廓以供準(zhǔn)確建模和刪除單個(gè)干擾像素。
- 為了該目的,默認(rèn)情形下選擇選項(xiàng)“Erode first, then dilate”(首先“侵蝕”,然后“膨脹”)。
為了消除薄物體的檢測(cè)(如老鼠尾巴),選擇選項(xiàng)“Erode first, then dilate”(首先“侵蝕”,然后“膨脹”)。可能需要消除動(dòng)物尾巴的原因:當(dāng)動(dòng)物靜止坐著不動(dòng)時(shí),其尾巴在動(dòng),這增加移動(dòng)距離。
去除受試者形狀中的凹部,如那些因籠條引起的凹部或‘連接’動(dòng)物身體上的條紋(例如黃蜂、魚等)-選擇膨脹和侵蝕,并且先膨脹,再侵蝕。這樣消除受試者形狀中的凹部,給出更平滑輪廓或確保EthoVision XT能夠作為一只動(dòng)物檢測(cè)到它們。
為了處理動(dòng)物身體的遮擋 - 如果您使用嚙齒類動(dòng)物的鼻尾跟蹤(基于高級(jí)模型),優(yōu)化“形狀穩(wěn)定性”(請(qǐng)參閱第243頁(yè))。
為了處理兩只動(dòng)物的觸碰 - 當(dāng)兩只動(dòng)物觸碰時(shí),EthoVision失去單獨(dú)形狀。通過(guò)優(yōu)化建模工程(請(qǐng)參閱第243頁(yè)),EthoVision可以確定龐大身體填充中哪部分屬于哪類動(dòng)物。
 
圖8.16 –由EthoVision XT檢測(cè)到的老鼠示例(未經(jīng)任何篩選處理)。
B - 應(yīng)用“侵蝕”篩選器之后的相同動(dòng)物。C – 通過(guò)“侵蝕”消除像素層。D – 當(dāng)應(yīng)用先“侵蝕”和后“膨脹”時(shí)的相同動(dòng)物。E – 先“侵蝕”和后“膨脹”的最終結(jié)果:消除與老鼠尾巴相對(duì)應(yīng)的像素。
 
輪廓侵蝕
通過(guò)設(shè)置受試者的輪廓像素至背景值,Contour erosion(輪廓侵蝕)功能減少受試者面積。在Video(視頻)窗口中,檢測(cè)到的受試者看起來(lái)更小。
為了應(yīng)用“侵蝕”,選擇選項(xiàng)Contour erosion(輪廓侵蝕),并從該列表中選擇需要?jiǎng)h除的像素層厚度,并以像素?cái)?shù)表示(最小值 = 1,最大值 = 10)。
圖8.13A顯示由EthoVision檢測(cè)的受試者(未經(jīng)過(guò)篩選處理)。在應(yīng)用“侵蝕”之后,從輪廓中刪除一層像素(圖8.13B)。圖8.13C顯示已刪除的像素。
 
 
輪廓膨脹
通過(guò)設(shè)置鄰近受試者輪廓的背景像素至受試者值,Contour dilation(輪廓膨脹)功能增加受試者的表面面積。因此,在Video(視頻)窗口中,檢測(cè)到的受試者看起來(lái)更大。
為了應(yīng)用“侵蝕”,選擇選項(xiàng)Contour erosion(輪廓侵蝕),并從該列表中選擇需要?jiǎng)h除的像素層厚度,并以像素?cái)?shù)表示(最小值 = 1,最大值 = 10)。
圖8.13A 顯示由EthoVision XT檢測(cè)的受試者(未經(jīng)過(guò)篩選處理)。在使用“侵蝕”功能消除老鼠尾巴之后(圖8.13B),使用“膨脹”再加回一層像素(圖8.13D),恢復(fù)受試者的初始尺寸。
 
 
結(jié)合“膨脹”和“侵蝕”
如果您需要共同應(yīng)用這兩個(gè)篩選器,請(qǐng)同時(shí)選擇Dilation(膨脹)和Erosion(侵蝕)。從Order(命令)列表中,選擇下面選項(xiàng)之一:
Erode first, then dilate –首先刪除一層像素,然后添加到輪廓。
Dilate first, then erode – 首先增加一層像素,然后刪除。
 
 
當(dāng)您使用基于模型(XT 5)或基于高級(jí)模型(XT 6)的鼻尾跟蹤法時(shí),應(yīng)使用選項(xiàng)“Dilate first, then erode”(先膨脹,再侵蝕),因?yàn)檫@種情形下,尾巴能夠?qū)Ω櫘a(chǎn)生負(fù)面影響。當(dāng)您使用基于形狀的(XT4)方法時(shí),確保作為受試者中一部分完全檢測(cè)到尾巴。
 
8.8 受試者尺寸設(shè)置
 
 
 
受試者的尺寸
 
在設(shè)定受試者尺寸之前,確保所有動(dòng)物身體輪廓均獲得正確檢測(cè),在多只動(dòng)物的情形下,動(dòng)物不得相互觸碰。
如果您已在“試驗(yàn)設(shè)置”中選擇Behavior recognition(行為識(shí)別),請(qǐng)參閱第246頁(yè)。
 
受試者尺寸設(shè)置使用身體檢測(cè)結(jié)果以建模動(dòng)物身體的尺寸。這可以防止跟蹤期間檢測(cè)諸如糞便類物體或大型反射體。請(qǐng)注意:其中術(shù)語(yǔ)“尺寸”即指視頻像素中的表面積,而并非長(zhǎng)度或屏幕像素。Video(視頻)窗口放大不會(huì)改變視頻像素中受試者的尺寸。
 
 
為單只動(dòng)物設(shè)置受試者尺寸
當(dāng)您需要使用基于形狀(XT4)或基于模型(XT5)的檢測(cè)方法執(zhí)行中心點(diǎn)檢測(cè)或鼻尾檢測(cè)時(shí),使用最小和最大受試者尺寸設(shè)置檢測(cè)到的受試者尺寸。檢測(cè)到的受試者尺寸設(shè)置可能作為受試者檢測(cè)到的尺寸絕對(duì)限度。
當(dāng)您需要使用基于高級(jí)模型(XT6)的檢測(cè)方法進(jìn)行鼻尾檢測(cè)時(shí),設(shè)置建模的受試者尺寸。建模的受試者尺寸即模型尺寸,在該情形下程序?qū)L試適應(yīng)檢測(cè)到的受試者。
 
 
為多只動(dòng)物設(shè)置受試者的尺寸
當(dāng)您需要跟蹤多只動(dòng)物時(shí),設(shè)置建模的受試者尺寸。為了設(shè)置受試者尺寸:
1. 在Subject size(受試者尺寸)部分中,點(diǎn)擊Edit(編輯)按鈕。
在Subject Size(受試者尺寸)窗口中,上方圖中紅色細(xì)輪廓代表EthoVision XT所假設(shè)的動(dòng)物形狀目前尺寸。
→如果您希望設(shè)置Detected subject size(檢測(cè)到的受試者尺寸),請(qǐng)繼續(xù)第2步。
→如果您希望設(shè)置Modeled subject size(模型受試者尺寸),請(qǐng)繼續(xù)第3步。
 
如需了解受試者尺寸設(shè)置相關(guān)更多信息,點(diǎn)擊“信息”按鈕。
 
2. 設(shè)置受試者的最小和最大尺寸(用綠色輪廓表示):
- 最大受試者尺寸 – 可作為受試者檢測(cè)到的最大表面積(像素)。當(dāng)物體比最大受試者尺寸更大時(shí)(例如:試驗(yàn)員的手臂),將作為干擾檢測(cè)這類物體,且不予以跟蹤。減少最大受試者尺寸,直至其綠色粗輪廓通過(guò)一條均勻邊緣圍繞紅色細(xì)輪廓。
- 最小受試者尺寸 – 可作為受試者檢測(cè)到的最小表面積(像素)。當(dāng)物體比最小受試者尺寸更小時(shí)(如糞便或不規(guī)則的鋸屑),將作為干擾檢測(cè)這類物體,且不予以跟蹤。增加最小受試者尺寸,直至其綠色粗輪廓比紅色細(xì)輪廓小一條均勻邊緣。
兩個(gè)滑動(dòng)條相互依存。因此,在您已設(shè)定最小受試者尺寸之后,當(dāng)您下一步改變最大受試者尺寸時(shí),“最小受試者尺寸”用滑動(dòng)條也會(huì)移動(dòng)(盡管像素尺寸依然保持不變)。
 
 
圖8.17 - Subject size(受試者尺寸)窗口,其中包含目前檢測(cè)到的受試者尺寸、“最小受試者尺寸”和“最大受試者尺寸”。
 
3. 在Modeled subject size(建模的受試者尺寸)組中,如果多只動(dòng)物具有相似尺寸,請(qǐng)選擇選項(xiàng)Apply settings to all subjects(應(yīng)用設(shè)置到所有受試者)。
當(dāng)您使用多個(gè)受試者或基于高級(jí)模型(XT6)的鼻尾檢測(cè)時(shí),僅建模的受試者尺寸設(shè)置有效。
4. 通過(guò)點(diǎn)擊受試者名稱,選擇一個(gè)受試者以建模受試者尺寸。
5. 其后,調(diào)整建模的受試者尺寸至已檢測(cè)到的受試者尺寸(在目前像素下):
您可以通過(guò)點(diǎn)擊Grab(捕捉)按鈕執(zhí)行此操作。繼續(xù)點(diǎn)擊Grab(捕捉)按鈕,直至建模的(平均)受試者尺寸等于已檢測(cè)的(目前)受試者尺寸。
 
圖8.18 - Subject size(受試者尺寸)窗口(左)和Video(視頻)窗口中建模的受試者尺寸組部分。在該表中,Current(目前)選項(xiàng)顯示目前檢測(cè)到的受試者尺寸(像素),Average(平均)選項(xiàng)顯示建模的受試者尺寸(像素)。箭頭指向視覺(jué)反饋,以便您獲得Video(視頻)窗口中的目前與平均受試者尺寸。
 
當(dāng)建模的(平均)受試者尺寸等于已檢測(cè)到的(目前)受試者尺寸時(shí),其變?yōu)榭梢?jiàn):
- 在建模的受試者尺寸組中:“平均”受試者尺寸等于或大于“目前”受試者尺寸(請(qǐng)參閱圖8.16中表格)。
- 在Video(視頻)窗口中:建模的受試者尺寸完全與目前受試者尺寸重疊(請(qǐng)參閱圖8.16中的“視頻”窗口)。
 
- 在Subject size(受試者尺寸)窗口頂部畫面中:粗黃色輪廓代表建模的受試者尺寸。這與由紅色細(xì)輪廓標(biāo)示的已檢測(cè)到的受試者尺寸相一致(請(qǐng)參閱圖8.14)。
 
 
圖8.19 - Subject size(受試者尺寸)窗口(左)和Video(視頻)窗口中建模的受試者尺寸組部分�,F(xiàn)在,建模的(平均)受試者尺寸調(diào)整到已檢測(cè)到(目前)的受試者尺寸。將該圖與圖8.15中的表格和“視頻”窗口進(jìn)行比較
 
6. 現(xiàn)在,您可以設(shè)置Tolerance(公差)。點(diǎn)擊相應(yīng)單元格,然后輸入一個(gè)值。
“公差”決定平均受試者尺寸的偏差。當(dāng)目前檢測(cè)到的尺寸與平均受試者尺寸之間的偏差超過(guò)“公差”時(shí),該物體將不再視為受試者,并且EthoVision開始對(duì)動(dòng)物身體輪廓執(zhí)行一次有根據(jù)的統(tǒng)計(jì)猜測(cè)。
通過(guò)擺動(dòng)標(biāo)記-顏色區(qū)域,可以在“視頻”窗口中看到這種情形。當(dāng)發(fā)生這種情形時(shí),且動(dòng)物未互相觸碰,您應(yīng)增加“公差”。
7. 為各受試者選擇Fix復(fù)選框。
8. 現(xiàn)在,您可以繼續(xù)設(shè)置最大干擾尺寸、形狀穩(wěn)定性和建模工作。
 
 
設(shè)置受試者尺寸的技巧
確保您沒(méi)有設(shè)置過(guò)小“公差”,得到錯(cuò)誤的身體尺寸/形狀總比得到錯(cuò)誤的動(dòng)物位置要好。
尤其當(dāng)您進(jìn)行鼻尾跟蹤時(shí),最好設(shè)置平均受試者尺寸稍微大于實(shí)際受試者尺寸。
如果您需要對(duì)具有相似尺寸的多只動(dòng)物進(jìn)行實(shí)況跟蹤,建議您首先將動(dòng)物引入該區(qū)域內(nèi),然后再為該動(dòng)物進(jìn)行受試者尺寸的設(shè)置。
如果試驗(yàn)之間受試者尺寸具有很大變化,建議您為此新尺寸創(chuàng)建新的“檢測(cè)設(shè)置”。
 
8.9 使用鼻-尾基檢測(cè)開展工作
 
概述
當(dāng)您為鼻尾基檢測(cè)設(shè)置一次試驗(yàn)時(shí),EthoVision XT分析各樣本處作為受試者檢測(cè)到的區(qū)域輪廓,并分配鼻尖點(diǎn)和尾基給輪廓中兩個(gè)特定像素。此外,其決定動(dòng)物相對(duì)于某點(diǎn)的方向(頭部方向)。
鼻尖和尾基點(diǎn)- 通過(guò)兩個(gè)復(fù)雜算法之一單獨(dú)檢測(cè)這兩個(gè)點(diǎn)。鼻尖點(diǎn)可在所有情形下發(fā)現(xiàn),但未找到中心點(diǎn)時(shí)除外。如果檢測(cè)狀況良好,在一些情形下可能并不會(huì)找到尾基。
注意:
- 當(dāng)您已升級(jí)到“多體位點(diǎn)模塊”時(shí),您可以使用EthoVision檢測(cè)受試者鼻尖和尾基點(diǎn)。為了做到這一點(diǎn),請(qǐng)升級(jí)您的硬件密鑰(參閱第51頁(yè))。為了設(shè)置一個(gè)試驗(yàn)以執(zhí)行鼻尾基檢測(cè),在Experiment Settings(試驗(yàn)設(shè)置)中,選擇Center-point(中心點(diǎn))、nose-point(鼻尖點(diǎn))和tail-base(尾基)檢測(cè)(請(qǐng)參閱第100頁(yè))。
- 可靠的鼻尖和尾基跟蹤受視頻圖像尺寸限制。如同PhenoTypers組,您可以混合四張攝像機(jī)圖像,并具有良好結(jié)果。對(duì)于可靠的鼻尖和尾基跟蹤,混合16張攝像機(jī)圖像會(huì)使受試者尺寸過(guò)小。
Head direction(頭部方向) - 一旦發(fā)現(xiàn)鼻尖點(diǎn),將沿著與鼻尖點(diǎn)具有特定距離的輪廓確定兩個(gè)點(diǎn)。“頭部方向”為由中心點(diǎn)和額外點(diǎn)所形成的角度等分的直線。
相對(duì)于某個(gè)區(qū)域的“頭部方向”作為一個(gè)因變量定量化,并且以旋轉(zhuǎn)單位表示(請(qǐng)參閱第610頁(yè))。
 
鼻尾檢測(cè)方法
在EthoVision XT中,三種方法可用于尾基檢測(cè):
Shape-based(XT 4) - 該檢測(cè)方法分析在各樣本處作為受試者已檢測(cè)到的區(qū)域輪廓,以分配鼻尖點(diǎn)和尾基。在“檢測(cè)設(shè)置”中執(zhí)行適當(dāng)設(shè)置,確保尾基獲得完全檢測(cè)。當(dāng)使用這種方法時(shí),也許可以跟蹤“非嚙齒類動(dòng)物”的形狀,但該方法預(yù)定用于該用途。
Model-based(XT 5) - 該檢測(cè)方法分析作為受試者已檢測(cè)到的區(qū)域輪廓的不同形狀,并建立一個(gè)“嚙齒類動(dòng)物模型”。
 
這種方法比“基于形狀”方法更穩(wěn)健,因?yàn)樵摲椒ú恍枰羌夂臀不梢?jiàn):根據(jù)以前樣本,可以“預(yù)測(cè)”鼻尖和尾基位置。在“檢測(cè)設(shè)置”中適當(dāng)設(shè)置,確保使用“侵蝕”和“膨脹”從身體輪廓中去除尾基(請(qǐng)參閱第236頁(yè))。
Advanced Model-based(XT 6) - 該檢測(cè)方法指導(dǎo)動(dòng)物形狀以及在開始15幀中如何移動(dòng)動(dòng)物形狀,并不斷更新其統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。因此,該方法可以處理嚴(yán)重的形狀扭曲,例如:當(dāng)遮擋動(dòng)物身體時(shí)或當(dāng)多只動(dòng)物互相碰觸時(shí)。然而,該方法需要出色電腦性能。
當(dāng)使用鼻尾檢測(cè)跟蹤多只動(dòng)物時(shí),僅該方法可用。對(duì)于嚙齒類動(dòng)物,該方法為首選方法。在“檢測(cè)設(shè)置”中適當(dāng)設(shè)置,確保使用“侵蝕”和“膨脹”從身體輪廓中去除尾基(請(qǐng)參閱第236頁(yè))。
 
在這三種方法中,應(yīng)該使用哪一種方法?
當(dāng)您希望跟蹤其他種類動(dòng)物(并非嚙齒類動(dòng)物)時(shí),我們建議您使用基于形狀(XT 4)的方法。
當(dāng)您希望在無(wú)遮擋或無(wú)困難跟蹤條件下跟蹤單只嚙齒類動(dòng)物時(shí),我們建議您使用基于形狀(XT 5)的方法。
當(dāng)您跟蹤可遮擋的嚙齒類動(dòng)物時(shí)(例如:遭受籠子中的籠條或其他物體遮擋),我們建議您使用基于高級(jí)模型的方法,并從視頻文件中執(zhí)行跟蹤。
當(dāng)您希望使用“標(biāo)記輔助跟蹤”方式跟蹤多只嚙齒類動(dòng)物時(shí),EthoVision自動(dòng)選擇基于高級(jí)模型(XT 6)的方法。在這種情形下,我們建議您從視頻文件中執(zhí)行跟蹤。
 
最大干擾尺寸
僅您已選擇基于高級(jí)模型(XT 6)的鼻尾檢測(cè)方法時(shí),最大干擾尺寸方有效。
在Subject size(受試者尺寸)窗口中,設(shè)置最大干擾尺寸:
1. 通過(guò)點(diǎn)擊Subject size(受試者尺寸)窗口右下角處小型向下箭頭,轉(zhuǎn)到Advanced(高級(jí))部分。
2. 設(shè)定最大受試者干擾。該值應(yīng)小于最小受試者尺寸,但應(yīng)足夠大以從視頻圖像中去除干擾。
 
形狀穩(wěn)定性
僅選擇基于高級(jí)模型(XT 6)的鼻尾檢測(cè)方法時(shí),形狀穩(wěn)定性設(shè)置方有效。
當(dāng)您跟蹤身體可由籠條或其他動(dòng)物身體部分遮擋住的動(dòng)物時(shí),應(yīng)使用形狀穩(wěn)定性設(shè)置。當(dāng)這種情形發(fā)生時(shí),動(dòng)物身體由彼此接近的單獨(dú)物體組成。
在Subject size(受試者尺寸)窗口中,設(shè)置形狀穩(wěn)定性:
1. 通過(guò)點(diǎn)擊Subject size(受試者尺寸)窗口右下角處小型向下箭頭,轉(zhuǎn)到Advanced(高級(jí))部分。
2. Shape stability optimized for(形狀穩(wěn)定性優(yōu)化)滑動(dòng)條具有兩個(gè)極端設(shè)置:
- Occlusions(遮擋) - 當(dāng)您設(shè)置滑動(dòng)條靠近Occlusions(遮擋)時(shí),EthoVision將彼此接近的單獨(dú)物體視為動(dòng)物中部分。
- Noise(干擾) - 當(dāng)您設(shè)置滑動(dòng)條靠近Noise(干擾)時(shí),EthoVision視為較小單獨(dú)部分不屬于該動(dòng)物中部分。
下圖顯示應(yīng)用兩個(gè)極端形狀穩(wěn)定性設(shè)置之后所產(chǎn)生的動(dòng)物模型。
 
圖8.20 – 應(yīng)用兩個(gè)極端形狀穩(wěn)定性設(shè)置之后所產(chǎn)生的示例。Noise(干擾)顯示籠條另一側(cè)上動(dòng)物前部,該部分不視為該動(dòng)物中一部分。Occlusion(遮擋)作為一個(gè)整體顯示動(dòng)物。
 
如果您不能確定選擇哪個(gè)設(shè)置,請(qǐng)保留形狀穩(wěn)定性默認(rèn)值(620)。
 
建模工作
當(dāng)兩只動(dòng)物互相觸碰和EthoVision丟失單獨(dú)形狀時(shí),將使用建模工作設(shè)置。此時(shí),EthoVision試圖確定大“合并”身體填充中哪部分屬于哪只動(dòng)物。這會(huì)消耗大量處理器負(fù)荷。
Modeling effort optimized for(建模工作優(yōu)化)滑動(dòng)條具有兩個(gè)極端設(shè)置:
 
Performance(性能) - 當(dāng)您設(shè)置滑動(dòng)條靠近Performance(性能)時(shí),僅允許EthoVision在很短時(shí)間內(nèi)確定“合并”身體填充中哪部分屬于哪只動(dòng)物。因此,建模質(zhì)量低。
Modelling(建模) - 當(dāng)您設(shè)置滑動(dòng)條到Modelling(建模)時(shí),允許EthoVision在較長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)按幀確定“合并”身體填充中哪部分屬于哪只動(dòng)物。因此,建模質(zhì)量良好,然而消耗大量處理器負(fù)荷。
我們建議:僅電腦配置超過(guò)最低系統(tǒng)要求時(shí),選擇選項(xiàng)Modelling(建模)。
當(dāng)您不能確定選擇哪個(gè)設(shè)置時(shí),請(qǐng)保留建模工作默認(rèn)值(500)。
 
如何優(yōu)化鼻尾檢測(cè)
由于鼻尾基檢測(cè)方法需要找出鼻尖點(diǎn)和尾基點(diǎn),因此鼻尾基檢測(cè)非常依賴于視頻圖像質(zhì)量和試驗(yàn)設(shè)置。在使用該功能之前,請(qǐng)檢查下面準(zhǔn)則:
 
 
活動(dòng)場(chǎng)相關(guān)條件
光照度 - 整個(gè)活動(dòng)場(chǎng)內(nèi)光照條件應(yīng)均勻。嘗試刪除陰影、光點(diǎn)和反光。為了正確檢測(cè),受試者身體輪廓應(yīng)盡可能在整個(gè)區(qū)域內(nèi)保持恒定。
受試者/背景對(duì)比度 – 受試者顏色與背景應(yīng)具有足夠?qū)Ρ�,以獲得一個(gè)完整及清晰的身體輪廓。
視頻質(zhì)量 - 干擾和干涉會(huì)降低正確檢測(cè)到的樣本比例。
干擾降低 - Video Pixel smoothing(視頻像素平滑處理)功能(請(qǐng)參閱第214頁(yè))有時(shí)可以幫助您獲得一個(gè)更合適的身體輪廓。然而,如果視頻具有過(guò)多干擾或過(guò)低對(duì)比度,該功能作用不大。
隱藏到攝像機(jī)視圖的區(qū)域 - 當(dāng)動(dòng)物進(jìn)入或退出隱藏到攝像機(jī)(例如:遮蓋物)的區(qū)域時(shí),將錯(cuò)誤分配鼻尖點(diǎn)和尾基。
活動(dòng)場(chǎng)數(shù)量 - 可靠性鼻尖和尾基跟蹤受視頻圖像尺寸限制。如同PhenoTypers組,您可以最多混合四張攝像機(jī)圖像,并具有良好結(jié)果。
 
受試者相關(guān)條件
受試者外觀尺寸 – 受試者必須足夠大,以獲得一個(gè)恒定身體輪廓。當(dāng)使用鼻尖點(diǎn)和尾基點(diǎn)時(shí),小動(dòng)物和大活動(dòng)場(chǎng)將構(gòu)成檢測(cè)問(wèn)題。如同PhenoTypers組,當(dāng)混合多臺(tái)攝像機(jī)(四臺(tái)一組)的圖像時(shí),一組攝像機(jī)(4臺(tái))可給出良好結(jié)果。當(dāng)混合16臺(tái)PhenoTypers時(shí),受試者外觀尺寸通常過(guò)小。
受試者的色彩變化 - 對(duì)于冠鼠,亮側(cè)面與灰暗頭部必須與背景具有鮮明對(duì)比,否則,身體輪廓檢測(cè)欠佳,即使借助使用“差分檢測(cè)法”(請(qǐng)參閱第230頁(yè))。
水迷宮 – 由于尾基處于水下,因此無(wú)法在水迷宮中跟蹤鼻尖點(diǎn)與尾基點(diǎn),并且無(wú)法獲得正確身體輪廓。
受試者的行為 – 很難跟蹤不動(dòng)的動(dòng)物,因?yàn)閯?dòng)物身體輪廓不同于活動(dòng)的動(dòng)物。因此,很難檢測(cè)到鼻尖點(diǎn)。
 
 
試驗(yàn)設(shè)置
檢測(cè)方法 – 如果您使用基于高級(jí)模型(XT 6)的方法,我們建議從視頻文件中執(zhí)行跟蹤。
采樣率 - 盡可能高(25或29.97個(gè)樣本/秒)。當(dāng)組合使用鼻尾跟蹤和“標(biāo)記輔助跟蹤”時(shí),應(yīng)使用12.5或14.98個(gè)樣本/秒的采樣率。
實(shí)況跟蹤 - 當(dāng)跟蹤需要高處理器負(fù)荷時(shí),可能會(huì)導(dǎo)致許多遺漏點(diǎn)。首選從視頻文件中執(zhí)行跟蹤(參閱下文),尤其當(dāng)使用基于高級(jí)模型(XT6)的方法時(shí)。
從視頻文件中執(zhí)行跟蹤 - 保持選中選項(xiàng)Detection Determines speed(檢測(cè)決定速度)。
遺漏尾基點(diǎn) – 尾基點(diǎn)高遺漏百分比表示檢測(cè)質(zhì)量差。該百分比越高,表明鼻尖點(diǎn)未處于正確位置的可能性就越大。為了估算遺漏尾基點(diǎn)的百分比,運(yùn)行一些測(cè)試試驗(yàn),并目測(cè)Sample(樣本)列表(請(qǐng)參閱第12章)。通過(guò)選擇樣本數(shù)作為一個(gè)因變量(例如:鼻尖點(diǎn)速度)的統(tǒng)計(jì)值,您可以進(jìn)行量化。
 
 
在實(shí)踐中...
為了正確檢測(cè)鼻尖點(diǎn)和尾基點(diǎn),作為受試者檢測(cè)到的模糊輪廓至關(guān)重要。如果僅檢測(cè)到受試者中一部分,EthoVision可以互換作為鼻尖點(diǎn)和尾基點(diǎn)分配的像素。 
 
或者,鼻尖點(diǎn)未處于受試者的鼻尖上(為清楚起見(jiàn),鼻尖點(diǎn)與頭部方向一起顯示,如何在屏幕上查看顯示請(qǐng)參閱第250頁(yè))。
 
 
選擇一個(gè)更廣泛的灰度值范圍(請(qǐng)參閱第220頁(yè)或第224頁(yè))或調(diào)節(jié)靈敏度(請(qǐng)參閱第231頁(yè)),以增加作為受試者檢測(cè)到的像素?cái)?shù)量。作為結(jié)果,鼻尖點(diǎn)和尾基點(diǎn)均獲得正確檢測(cè):
 
  當(dāng)您使用基于形狀(XT 4)的方法時(shí),確保完全檢測(cè)到尾基。
當(dāng)您使用基于模型的(XT 5)或基于高級(jí)模型(XT 6)的方法時(shí),請(qǐng)使用“侵蝕”和“膨脹”篩選器,從已檢測(cè)到的受試者中去除尾基(參閱第234頁(yè))。
8.10 老鼠行為識(shí)別用檢測(cè)設(shè)置
 
鼻尾檢測(cè)方法
當(dāng)啟用鼻尾基檢測(cè)時(shí),老鼠行為識(shí)別開始。在Detection Settings(檢測(cè)設(shè)置)窗口中,在Method(方法)選項(xiàng)卡下:
Model-based(XT5)(默認(rèn)) - 在“試驗(yàn)設(shè)置”中,如果您選擇Analysis Options(分析選項(xiàng))下的Rat behavior recognition(老鼠行為識(shí)別)選項(xiàng),將自動(dòng)選擇該選項(xiàng)。
Advanced Model-based(XT6) - 僅活動(dòng)內(nèi)遮擋導(dǎo)致受試者表觀尺寸更小或者使用(XT5)Model-based檢測(cè)方法無(wú)法提供良好結(jié)果時(shí),方使用該選項(xiàng)。
 
采樣率設(shè)置
在Video選項(xiàng)下Detection Settings窗口中,選擇25-31次/秒之間的一個(gè)值作為采樣率。
 
受試者尺寸設(shè)置
在Subject Size選項(xiàng)下Detection Settings窗口中:
1. 點(diǎn)擊“Behavior”按鈕。打開Behavior Recognition Settings窗口。
2. 如果您使用視頻,將視頻播放到一個(gè)幀:
- 受試者正正常行走,并且可以看到部分后肢,如下圖所示。動(dòng)物身體未遭受收縮或拉伸非常重要。
- 可以準(zhǔn)確檢測(cè)鼻和尾基點(diǎn)。
 
圖8.21 - 播放視頻至受試者正常行走,并且可以準(zhǔn)確檢測(cè)鼻尖和尾基點(diǎn)。
如果您跟蹤實(shí)況,等到動(dòng)物表現(xiàn)出上圖中的姿勢(shì)。
3. 在Behavior Recognition Settings窗口中,點(diǎn)擊Grab按鈕。
4. 在Behavior Recognition Settings窗口中,出現(xiàn)一幅靜態(tài)圖像,顯示已檢測(cè)到的受試者輪廓和檢測(cè)到的體位點(diǎn)。
 
圖8.22 - Behavior Settings窗口。
 
您可以在任何時(shí)候更新和抓取圖像:
- 如果您跟蹤視頻文件,將視頻定位到一幀,并點(diǎn)擊Grab。
- 如果您跟蹤實(shí)況,可以等待動(dòng)物出現(xiàn)最佳姿勢(shì),并點(diǎn)擊Grab。EthoVision XT僅存儲(chǔ)您最后一次抓取的圖像。
5. 在Behavior Recognition Settings窗口中,請(qǐng)確保計(jì)算的受試者長(zhǎng)度大于60像素,而Posture指數(shù)介于70 - 90之間。
 
如果受試者長(zhǎng)度小于60像素,將攝像機(jī)移動(dòng)到更接近動(dòng)物的位置,或者使用更高的視頻分辨率。
6. 點(diǎn)擊OK,關(guān)閉Behavior Recognition Settings窗口。
 
Entering specific size values(輸入具體尺寸值) - 如果您知道具體尺寸值(例如:根據(jù)先前試驗(yàn),使用相同動(dòng)物尺寸、攝像機(jī)、燈光-活動(dòng)場(chǎng)距離和相同校準(zhǔn)),點(diǎn)擊Behavior Recognition Settings窗口中的Manual,并在Manual Settings窗口中輸入下面值(闡述請(qǐng)參閱下面圖片):
Subject area(距離單位平方)
Center-nose length(距離單位)
Center-tail length(距離單位)
Posture(70-90之間)。
 
然后點(diǎn)擊OK。Behavior Recognition Settings窗口顯示“No image saved:Size settings were manually set”。
受試者尺寸以“Experiment Settings”中選定單位表示。
在Behavior Recognition Settings窗口中,Subject length值(最小60像素)為Center-nose length與Center-tail length之總和(以像素單位表示)。如果該值低于60,當(dāng)打開數(shù)據(jù)采集屏幕時(shí),將會(huì)出現(xiàn)錯(cuò)誤提示。為了增加受試者長(zhǎng)度,將攝像機(jī)移動(dòng)到更接近動(dòng)物的位置,或者使用更高的視頻分辨率。
 
執(zhí)行尺寸依賴性檢測(cè)設(shè)置
精確行為識(shí)別基于受試者尺寸設(shè)置。由于外觀尺寸隨受試者年齡增大而增大,為了等同起見(jiàn),我們建議您創(chuàng)建特定于某個(gè)年齡階段的檢測(cè)設(shè)置。每個(gè)Detection Settings配置文件僅僅可用于一個(gè)有限時(shí)間段。例如:對(duì)于Wistar老鼠,3-5周齡老鼠用Detection Settings配置文件僅可用大約一周,超過(guò)5周齡的老鼠用Detection Settings配置文件可以用兩周。
受試者尺寸大小差別不能超過(guò)10%。如果出現(xiàn)這種情形,將創(chuàng)建多個(gè)Detection Settings(例如:一個(gè)用于小動(dòng)物,另一個(gè)用于較大動(dòng)物)。
 
 
受試者輪廓設(shè)置
為了達(dá)到最佳效果,建議首先選擇Erode,然后選擇Dilate(詳情請(qǐng)參閱234頁(yè)),從而從檢測(cè)到的身體中移除尾基。
 
警告
在下面情形下,EthoVision XT顯示將顯示一條警告信息:
當(dāng)采樣率設(shè)置低于25或高于31次/秒時(shí)。
受試者長(zhǎng)度小于60像素。
動(dòng)物比活動(dòng)場(chǎng)要大。
8.11 自定義“檢測(cè)設(shè)置”屏幕
 
為了取得最佳受試者檢測(cè),您需要適當(dāng)?shù)胤答伳脑O(shè)置對(duì)檢測(cè)質(zhì)量的影響。EthoVision為您提供一些該目的用統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。
 
自定義檢測(cè)特征
1. 打開Detection Settings(請(qǐng)參閱第197頁(yè))。
2. 點(diǎn)擊組件工具欄上的Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,選擇Track Features。
3. 選擇View,查看您需要的特征。選擇您要查看的特征的顏色和(體位點(diǎn))蹤跡。
- Nose-point – 為了檢驗(yàn)鼻尖獲得正確檢測(cè)(詳情請(qǐng)參閱第241頁(yè))。
- Center-point – 為了檢驗(yàn)受試者中心點(diǎn)獲得正確檢測(cè)。
中心點(diǎn)為一個(gè)點(diǎn),其X和Y坐標(biāo)值為被檢測(cè)受試者的所有像素X和Y坐標(biāo)值的算術(shù)平均值。如需了解如何計(jì)算鼻和尾基點(diǎn)相關(guān)更多信息,請(qǐng)參閱241頁(yè)。
- Tail-base – 為了檢驗(yàn)尾基準(zhǔn)獲得正確檢測(cè)(詳情請(qǐng)參閱第241頁(yè))。
- Head direction – 為了評(píng)估受試者正在嗅的東西。當(dāng)使用新受試者和定向測(cè)試時(shí),尤其需要選擇此選項(xiàng)。
- Body contour – 為了檢驗(yàn)受試者的輪廓(或者應(yīng)發(fā)現(xiàn)的部位)獲得檢測(cè)。
- Body fill – 為了檢驗(yàn)受試者的身體(或身體中部位)獲得檢測(cè)。例如:在一次試驗(yàn)中,為了評(píng)估動(dòng)物流動(dòng)性,測(cè)定動(dòng)物形狀變化非常重要。
如果您沒(méi)有為Body fill選定顏色,身體輪廓將顯示為“干擾”。
- Noise – 為了查看像素是否符合受試者檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)(取決于檢測(cè)方法),但已檢測(cè)到的受試者除外。
我們建議維持“Noise”選項(xiàng)選中。這樣,您就可以看到視頻圖像中哪些部分具有與被檢測(cè)受試者相似的灰度值。
 
- Activity – 為了查看符合活動(dòng)檢測(cè)條件的像素(參閱217頁(yè))。如果您在Experiment Settings中選擇Activity analysis(活動(dòng)性分析),此設(shè)置才可用。
如果您的試驗(yàn)在Experiment Settings中設(shè)置為“僅中心點(diǎn)檢測(cè)”,上面一些選項(xiàng)不可用(參閱第91頁(yè))。
4. 如果您已經(jīng)選擇查看體位點(diǎn)的蹤跡,請(qǐng)選擇需要同時(shí)顯示的樣本數(shù)量。
5. 在Video窗口中,檢查檢測(cè)特征外觀。當(dāng)您對(duì)所選擇的選項(xiàng)滿意時(shí),關(guān)閉Detection Feature窗口。然后,繼續(xù)執(zhí)行下面步驟。
 
如果您正在跟蹤實(shí)況,顯示檢測(cè)特征可以使用較強(qiáng)處理器能力,并降低最大可能性采樣率。
 
查看檢測(cè)統(tǒng)計(jì)
檢測(cè)統(tǒng)計(jì)顯示在Analysis Results and Scoring(分析結(jié)果和評(píng)分)面板中,在默認(rèn)情形下,顯示在屏幕底部。
 
如果Analysis Results and Scoring(分析結(jié)果和評(píng)分)面板中沒(méi)有顯示,點(diǎn)擊組件工具欄上的Show/Hide(顯示/隱藏)按鈕,然后選擇Analysis Results and Scoring(分析結(jié)果和評(píng)分)。
在Detection Settings中,選項(xiàng)Independent Variables、Dependent Variables和Manual Scoring未顯示反饋,但您獲得跟蹤時(shí)將顯示反饋。
 
當(dāng)您更改檢測(cè)設(shè)置時(shí),Trial Status選項(xiàng)卡將立即顯示反饋。
 
 
檢測(cè)統(tǒng)計(jì)
Missed samples - 由于處理器時(shí)間不夠而遺漏的樣本百分比和數(shù)量。該信息可用于檢驗(yàn)?zāi)碾娔X是否能夠處理指定采樣率(參閱第208頁(yè))。如需了解如何增加電腦能夠處理的最大采樣率的技巧,請(qǐng)參閱第212頁(yè)。當(dāng)您選擇另一個(gè)視頻文件時(shí),或點(diǎn)擊Detection Settings窗口中的Save changes、Missed samples值將復(fù)位到零。
 
 
Subject not found - 未找到受試者樣本的百分比和數(shù)量。該信息可用于全面檢查檢測(cè)質(zhì)量。如果未發(fā)現(xiàn)一個(gè)受試者,意味著EthoVision XT已處理該圖像,但沒(méi)有找到任何匹配目前Detection Settings的內(nèi)容。使用Subject not found,以評(píng)估跟蹤質(zhì)量。當(dāng)您選擇另一個(gè)視頻文件,或點(diǎn)擊Save changes時(shí),Subject not found的值將復(fù)位到零。
 
 
報(bào)警閾值
遺漏樣本和未找到受試者樣本的百分比通常顯示為綠色,適用于每個(gè)活動(dòng)場(chǎng)和受試者。當(dāng)這些數(shù)值高于設(shè)定閾值時(shí),這些數(shù)值將以紅色突出顯示。
 
 
為了更改閾值,點(diǎn)擊Missed samples或Subject not found下方按鈕,并修改上述“Missed samples”旁邊的數(shù)值。
 
在采集完成后,您可以在該軟件不同部分中查看遺漏樣本和未發(fā)現(xiàn)受試者樣本的比例。
在Trial list中,點(diǎn)擊工具欄上Show/Hide(顯示/隱藏),選擇Variables,并選擇Missed samples和/或Subject not found。
在Statistics and Charts屏幕上,點(diǎn)擊工具欄上Show/Hide(顯示/隱藏),選擇Independent Variables,并選擇Missed samples和/或Subject not found。
在Track Visualization或Heatmaps屏幕上,點(diǎn)擊工具欄上的Show/Hide(顯示/隱藏),然后選擇Layout。在Available下面,拖動(dòng)Missed samples和/或Subject not found到On Columns(對(duì)列)或On Rows(對(duì)行)對(duì)話框。

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